MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Xanthomonas campestris pv. campestris str. B100 chromosome

Total Repeats: 14804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010688	CCCG	2	8	45	52	0 %	0 %	25 %	75 %	188989397
2	NC_010688	CGGC	2	8	476	483	0 %	0 %	50 %	50 %	188989397
3	NC_010688	CGCA	2	8	658	665	25 %	0 %	25 %	50 %	188989397
4	NC_010688	TGCG	2	8	1025	1032	0 %	25 %	50 %	25 %	188989397
5	NC_010688	GCCG	2	8	1213	1220	0 %	0 %	50 %	50 %	188989397
6	NC_010688	GACC	2	8	1742	1749	25 %	0 %	25 %	50 %	188989398
7	NC_010688	CCTG	2	8	1844	1851	0 %	25 %	25 %	50 %	188989398
8	NC_010688	TGCG	2	8	2392	2399	0 %	25 %	50 %	25 %	188989398
9	NC_010688	CGAA	2	8	2425	2432	50 %	0 %	25 %	25 %	188989398
10	NC_010688	TGCC	2	8	2802	2809	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010688	CGCA	2	8	2917	2924	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_010688	TGGC	2	8	3009	3016	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_010688	CGAT	2	8	3606	3613	25 %	25 %	25 %	25 %	188989399
14	NC_010688	TCCA	2	8	3630	3637	25 %	25 %	0 %	50 %	188989399
15	NC_010688	CCAG	2	8	3672	3679	25 %	0 %	25 %	50 %	188989399
16	NC_010688	GCCT	2	8	4467	4474	0 %	25 %	25 %	50 %	188989399
17	NC_010688	CGTG	2	8	4801	4808	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010688	CGAA	2	8	5954	5961	50 %	0 %	25 %	25 %	188989400
19	NC_010688	GATC	2	8	6687	6694	25 %	25 %	25 %	25 %	188989400
20	NC_010688	GCAG	2	8	6759	6766	25 %	0 %	50 %	25 %	188989400
21	NC_010688	CGTG	2	8	7522	7529	0 %	25 %	50 %	25 %	188989401
22	NC_010688	CGCC	2	8	7665	7672	0 %	0 %	25 %	75 %	188989401
23	NC_010688	GCCT	2	8	7882	7889	0 %	25 %	25 %	50 %	188989401
24	NC_010688	TGAA	2	8	8239	8246	50 %	25 %	25 %	0 %	188989402
25	NC_010688	GCAA	2	8	8417	8424	50 %	0 %	25 %	25 %	188989402
26	NC_010688	CCAC	2	8	8936	8943	25 %	0 %	0 %	75 %	188989402
27	NC_010688	GGCC	2	8	9510	9517	0 %	0 %	50 %	50 %	188989403
28	NC_010688	ACCT	2	8	10153	10160	25 %	25 %	0 %	50 %	188989403
29	NC_010688	GCCG	2	8	10983	10990	0 %	0 %	50 %	50 %	188989404
30	NC_010688	GTCG	2	8	11064	11071	0 %	25 %	50 %	25 %	188989404
31	NC_010688	CGGC	2	8	11225	11232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010688	GGTG	2	8	11890	11897	0 %	25 %	75 %	0 %	188989405
33	NC_010688	GAAG	2	8	12260	12267	50 %	0 %	50 %	0 %	188989406
34	NC_010688	GCAA	2	8	13282	13289	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010688	CGTG	2	8	13548	13555	0 %	25 %	50 %	25 %	188989408
36	NC_010688	GATG	2	8	13729	13736	25 %	25 %	50 %	0 %	188989408
37	NC_010688	CATC	2	8	13792	13799	25 %	25 %	0 %	50 %	188989408
38	NC_010688	GACG	2	8	14561	14568	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010688	CGGT	2	8	14667	14674	0 %	25 %	50 %	25 %	188989410
40	NC_010688	GGCC	2	8	14802	14809	0 %	0 %	50 %	50 %	188989410
41	NC_010688	CATG	2	8	15186	15193	25 %	25 %	25 %	25 %	188989410
42	NC_010688	TGCG	2	8	15523	15530	0 %	25 %	50 %	25 %	188989411
43	NC_010688	CGGC	2	8	15796	15803	0 %	0 %	50 %	50 %	188989412
44	NC_010688	ACGC	2	8	16015	16022	25 %	0 %	25 %	50 %	188989412
45	NC_010688	GCCC	2	8	16113	16120	0 %	0 %	25 %	75 %	188989412
46	NC_010688	CCAG	2	8	16179	16186	25 %	0 %	25 %	50 %	188989412
47	NC_010688	GTTC	2	8	16455	16462	0 %	50 %	25 %	25 %	188989412
48	NC_010688	GTGC	2	8	16528	16535	0 %	25 %	50 %	25 %	188989412
