MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12J plasmid pRPIC01

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010683	GCACTT	2	12	7025	7036	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	187930836
2	NC_010683	ATCCGA	2	12	7461	7472	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	187930836
3	NC_010683	CCTTGG	2	12	9767	9778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930838
4	NC_010683	CCCGTT	2	12	14869	14880	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	187930841
5	NC_010683	AGCGCT	2	12	17754	17765	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	187930845
6	NC_010683	CCCGAG	2	12	18427	18438	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	187930845
7	NC_010683	TCGACA	2	12	19093	19104	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	187930846
8	NC_010683	GCGGCA	2	12	20998	21009	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	187930847
9	NC_010683	TGACGG	2	12	21224	21235	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	187930848
10	NC_010683	CAGGTT	2	12	22707	22718	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	187930850
11	NC_010683	TGGCAA	2	12	26609	26620	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	187930853
12	NC_010683	CCATGG	2	12	27062	27073	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	187930853
13	NC_010683	ATGCCC	2	12	32191	32202	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	187930858
14	NC_010683	GCACAC	2	12	32243	32254	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	187930858
15	NC_010683	TCTTCG	2	12	36699	36710	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	187930860
16	NC_010683	GCCGAC	2	12	40118	40129	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	187930862
17	NC_010683	GCACCA	2	12	42042	42053	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	187930865
18	NC_010683	AGCAAC	2	12	43388	43399	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	187930865
19	NC_010683	CCCGGT	2	12	44348	44359	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	187930867
20	NC_010683	GACGGT	2	12	45144	45155	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	187930867
21	NC_010683	TCGGTG	2	12	48521	48532	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	187930869
22	NC_010683	GGGTGC	2	12	48535	48546	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	187930869
23	NC_010683	GGCGCA	2	12	48876	48887	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	187930869
24	NC_010683	AGCTGA	2	12	50282	50293	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	187930871
25	NC_010683	GACGGT	2	12	52181	52192	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	187930876
26	NC_010683	CCGGCT	2	12	53718	53729	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	187930879
27	NC_010683	TCTGGC	2	12	55163	55174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930881
28	NC_010683	ATCGGA	2	12	56505	56516	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	187930882
29	NC_010683	GGGCGA	2	12	57620	57631	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	187930884
30	NC_010683	ACTGGT	2	12	61908	61919	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	187930887
31	NC_010683	CCTTGT	2	12	65453	65464	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	187930893
32	NC_010683	CGTGGC	2	12	69991	70002	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	187930900
33	NC_010683	CACGGC	2	12	70661	70672	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	187930901
34	NC_010683	CGCGCA	2	12	71835	71846	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	187930902
35	NC_010683	CGCGTC	2	12	72124	72135	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	187930902
36	NC_010683	CATCGA	2	12	72736	72747	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	187930902
37	NC_010683	GCCTGG	2	12	73154	73165	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	187930902
38	NC_010683	AGCGCT	2	12	79557	79568	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	187930910

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.