MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Ralstonia pickettii 12J plasmid pRPIC01

Total Repeats: 221

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010683	GCCT	2	8	139	146	0 %	25 %	25 %	50 %	187930823
2	NC_010683	GCAG	2	8	205	212	25 %	0 %	50 %	25 %	187930823
3	NC_010683	GCTC	2	8	915	922	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_010683	GCCA	2	8	1202	1209	25 %	0 %	25 %	50 %	187930826
5	NC_010683	TGCG	2	8	1489	1496	0 %	25 %	50 %	25 %	187930827
6	NC_010683	TGCC	2	8	1885	1892	0 %	25 %	25 %	50 %	187930827
7	NC_010683	GCCG	2	8	1923	1930	0 %	0 %	50 %	50 %	187930827
8	NC_010683	CGCA	2	8	2240	2247	25 %	0 %	25 %	50 %	187930827
9	NC_010683	CGAG	2	8	3436	3443	25 %	0 %	50 %	25 %	187930828
10	NC_010683	CACC	2	8	3649	3656	25 %	0 %	0 %	75 %	187930828
11	NC_010683	CCGT	2	8	4385	4392	0 %	25 %	25 %	50 %	187930830
12	NC_010683	CAAG	2	8	4612	4619	50 %	0 %	25 %	25 %	187930830
13	NC_010683	GTTC	2	8	4781	4788	0 %	50 %	25 %	25 %	187930831
14	NC_010683	TCTA	2	8	5208	5215	25 %	50 %	0 %	25 %	187930832
15	NC_010683	CGGC	2	8	5439	5446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_010683	AGCT	2	8	5815	5822	25 %	25 %	25 %	25 %	187930834
17	NC_010683	CTGG	2	8	6402	6409	0 %	25 %	50 %	25 %	187930835
18	NC_010683	GCCG	2	8	7193	7200	0 %	0 %	50 %	50 %	187930836
19	NC_010683	TGTT	2	8	8303	8310	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010683	TGGG	2	8	8685	8692	0 %	25 %	75 %	0 %	187930837
21	NC_010683	GCCG	2	8	8969	8976	0 %	0 %	50 %	50 %	187930837
22	NC_010683	GCCG	2	8	9182	9189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010683	AACC	2	8	9208	9215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010683	CCGG	2	8	9674	9681	0 %	0 %	50 %	50 %	187930838
25	NC_010683	CGGC	2	8	10037	10044	0 %	0 %	50 %	50 %	187930839
26	NC_010683	CCGC	2	8	10155	10162	0 %	0 %	25 %	75 %	187930839
27	NC_010683	TGGT	2	8	10211	10218	0 %	50 %	50 %	0 %	187930839
28	NC_010683	CAGT	2	8	10750	10757	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_010683	CACT	2	8	11051	11058	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010683	CCGG	2	8	11969	11976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_010683	GGCA	2	8	12075	12082	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_010683	TCGA	2	8	13646	13653	25 %	25 %	25 %	25 %	187930840
33	NC_010683	CATA	2	8	13731	13738	50 %	25 %	0 %	25 %	187930840
34	NC_010683	CGGC	2	8	13778	13785	0 %	0 %	50 %	50 %	187930840
35	NC_010683	AACA	2	8	14081	14088	75 %	0 %	0 %	25 %	187930840
36	NC_010683	GCCG	2	8	14369	14376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_010683	GAAC	2	8	14525	14532	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_010683	GTTC	2	8	15027	15034	0 %	50 %	25 %	25 %	187930841
39	NC_010683	CTGC	2	8	15044	15051	0 %	25 %	25 %	50 %	187930841
40	NC_010683	CATC	2	8	15279	15286	25 %	25 %	0 %	50 %	187930841
41	NC_010683	GCGG	2	8	16187	16194	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_010683	CAGC	2	8	16240	16247	25 %	0 %	25 %	50 %	187930844
43	NC_010683	AGCG	2	8	16744	16751	25 %	0 %	50 %	25 %	187930844
44	NC_010683	GGGT	2	8	16842	16849	0 %	25 %	75 %	0 %	187930844
45	NC_010683	CGGT	2	8	17345	17352	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_010683	CGTT	2	8	17366	17373	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_010683	CGAA	2	8	17379	17386	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_010683	CAAC	2	8	17796	17803	50 %	0 %	0 %	50 %	187930845