49	NC_010688	TGGG	2	8	16574	16581	0 %	25 %	75 %	0 %	188989412
50	NC_010688	GCCG	2	8	16603	16610	0 %	0 %	50 %	50 %	188989412
51	NC_010688	CATC	2	8	16659	16666	25 %	25 %	0 %	50 %	188989412
52	NC_010688	CCGC	2	8	16954	16961	0 %	0 %	25 %	75 %	188989412
53	NC_010688	GCCA	2	8	17162	17169	25 %	0 %	25 %	50 %	188989412
54	NC_010688	GCAG	2	8	17393	17400	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_010688	TGGC	2	8	17567	17574	0 %	25 %	50 %	25 %	188989413
56	NC_010688	GGTG	2	8	18762	18769	0 %	25 %	75 %	0 %	188989414
57	NC_010688	GCAG	2	8	19002	19009	25 %	0 %	50 %	25 %	188989414
58	NC_010688	CGTG	2	8	19741	19748	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_010688	GACG	2	8	20163	20170	25 %	0 %	50 %	25 %	188989415
60	NC_010688	GCCG	2	8	21176	21183	0 %	0 %	50 %	50 %	188989415
61	NC_010688	GGGT	2	8	21546	21553	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010688	CTGG	2	8	21658	21665	0 %	25 %	50 %	25 %	188989416
63	NC_010688	GCCG	2	8	21874	21881	0 %	0 %	50 %	50 %	188989416
64	NC_010688	ATTC	2	8	22087	22094	25 %	50 %	0 %	25 %	188989416
65	NC_010688	GCCG	2	8	22939	22946	0 %	0 %	50 %	50 %	188989418
66	NC_010688	CGGG	2	8	23119	23126	0 %	0 %	75 %	25 %	188989418
67	NC_010688	GCCG	2	8	23384	23391	0 %	0 %	50 %	50 %	188989418
68	NC_010688	CGGC	2	8	23925	23932	0 %	0 %	50 %	50 %	188989419
69	NC_010688	ATCG	2	8	23966	23973	25 %	25 %	25 %	25 %	188989419
70	NC_010688	GTGC	2	8	24001	24008	0 %	25 %	50 %	25 %	188989419
71	NC_010688	AGTG	2	8	24259	24266	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010688	CGGC	2	8	24584	24591	0 %	0 %	50 %	50 %	188989420
73	NC_010688	GGCG	3	12	24660	24671	0 %	0 %	75 %	25 %	188989420
74	NC_010688	GCGG	2	8	24741	24748	0 %	0 %	75 %	25 %	188989420
75	NC_010688	CACG	2	8	25526	25533	25 %	0 %	25 %	50 %	188989420
76	NC_010688	CGCC	2	8	25628	25635	0 %	0 %	25 %	75 %	188989420
77	NC_010688	CTGG	2	8	26099	26106	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_010688	GGCG	2	8	26329	26336	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
79	NC_010688	CACC	2	8	26396	26403	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
80	NC_010688	CAGC	2	8	26470	26477	25 %	0 %	25 %	50 %	188989421
81	NC_010688	CTGG	2	8	26490	26497	0 %	25 %	50 %	25 %	188989421
82	NC_010688	GCCC	2	8	26538	26545	0 %	0 %	25 %	75 %	188989421
83	NC_010688	GCGT	2	8	27247	27254	0 %	25 %	50 %	25 %	188989421
84	NC_010688	CGTG	2	8	27447	27454	0 %	25 %	50 %	25 %	188989421
85	NC_010688	GCCA	2	8	27683	27690	25 %	0 %	25 %	50 %	188989421
86	NC_010688	CAGG	2	8	27767	27774	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_010688	ACGT	2	8	28285	28292	25 %	25 %	25 %	25 %	188989422
88	NC_010688	GCCG	2	8	30060	30067	0 %	0 %	50 %	50 %	188989423
89	NC_010688	CGCC	2	8	30627	30634	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
90	NC_010688	AGTG	2	8	31068	31075	25 %	25 %	50 %	0 %	188989424
91	NC_010688	AGCA	2	8	31393	31400	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_010688	ACGC	2	8	31851	31858	25 %	0 %	25 %	50 %	188989425
93	NC_010688	TGCC	2	8	32094	32101	0 %	25 %	25 %	50 %	188989425
94	NC_010688	TCAT	2	8	32144	32151	25 %	50 %	0 %	25 %	188989425
95	NC_010688	CCCA	2	8	32239	32246	25 %	0 %	0 %	75 %	188989425
