MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12J plasmid pRPIC01

Total Repeats: 1014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010683	GCT	2	6	60	65	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930823
2	NC_010683	GTC	2	6	70	75	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930823
3	NC_010683	CGT	2	6	306	311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930824
4	NC_010683	CAG	2	6	366	371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930824
5	NC_010683	TCG	2	6	382	387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930824
6	NC_010683	GGC	2	6	404	409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930824
7	NC_010683	TGG	2	6	473	478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930824
8	NC_010683	GCG	2	6	683	688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930825
9	NC_010683	CAT	2	6	700	705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930825
10	NC_010683	TTC	2	6	713	718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930825
11	NC_010683	TAC	2	6	1099	1104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930826
12	NC_010683	CGA	2	6	1117	1122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930826
13	NC_010683	GCG	2	6	1159	1164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930826
14	NC_010683	AGA	2	6	1308	1313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187930826
15	NC_010683	TGA	2	6	1342	1347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930827
16	NC_010683	CGC	2	6	1388	1393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
17	NC_010683	GGC	2	6	1418	1423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930827
18	NC_010683	GTC	2	6	1448	1453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930827
19	NC_010683	GCG	2	6	1619	1624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930827
20	NC_010683	GAA	2	6	1629	1634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187930827
21	NC_010683	ACG	2	6	1663	1668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930827
22	NC_010683	TGC	2	6	1682	1687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930827
23	NC_010683	GCC	2	6	1710	1715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
24	NC_010683	TGA	2	6	1738	1743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930827
25	NC_010683	TGG	2	6	1770	1775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930827
26	NC_010683	GCG	2	6	1806	1811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930827
27	NC_010683	CGG	2	6	1960	1965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930827
28	NC_010683	GGT	2	6	2073	2078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930827
29	NC_010683	GCT	2	6	2113	2118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930827
30	NC_010683	CTG	2	6	2160	2165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930827
31	NC_010683	GAT	2	6	2169	2174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930827
32	NC_010683	GGC	2	6	2260	2265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930827
33	NC_010683	GGC	2	6	2318	2323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930827
34	NC_010683	GCC	2	6	2344	2349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
35	NC_010683	GCC	2	6	2429	2434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
36	NC_010683	GCC	2	6	2475	2480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
37	NC_010683	CGC	2	6	2507	2512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
38	NC_010683	GCC	2	6	2553	2558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
39	NC_010683	CGG	2	6	2588	2593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930827
40	NC_010683	TCG	2	6	2623	2628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930827
41	NC_010683	GCC	2	6	2662	2667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
42	NC_010683	TGG	2	6	2683	2688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930827
43	NC_010683	GCT	2	6	2732	2737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930827
44	NC_010683	GCC	2	6	2781	2786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
45	NC_010683	GCC	2	6	2791	2796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
46	NC_010683	CGC	2	6	2837	2842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
47	NC_010683	CCG	2	6	3035	3040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930827
48	NC_010683	CGA	2	6	3474	3479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930828
49	NC_010683	AGC	2	6	3500	3505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930828
50	NC_010683	TTC	2	6	3512	3517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930828
51	NC_010683	TTC	3	9	3594	3602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930828
52	NC_010683	TGC	2	6	3607	3612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930828
53	NC_010683	TGC	3	9	3633	3641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930828
54	NC_010683	CAC	2	6	3679	3684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930828
55	NC_010683	GCG	2	6	3770	3775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930828
56	NC_010683	TCG	2	6	3777	3782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930828
57	NC_010683	ATG	2	6	3828	3833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930828
58	NC_010683	CGA	3	9	4112	4120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930829
59	NC_010683	TCA	2	6	4123	4128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930829
60	NC_010683	GCC	2	6	4152	4157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930829
61	NC_010683	TTC	2	6	4231	4236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930829
62	NC_010683	TCA	2	6	4359	4364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930830
63	NC_010683	CCG	2	6	4456	4461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930830
64	NC_010683	GCG	2	6	4523	4528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930830
65	NC_010683	GGA	2	6	4568	4573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187930830
66	NC_010683	TCG	2	6	4655	4660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930830
67	NC_010683	TAG	2	6	4796	4801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930831
68	NC_010683	CAT	2	6	4852	4857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930831
69	NC_010683	ATG	2	6	4916	4921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930831
70	NC_010683	CAG	2	6	4963	4968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930831
71	NC_010683	CAC	2	6	4975	4980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930831
72	NC_010683	GTA	2	6	5074	5079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930831
73	NC_010683	CAG	2	6	5233	5238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930832
74	NC_010683	CAA	2	6	5239	5244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187930832