49	NC_010683	CAAG	2	8	18103	18110	50 %	0 %	25 %	25 %	187930845
50	NC_010683	AGCG	2	8	18291	18298	25 %	0 %	50 %	25 %	187930845
51	NC_010683	GCGA	2	8	18686	18693	25 %	0 %	50 %	25 %	187930845
52	NC_010683	GGAG	2	8	18803	18810	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010683	CCAA	2	8	18967	18974	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_010683	CGAC	2	8	19105	19112	25 %	0 %	25 %	50 %	187930846
55	NC_010683	TGCG	2	8	19261	19268	0 %	25 %	50 %	25 %	187930846
56	NC_010683	GTGC	2	8	19392	19399	0 %	25 %	50 %	25 %	187930846
57	NC_010683	CTGC	2	8	20152	20159	0 %	25 %	25 %	50 %	187930847
58	NC_010683	AACA	2	8	20630	20637	75 %	0 %	0 %	25 %	187930847
59	NC_010683	AATG	2	8	21434	21441	50 %	25 %	25 %	0 %	187930848
60	NC_010683	GTAG	2	8	21518	21525	25 %	25 %	50 %	0 %	187930848
61	NC_010683	GCCC	2	8	22411	22418	0 %	0 %	25 %	75 %	187930849
62	NC_010683	GCAC	2	8	22522	22529	25 %	0 %	25 %	50 %	187930849
63	NC_010683	CCAG	2	8	22932	22939	25 %	0 %	25 %	50 %	187930850
64	NC_010683	AAGC	2	8	23108	23115	50 %	0 %	25 %	25 %	187930850
65	NC_010683	ATCA	2	8	23367	23374	50 %	25 %	0 %	25 %	187930850
66	NC_010683	ACCA	2	8	23996	24003	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_010683	ATCT	2	8	24017	24024	25 %	50 %	0 %	25 %	187930851
68	NC_010683	CCAT	2	8	24552	24559	25 %	25 %	0 %	50 %	187930852
69	NC_010683	ACTC	2	8	24865	24872	25 %	25 %	0 %	50 %	187930852
70	NC_010683	ATCG	2	8	25024	25031	25 %	25 %	25 %	25 %	187930852
71	NC_010683	AAAG	2	8	25347	25354	75 %	0 %	25 %	0 %	187930852
72	NC_010683	ACCC	2	8	25679	25686	25 %	0 %	0 %	75 %	187930852
73	NC_010683	CAAG	2	8	26671	26678	50 %	0 %	25 %	25 %	187930853
74	NC_010683	TCGC	2	8	26719	26726	0 %	25 %	25 %	50 %	187930853
75	NC_010683	CACC	2	8	26851	26858	25 %	0 %	0 %	75 %	187930853
76	NC_010683	GTCG	2	8	26988	26995	0 %	25 %	50 %	25 %	187930853
77	NC_010683	CTGC	2	8	27414	27421	0 %	25 %	25 %	50 %	187930854
78	NC_010683	CATC	2	8	27632	27639	25 %	25 %	0 %	50 %	187930854
79	NC_010683	ATCG	2	8	29161	29168	25 %	25 %	25 %	25 %	187930855
80	NC_010683	GGAT	2	8	29280	29287	25 %	25 %	50 %	0 %	187930855
81	NC_010683	CAAC	2	8	29359	29366	50 %	0 %	0 %	50 %	187930855
82	NC_010683	TGTC	2	8	30108	30115	0 %	50 %	25 %	25 %	187930856
83	NC_010683	CTGC	2	8	30801	30808	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_010683	GATC	2	8	31095	31102	25 %	25 %	25 %	25 %	187930857
85	NC_010683	CGCC	2	8	31115	31122	0 %	0 %	25 %	75 %	187930857
86	NC_010683	CGCT	2	8	31572	31579	0 %	25 %	25 %	50 %	187930857
87	NC_010683	GGTC	2	8	31887	31894	0 %	25 %	50 %	25 %	187930857
88	NC_010683	AGCT	2	8	31996	32003	25 %	25 %	25 %	25 %	187930857
89	NC_010683	CACG	2	8	32147	32154	25 %	0 %	25 %	50 %	187930858
90	NC_010683	ATCA	2	8	32619	32626	50 %	25 %	0 %	25 %	187930858
91	NC_010683	CAGC	2	8	32930	32937	25 %	0 %	25 %	50 %	187930858
92	NC_010683	ATGC	2	8	33083	33090	25 %	25 %	25 %	25 %	187930858
93	NC_010683	CCGC	2	8	33118	33125	0 %	0 %	25 %	75 %	187930858
94	NC_010683	GCCT	2	8	33132	33139	0 %	25 %	25 %	50 %	187930858
95	NC_010683	GCGG	2	8	33972	33979	0 %	0 %	75 %	25 %	187930859
96	NC_010683	CGCA	2	8	34067	34074	25 %	0 %	25 %	50 %	187930859
