MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12J plasmid pRPIC01

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010683	GCTC	2	8	915	922	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010683	CGGC	2	8	5439	5446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_010683	TGTT	2	8	8303	8310	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010683	GCCG	2	8	9182	9189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_010683	AACC	2	8	9208	9215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_010683	CAGT	2	8	10750	10757	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_010683	CACT	2	8	11051	11058	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_010683	CCGG	2	8	11969	11976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010683	GGCA	2	8	12075	12082	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_010683	GCCG	2	8	14369	14376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010683	GAAC	2	8	14525	14532	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_010683	GCGG	2	8	16187	16194	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13	NC_010683	CGGT	2	8	17345	17352	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010683	CGTT	2	8	17366	17373	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_010683	CGAA	2	8	17379	17386	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_010683	GGAG	2	8	18803	18810	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010683	CCAA	2	8	18967	18974	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010683	ACCA	2	8	23996	24003	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010683	CTGC	2	8	30801	30808	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010683	CAAA	2	8	41286	41293	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010683	CCTC	2	8	45805	45812	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_010683	CAAC	2	8	45999	46006	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010683	CCAA	2	8	46897	46904	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010683	CGGC	2	8	47024	47031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010683	GTTC	2	8	47064	47071	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_010683	GCCC	2	8	48280	48287	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27	NC_010683	CTCG	2	8	49171	49178	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010683	GCGG	2	8	49205	49212	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_010683	TCGA	2	8	50499	50506	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_010683	GCGA	2	8	66160	66167	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_010683	GAAA	2	8	79266	79273	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010683	TTTC	2	8	80353	80360	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.