96	NC_010688	CGTT	2	8	32696	32703	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_010688	CAAA	2	8	32786	32793	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_010688	TGCG	2	8	32996	33003	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_010688	TGGT	2	8	33191	33198	0 %	50 %	50 %	0 %	188989426
100	NC_010688	AGCC	2	8	33296	33303	25 %	0 %	25 %	50 %	188989426
101	NC_010688	ATTG	2	8	33750	33757	25 %	50 %	25 %	0 %	188989426
102	NC_010688	CTGC	2	8	33777	33784	0 %	25 %	25 %	50 %	188989426
103	NC_010688	TTGC	2	8	33874	33881	0 %	50 %	25 %	25 %	188989426
104	NC_010688	TGCA	2	8	34412	34419	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_010688	GACA	2	8	34542	34549	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_010688	CAGG	2	8	34621	34628	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_010688	GCCT	2	8	34689	34696	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_010688	GCTC	2	8	34752	34759	0 %	25 %	25 %	50 %	188989427
109	NC_010688	GCCG	2	8	34837	34844	0 %	0 %	50 %	50 %	188989427
110	NC_010688	GCGG	2	8	36074	36081	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
111	NC_010688	CGCA	2	8	36247	36254	25 %	0 %	25 %	50 %	188989428
112	NC_010688	ATCT	2	8	37258	37265	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_010688	TAGC	2	8	37324	37331	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_010688	CAAG	2	8	37818	37825	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_010688	AGCC	2	8	37852	37859	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_010688	AAGT	2	8	38125	38132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010688	GCCA	2	8	38372	38379	25 %	0 %	25 %	50 %	188989431
118	NC_010688	CGCA	2	8	38806	38813	25 %	0 %	25 %	50 %	188989432
119	NC_010688	CGAC	2	8	39098	39105	25 %	0 %	25 %	50 %	188989432
120	NC_010688	CGGC	2	8	39336	39343	0 %	0 %	50 %	50 %	188989432
121	NC_010688	GCTT	2	8	40162	40169	0 %	50 %	25 %	25 %	188989432
122	NC_010688	CCAG	2	8	40359	40366	25 %	0 %	25 %	50 %	188989433
123	NC_010688	CAGG	2	8	40753	40760	25 %	0 %	50 %	25 %	188989433
124	NC_010688	GCCG	2	8	40824	40831	0 %	0 %	50 %	50 %	188989433
125	NC_010688	CGGT	2	8	41018	41025	0 %	25 %	50 %	25 %	188989433
126	NC_010688	ACGC	2	8	41263	41270	25 %	0 %	25 %	50 %	188989433
127	NC_010688	TCGA	2	8	41801	41808	25 %	25 %	25 %	25 %	188989433
128	NC_010688	GCCC	2	8	42078	42085	0 %	0 %	25 %	75 %	188989433
129	NC_010688	GGCC	2	8	42969	42976	0 %	0 %	50 %	50 %	188989433
130	NC_010688	GCTG	2	8	43065	43072	0 %	25 %	50 %	25 %	188989433
131	NC_010688	AGGT	2	8	43439	43446	25 %	25 %	50 %	0 %	188989433
132	NC_010688	GATC	2	8	43536	43543	25 %	25 %	25 %	25 %	188989433
133	NC_010688	CGGC	2	8	43590	43597	0 %	0 %	50 %	50 %	188989433
134	NC_010688	GCCG	2	8	43723	43730	0 %	0 %	50 %	50 %	188989433
135	NC_010688	CATG	2	8	43908	43915	25 %	25 %	25 %	25 %	188989433
136	NC_010688	GCCG	2	8	44482	44489	0 %	0 %	50 %	50 %	188989433
137	NC_010688	TTGC	2	8	45413	45420	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_010688	CGGC	2	8	45647	45654	0 %	0 %	50 %	50 %	188989435
139	NC_010688	GCTG	2	8	46035	46042	0 %	25 %	50 %	25 %	188989435
140	NC_010688	AGCC	2	8	46691	46698	25 %	0 %	25 %	50 %	188989435
141	NC_010688	GGTA	2	8	46912	46919	25 %	25 %	50 %	0 %	188989436
142	NC_010688	CGCC	2	8	47136	47143	0 %	0 %	25 %	75 %	188989436
143	NC_010688	CATC	2	8	47176	47183	25 %	25 %	0 %	50 %	188989436
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