97	NC_010683	GAGC	2	8	34099	34106	25 %	0 %	50 %	25 %	187930859
98	NC_010683	CACG	2	8	34968	34975	25 %	0 %	25 %	50 %	187930860
99	NC_010683	GGGC	2	8	35781	35788	0 %	0 %	75 %	25 %	187930860
100	NC_010683	GAAC	2	8	36084	36091	50 %	0 %	25 %	25 %	187930860
101	NC_010683	CCGA	2	8	36311	36318	25 %	0 %	25 %	50 %	187930860
102	NC_010683	CGGC	2	8	36665	36672	0 %	0 %	50 %	50 %	187930860
103	NC_010683	ACGA	2	8	37208	37215	50 %	0 %	25 %	25 %	187930860
104	NC_010683	TCAG	2	8	37498	37505	25 %	25 %	25 %	25 %	187930861
105	NC_010683	CGGT	2	8	37652	37659	0 %	25 %	50 %	25 %	187930861
106	NC_010683	CGAC	2	8	37836	37843	25 %	0 %	25 %	50 %	187930861
107	NC_010683	CCGG	2	8	37876	37883	0 %	0 %	50 %	50 %	187930861
108	NC_010683	CTGC	2	8	38316	38323	0 %	25 %	25 %	50 %	187930861
109	NC_010683	GAGC	2	8	38607	38614	25 %	0 %	50 %	25 %	187930861
110	NC_010683	CGTG	2	8	39808	39815	0 %	25 %	50 %	25 %	187930862
111	NC_010683	AGGT	2	8	39849	39856	25 %	25 %	50 %	0 %	187930862
112	NC_010683	GCGG	2	8	40018	40025	0 %	0 %	75 %	25 %	187930862
113	NC_010683	CGCA	2	8	40162	40169	25 %	0 %	25 %	50 %	187930862
114	NC_010683	TCGG	2	8	40465	40472	0 %	25 %	50 %	25 %	187930863
115	NC_010683	AACG	2	8	40510	40517	50 %	0 %	25 %	25 %	187930863
116	NC_010683	GAGC	2	8	40812	40819	25 %	0 %	50 %	25 %	187930863
117	NC_010683	TGCA	2	8	41203	41210	25 %	25 %	25 %	25 %	187930863
118	NC_010683	ATGG	2	8	41213	41220	25 %	25 %	50 %	0 %	187930863
119	NC_010683	CAAA	2	8	41286	41293	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_010683	GCGG	2	8	41784	41791	0 %	0 %	75 %	25 %	187930864
121	NC_010683	AGGA	2	8	41837	41844	50 %	0 %	50 %	0 %	187930864
122	NC_010683	TTCG	2	8	42210	42217	0 %	50 %	25 %	25 %	187930865
123	NC_010683	CAGC	2	8	42531	42538	25 %	0 %	25 %	50 %	187930865
124	NC_010683	GCCG	2	8	44496	44503	0 %	0 %	50 %	50 %	187930867
125	NC_010683	ACTG	2	8	44611	44618	25 %	25 %	25 %	25 %	187930867
126	NC_010683	TCAT	2	8	44656	44663	25 %	50 %	0 %	25 %	187930867
127	NC_010683	CCTC	2	8	45805	45812	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
128	NC_010683	CAAC	2	8	45999	46006	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_010683	CCAA	2	8	46897	46904	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_010683	CGGC	2	8	47024	47031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_010683	GTTC	2	8	47064	47071	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_010683	TGCG	2	8	47550	47557	0 %	25 %	50 %	25 %	187930868
133	NC_010683	CCCG	2	8	47558	47565	0 %	0 %	25 %	75 %	187930868
134	NC_010683	GCGT	2	8	47659	47666	0 %	25 %	50 %	25 %	187930868
135	NC_010683	CTTG	2	8	48088	48095	0 %	50 %	25 %	25 %	187930868
136	NC_010683	GCCC	2	8	48280	48287	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
137	NC_010683	CCTT	2	8	48959	48966	0 %	50 %	0 %	50 %	187930869
138	NC_010683	CTCG	2	8	49171	49178	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_010683	GCGG	2	8	49205	49212	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
140	NC_010683	GCTG	2	8	49609	49616	0 %	25 %	50 %	25 %	187930870
141	NC_010683	TTGG	2	8	50304	50311	0 %	50 %	50 %	0 %	187930871
142	NC_010683	TCGA	2	8	50499	50506	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_010683	GAGC	2	8	50871	50878	25 %	0 %	50 %	25 %	187930873
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.