MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Ralstonia pickettii 12J plasmid pRPIC01

Total Repeats: 1168

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010683	GCT	2	6	60	65	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930823
2	NC_010683	GTC	2	6	70	75	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930823
3	NC_010683	CGT	2	6	306	311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930824
4	NC_010683	CAG	2	6	366	371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930824
5	NC_010683	TCG	2	6	382	387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930824
6	NC_010683	GGC	2	6	404	409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930824
7	NC_010683	TGG	2	6	473	478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930824
8	NC_010683	GCG	2	6	683	688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930825
9	NC_010683	CAT	2	6	700	705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930825
10	NC_010683	TTC	2	6	713	718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930825
11	NC_010683	TAT	2	6	939	944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010683	TAC	2	6	1099	1104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930826
13	NC_010683	CGA	2	6	1117	1122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930826
14	NC_010683	GCG	2	6	1159	1164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930826
15	NC_010683	AGA	2	6	1308	1313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187930826
16	NC_010683	TGA	2	6	1342	1347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930827
17	NC_010683	CGC	2	6	1388	1393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
18	NC_010683	GGC	2	6	1418	1423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930827
19	NC_010683	GTC	2	6	1448	1453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930827
20	NC_010683	GCG	2	6	1619	1624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930827
21	NC_010683	GAA	2	6	1629	1634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187930827
22	NC_010683	ACG	2	6	1663	1668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930827
23	NC_010683	TGC	2	6	1682	1687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930827
24	NC_010683	GCC	2	6	1710	1715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
25	NC_010683	TGA	2	6	1738	1743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930827
26	NC_010683	TGG	2	6	1770	1775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930827
27	NC_010683	GCG	2	6	1806	1811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930827
28	NC_010683	CGG	2	6	1960	1965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930827
29	NC_010683	GGT	2	6	2073	2078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930827
30	NC_010683	GCT	2	6	2113	2118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930827
31	NC_010683	CTG	2	6	2160	2165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930827
32	NC_010683	GAT	2	6	2169	2174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930827
33	NC_010683	GGC	2	6	2260	2265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930827
34	NC_010683	GGC	2	6	2318	2323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930827
35	NC_010683	GCC	2	6	2344	2349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
36	NC_010683	GCC	2	6	2429	2434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
37	NC_010683	GCC	2	6	2475	2480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
38	NC_010683	CGC	2	6	2507	2512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
39	NC_010683	GCC	2	6	2553	2558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
40	NC_010683	CGG	2	6	2588	2593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930827
41	NC_010683	TCG	2	6	2623	2628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930827
42	NC_010683	GCC	2	6	2662	2667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
43	NC_010683	TGG	2	6	2683	2688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930827
44	NC_010683	GCT	2	6	2732	2737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930827
45	NC_010683	GCC	2	6	2781	2786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
46	NC_010683	GCC	2	6	2791	2796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
47	NC_010683	CGC	2	6	2837	2842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
48	NC_010683	CCG	2	6	3035	3040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
49	NC_010683	GGC	2	6	3137	3142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010683	AGC	2	6	3189	3194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010683	ACC	2	6	3202	3207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_010683	ACC	2	6	3240	3245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_010683	AGA	2	6	3282	3287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010683	ATC	2	6	3288	3293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010683	TGC	2	6	3349	3354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010683	CGA	2	6	3474	3479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930828
57	NC_010683	AGC	2	6	3500	3505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930828
58	NC_010683	TTC	2	6	3512	3517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930828
59	NC_010683	TTC	3	9	3594	3602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930828
60	NC_010683	TGC	2	6	3607	3612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930828
61	NC_010683	TGC	3	9	3633	3641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930828
62	NC_010683	CAC	2	6	3679	3684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930828
63	NC_010683	GCG	2	6	3770	3775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930828
64	NC_010683	TCG	2	6	3777	3782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930828
65	NC_010683	ATG	2	6	3828	3833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930828
66	NC_010683	CCT	2	6	3836	3841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_010683	CGT	2	6	3870	3875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010683	GAC	2	6	3878	3883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010683	AAG	2	6	3944	3949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010683	CGA	3	9	4112	4120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930829
71	NC_010683	TCA	2	6	4123	4128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930829
72	NC_010683	GCC	2	6	4152	4157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930829
73	NC_010683	TTC	2	6	4231	4236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930829
74	NC_010683	TCA	2	6	4359	4364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930830
75	NC_010683	CCG	2	6	4456	4461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930830
76	NC_010683	GCG	2	6	4523	4528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930830
77	NC_010683	GGA	2	6	4568	4573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187930830
78	NC_010683	TCG	2	6	4655	4660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930830
79	NC_010683	GGC	2	6	4709	4714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010683	CTT	2	6	4741	4746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010683	TAG	2	6	4796	4801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930831
82	NC_010683	CAT	2	6	4852	4857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930831
83	NC_010683	ATG	2	6	4916	4921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930831
84	NC_010683	CAG	2	6	4963	4968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930831
85	NC_010683	CAC	2	6	4975	4980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930831
86	NC_010683	GTA	2	6	5074	5079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930831
87	NC_010683	TCC	2	6	5129	5134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_010683	TCC	2	6	5185	5190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_010683	CAG	2	6	5233	5238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930832
90	NC_010683	CAA	2	6	5239	5244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187930832
91	NC_010683	GCC	2	6	5280	5285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930832
92	NC_010683	CTT	2	6	5468	5473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930833
93	NC_010683	GCC	2	6	5489	5494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930833