75	NC_010683	GCC	2	6	5280	5285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930832
76	NC_010683	CTT	2	6	5468	5473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930833
77	NC_010683	GCC	2	6	5489	5494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930833
78	NC_010683	GTT	2	6	5550	5555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187930833
79	NC_010683	ACC	2	6	5578	5583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930833
80	NC_010683	TCC	2	6	5587	5592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187930833
81	NC_010683	TCG	3	9	5599	5607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930833
82	NC_010683	CCA	2	6	5655	5660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930833
83	NC_010683	GGC	2	6	5733	5738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930833
84	NC_010683	GCC	2	6	5982	5987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930834
85	NC_010683	TGG	2	6	6032	6037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930834
86	NC_010683	AGC	2	6	6127	6132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930835
87	NC_010683	GAT	2	6	6219	6224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930835
88	NC_010683	TCG	2	6	6290	6295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930835
89	NC_010683	GCC	2	6	6474	6479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930835
90	NC_010683	CGC	2	6	6528	6533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930835
91	NC_010683	TCG	2	6	6583	6588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930835
92	NC_010683	CGT	2	6	6589	6594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930835
93	NC_010683	ACA	2	6	6640	6645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187930835
94	NC_010683	TGG	2	6	6689	6694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930835
95	NC_010683	CTG	2	6	6716	6721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930835
96	NC_010683	CGA	2	6	6973	6978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930836
97	NC_010683	GCC	2	6	7042	7047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930836
98	NC_010683	TTC	2	6	7056	7061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930836
99	NC_010683	CGT	2	6	7067	7072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930836
100	NC_010683	CCA	2	6	7348	7353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930836
101	NC_010683	GCG	2	6	7514	7519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930836
102	NC_010683	GCA	2	6	8427	8432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930837
103	NC_010683	AGC	2	6	8593	8598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930837
104	NC_010683	GGA	2	6	8666	8671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187930837
105	NC_010683	GTG	2	6	8748	8753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930837
106	NC_010683	GGC	2	6	8804	8809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930837
107	NC_010683	GGC	2	6	8861	8866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930837
108	NC_010683	CGA	2	6	8884	8889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930837
109	NC_010683	GTC	2	6	9042	9047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930837
110	NC_010683	GCT	2	6	9525	9530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930838
111	NC_010683	TGC	2	6	9568	9573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930838
112	NC_010683	TGA	2	6	9650	9655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930838
113	NC_010683	CCG	2	6	9702	9707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930838
114	NC_010683	TCG	3	9	9811	9819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930838
115	NC_010683	GAC	2	6	9843	9848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930838
116	NC_010683	GCC	2	6	9862	9867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930838
117	NC_010683	CGT	2	6	9899	9904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930838
118	NC_010683	TCC	2	6	9938	9943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187930839
119	NC_010683	TCG	3	9	9974	9982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930839
120	NC_010683	GCG	2	6	10007	10012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930839
121	NC_010683	CCT	2	6	10146	10151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187930839
122	NC_010683	CGC	3	9	10239	10247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930839
123	NC_010683	GTC	2	6	10285	10290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930839
124	NC_010683	GAC	2	6	10307	10312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930839
125	NC_010683	GGT	2	6	10350	10355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930839
126	NC_010683	CTG	2	6	12611	12616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930840
127	NC_010683	CTG	2	6	12674	12679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930840
128	NC_010683	GAC	2	6	12704	12709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930840
129	NC_010683	TCG	2	6	12720	12725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930840
130	NC_010683	GCG	2	6	12752	12757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930840
131	NC_010683	GTT	2	6	12793	12798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187930840
132	NC_010683	TCT	2	6	12833	12838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930840
133	NC_010683	GAT	2	6	12895	12900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930840
134	NC_010683	GGA	2	6	13030	13035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187930840
135	NC_010683	GGA	2	6	13069	13074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187930840
136	NC_010683	TCT	2	6	13095	13100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930840
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151	NC_010683	CGG	2	6	14034	14039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930840
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162	NC_010683	GGC	2	6	15214	15219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930841
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253	NC_010683	GCC	2	6	23307	23312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930850
254	NC_010683	CAA	2	6	23333	23338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187930850
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258	NC_010683	TAC	2	6	24057	24062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930851
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270	NC_010683	ACA	2	6	25216	25221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187930852
271	NC_010683	CGA	2	6	25254	25259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930852
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500	NC_010683	CAG	2	6	42967	42972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930865

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