MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12J plasmid pRPIC01

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010683	CGGCC	2	10	1793	1802	0 %	0 %	40 %	60 %	187930827
2	NC_010683	GCAAA	2	10	5054	5063	60 %	0 %	20 %	20 %	187930831
3	NC_010683	ACTCA	2	10	6159	6168	40 %	20 %	0 %	40 %	187930835
4	NC_010683	GAAGG	2	10	8512	8521	40 %	0 %	60 %	0 %	187930837
5	NC_010683	CTGGT	2	10	8730	8739	0 %	40 %	40 %	20 %	187930837
6	NC_010683	GTAGG	2	10	9997	10006	20 %	20 %	60 %	0 %	187930839
7	NC_010683	GGCAA	2	10	12593	12602	40 %	0 %	40 %	20 %	187930840
8	NC_010683	CCGTG	2	10	12684	12693	0 %	20 %	40 %	40 %	187930840
9	NC_010683	TTGTG	2	10	12732	12741	0 %	60 %	40 %	0 %	187930840
10	NC_010683	CGAAG	2	10	13300	13309	40 %	0 %	40 %	20 %	187930840
11	NC_010683	ATGGC	2	10	16054	16063	20 %	20 %	40 %	20 %	187930843
12	NC_010683	CGCGC	2	10	16945	16954	0 %	0 %	40 %	60 %	187930844
13	NC_010683	AAATC	2	10	20142	20151	60 %	20 %	0 %	20 %	187930847
14	NC_010683	GCCGC	2	10	20682	20691	0 %	0 %	40 %	60 %	187930847
15	NC_010683	TCGAC	2	10	27456	27465	20 %	20 %	20 %	40 %	187930854
16	NC_010683	GTCTG	2	10	28467	28476	0 %	40 %	40 %	20 %	187930855
17	NC_010683	TTCGA	2	10	31337	31346	20 %	40 %	20 %	20 %	187930857
18	NC_010683	CCACC	2	10	34719	34728	20 %	0 %	0 %	80 %	187930860
19	NC_010683	TCTGC	2	10	36222	36231	0 %	40 %	20 %	40 %	187930860
20	NC_010683	CGCGC	2	10	37632	37641	0 %	0 %	40 %	60 %	187930861
21	NC_010683	GCCGT	2	10	37997	38006	0 %	20 %	40 %	40 %	187930861
22	NC_010683	CAGCC	2	10	39254	39263	20 %	0 %	20 %	60 %	187930862
23	NC_010683	TCCAC	2	10	44993	45002	20 %	20 %	0 %	60 %	187930867
24	NC_010683	AGCTG	2	10	45694	45703	20 %	20 %	40 %	20 %	187930867
25	NC_010683	GTTGC	2	10	48230	48239	0 %	40 %	40 %	20 %	187930868
26	NC_010683	GCCCG	2	10	49697	49706	0 %	0 %	40 %	60 %	187930870
27	NC_010683	AAGCG	2	10	49707	49716	40 %	0 %	40 %	20 %	187930870
28	NC_010683	GTTTG	2	10	50556	50565	0 %	60 %	40 %	0 %	187930872
29	NC_010683	CAGCG	2	10	51531	51540	20 %	0 %	40 %	40 %	187930875
30	NC_010683	GCGTG	2	10	52732	52741	0 %	20 %	60 %	20 %	187930878
31	NC_010683	TTGAG	2	10	53231	53240	20 %	40 %	40 %	0 %	187930879
32	NC_010683	GCGTC	2	10	56125	56134	0 %	20 %	40 %	40 %	187930882
33	NC_010683	TTGGA	2	10	59134	59143	20 %	40 %	40 %	0 %	187930886
34	NC_010683	GTGAT	2	10	61745	61754	20 %	40 %	40 %	0 %	187930887
35	NC_010683	GATAG	2	10	62185	62194	40 %	20 %	40 %	0 %	187930887
36	NC_010683	GACAC	2	10	65925	65934	40 %	0 %	20 %	40 %	187930895
37	NC_010683	GCCGT	2	10	66295	66304	0 %	20 %	40 %	40 %	187930896
38	NC_010683	CGCAG	2	10	68141	68150	20 %	0 %	40 %	40 %	187930897
39	NC_010683	TGCGC	2	10	71955	71964	0 %	20 %	40 %	40 %	187930902
40	NC_010683	GCGCC	2	10	73391	73400	0 %	0 %	40 %	60 %	187930903
41	NC_010683	GCGTC	2	10	75639	75648	0 %	20 %	40 %	40 %	187930905
42	NC_010683	ACCGA	2	10	76022	76031	40 %	0 %	20 %	40 %	187930905
43	NC_010683	CGGAT	2	10	76102	76111	20 %	20 %	40 %	20 %	187930905
44	NC_010683	GCGCG	2	10	77000	77009	0 %	0 %	60 %	40 %	187930906
45	NC_010683	CATTC	2	10	77063	77072	20 %	40 %	0 %	40 %	187930906
46	NC_010683	TCGAC	2	10	78999	79008	20 %	20 %	20 %	40 %	187930909
47	NC_010683	GCGGG	2	10	79047	79056	0 %	0 %	80 %	20 %	187930909
48	NC_010683	TTGAG	2	10	80655	80664	20 %	40 %	40 %	0 %	187930912

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.