94	NC_010683	GTT	2	6	5550	5555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187930833
95	NC_010683	ACC	2	6	5578	5583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930833
96	NC_010683	TCC	2	6	5587	5592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187930833
97	NC_010683	TCG	3	9	5599	5607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930833
98	NC_010683	CCA	2	6	5655	5660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930833
99	NC_010683	GGC	2	6	5733	5738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930833
100	NC_010683	GCC	2	6	5982	5987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930834
101	NC_010683	TGG	2	6	6032	6037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930834
102	NC_010683	GTT	2	6	6074	6079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010683	AGC	2	6	6127	6132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930835
104	NC_010683	GAT	2	6	6219	6224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930835
105	NC_010683	TCG	2	6	6290	6295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930835
106	NC_010683	GCC	2	6	6474	6479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930835
107	NC_010683	CGC	2	6	6528	6533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930835
108	NC_010683	TCG	2	6	6583	6588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930835
109	NC_010683	CGT	2	6	6589	6594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930835
110	NC_010683	ACA	2	6	6640	6645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187930835
111	NC_010683	TGG	2	6	6689	6694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930835
112	NC_010683	CTG	2	6	6716	6721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930835
113	NC_010683	CAT	2	6	6743	6748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010683	TGA	2	6	6818	6823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010683	CGA	2	6	6973	6978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930836
116	NC_010683	GCC	2	6	7042	7047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930836
117	NC_010683	TTC	2	6	7056	7061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930836
118	NC_010683	CGT	2	6	7067	7072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930836
119	NC_010683	CCA	2	6	7348	7353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930836
120	NC_010683	GCG	2	6	7514	7519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930836
121	NC_010683	AAC	2	6	7968	7973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_010683	CGG	2	6	8017	8022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010683	GTT	2	6	8274	8279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010683	GCA	2	6	8427	8432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930837
125	NC_010683	AGC	2	6	8593	8598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930837
126	NC_010683	GGA	2	6	8666	8671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187930837
127	NC_010683	GTG	2	6	8748	8753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930837
128	NC_010683	GGC	2	6	8804	8809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930837
129	NC_010683	GGC	2	6	8861	8866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930837
130	NC_010683	CGA	2	6	8884	8889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930837
131	NC_010683	GTC	2	6	9042	9047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930837
132	NC_010683	GGC	2	6	9101	9106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_010683	GCC	2	6	9113	9118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_010683	GCG	2	6	9169	9174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010683	GCA	2	6	9240	9245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010683	GCT	3	9	9257	9265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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261	NC_010683	GTC	2	6	16930	16935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930844
262	NC_010683	AAT	2	6	17142	17147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_010683	AAC	2	6	17263	17268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_010683	CAT	2	6	17487	17492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930845
265	NC_010683	GCA	2	6	17551	17556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930845
266	NC_010683	GCC	3	9	17614	17622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930845
267	NC_010683	TCG	2	6	17712	17717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930845
268	NC_010683	GTT	2	6	17817	17822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187930845
269	NC_010683	GAA	2	6	17883	17888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187930845
270	NC_010683	GTT	2	6	17907	17912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187930845
271	NC_010683	CTG	2	6	18004	18009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930845
272	NC_010683	CTG	2	6	18089	18094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930845
273	NC_010683	GAT	2	6	18159	18164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930845
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275	NC_010683	CTG	2	6	18265	18270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930845
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278	NC_010683	GGC	2	6	18705	18710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_010683	GCT	2	6	18740	18745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_010683	GCA	2	6	18902	18907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_010683	AAG	2	6	19017	19022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187930846
282	NC_010683	GGT	2	6	19374	19379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930846
283	NC_010683	AGA	2	6	19382	19387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187930846
284	NC_010683	GCT	2	6	19413	19418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930846
285	NC_010683	CAC	2	6	19506	19511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930846
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288	NC_010683	TCA	2	6	19577	19582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930846
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290	NC_010683	GTC	2	6	19835	19840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_010683	AAG	2	6	19869	19874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187930847
292	NC_010683	ACG	2	6	19956	19961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930847
293	NC_010683	CCA	2	6	19999	20004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930847
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295	NC_010683	AAC	2	6	20079	20084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187930847
296	NC_010683	CTG	2	6	20122	20127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930847
297	NC_010683	TCG	2	6	20172	20177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930847
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299	NC_010683	TGC	2	6	20247	20252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930847
300	NC_010683	TGC	2	6	20289	20294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930847
301	NC_010683	GCA	2	6	20302	20307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930847
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303	NC_010683	CAC	3	9	20950	20958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930847
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320	NC_010683	TGG	2	6	22605	22610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
321	NC_010683	AAT	2	6	22634	22639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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323	NC_010683	GAT	2	6	22788	22793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930850
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336	NC_010683	CTG	2	6	23804	23809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
337	NC_010683	GCA	2	6	23884	23889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
338	NC_010683	TAC	2	6	24057	24062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930851
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386	NC_010683	GCT	3	9	28200	28208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930855
387	NC_010683	ACG	2	6	28213	28218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930855
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