MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Ralstonia pickettii 12J plasmid pRPIC01

Total Repeats: 236

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010683	CG	3	6	348	353	0 %	0 %	50 %	50 %	187930824
2	NC_010683	CG	3	6	1297	1302	0 %	0 %	50 %	50 %	187930826
3	NC_010683	GC	3	6	1397	1402	0 %	0 %	50 %	50 %	187930827
4	NC_010683	CG	3	6	1500	1505	0 %	0 %	50 %	50 %	187930827
5	NC_010683	CG	3	6	1929	1934	0 %	0 %	50 %	50 %	187930827
6	NC_010683	GC	3	6	2087	2092	0 %	0 %	50 %	50 %	187930827
7	NC_010683	GC	3	6	2420	2425	0 %	0 %	50 %	50 %	187930827
8	NC_010683	CG	3	6	3161	3166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010683	GC	3	6	3171	3176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010683	TC	3	6	4076	4081	0 %	50 %	0 %	50 %	187930829
11	NC_010683	CG	3	6	4095	4100	0 %	0 %	50 %	50 %	187930829
12	NC_010683	CA	3	6	4260	4265	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_010683	GT	3	6	4428	4433	0 %	50 %	50 %	0 %	187930830
14	NC_010683	CG	4	8	6266	6273	0 %	0 %	50 %	50 %	187930835
15	NC_010683	GC	3	6	6928	6933	0 %	0 %	50 %	50 %	187930836
16	NC_010683	GC	3	6	7130	7135	0 %	0 %	50 %	50 %	187930836
17	NC_010683	CT	4	8	7757	7764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010683	GC	4	8	7801	7808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010683	GC	3	6	7925	7930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010683	GC	3	6	7933	7938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_010683	CA	3	6	8431	8436	50 %	0 %	0 %	50 %	187930837
22	NC_010683	CT	3	6	8538	8543	0 %	50 %	0 %	50 %	187930837
23	NC_010683	GC	3	6	10043	10048	0 %	0 %	50 %	50 %	187930839
24	NC_010683	GC	3	6	10190	10195	0 %	0 %	50 %	50 %	187930839
25	NC_010683	AG	3	6	10644	10649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010683	CG	3	6	10796	10801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010683	CG	3	6	10862	10867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010683	GC	3	6	10978	10983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010683	CA	3	6	11338	11343	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010683	GC	3	6	11625	11630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_010683	TC	3	6	12817	12822	0 %	50 %	0 %	50 %	187930840
32	NC_010683	GC	3	6	13414	13419	0 %	0 %	50 %	50 %	187930840
33	NC_010683	CG	3	6	14400	14405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010683	CG	3	6	14936	14941	0 %	0 %	50 %	50 %	187930841
35	NC_010683	CG	3	6	15037	15042	0 %	0 %	50 %	50 %	187930841
36	NC_010683	GC	3	6	15175	15180	0 %	0 %	50 %	50 %	187930841
37	NC_010683	GC	3	6	15453	15458	0 %	0 %	50 %	50 %	187930841
38	NC_010683	CG	3	6	15523	15528	0 %	0 %	50 %	50 %	187930841
39	NC_010683	CG	3	6	15650	15655	0 %	0 %	50 %	50 %	187930842
40	NC_010683	CA	3	6	15661	15666	50 %	0 %	0 %	50 %	187930842
41	NC_010683	CG	3	6	15683	15688	0 %	0 %	50 %	50 %	187930842
42	NC_010683	CG	3	6	15698	15703	0 %	0 %	50 %	50 %	187930842
43	NC_010683	CG	3	6	15763	15768	0 %	0 %	50 %	50 %	187930842
44	NC_010683	CG	3	6	15891	15896	0 %	0 %	50 %	50 %	187930843
45	NC_010683	CG	3	6	16180	16185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010683	GC	5	10	16260	16269	0 %	0 %	50 %	50 %	187930844
47	NC_010683	CG	4	8	16462	16469	0 %	0 %	50 %	50 %	187930844
48	NC_010683	CG	3	6	16527	16532	0 %	0 %	50 %	50 %	187930844
49	NC_010683	CG	4	8	16621	16628	0 %	0 %	50 %	50 %	187930844
50	NC_010683	TG	3	6	16652	16657	0 %	50 %	50 %	0 %	187930844
51	NC_010683	CG	3	6	16890	16895	0 %	0 %	50 %	50 %	187930844
52	NC_010683	AC	3	6	18034	18039	50 %	0 %	0 %	50 %	187930845
53	NC_010683	AG	3	6	18534	18539	50 %	0 %	50 %	0 %	187930845
54	NC_010683	GC	3	6	18555	18560	0 %	0 %	50 %	50 %	187930845
55	NC_010683	GC	3	6	18639	18644	0 %	0 %	50 %	50 %	187930845
56	NC_010683	CG	3	6	18893	18898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010683	CG	3	6	19459	19464	0 %	0 %	50 %	50 %	187930846
58	NC_010683	GC	3	6	19593	19598	0 %	0 %	50 %	50 %	187930846
59	NC_010683	GT	3	6	19600	19605	0 %	50 %	50 %	0 %	187930846
60	NC_010683	CG	3	6	19921	19926	0 %	0 %	50 %	50 %	187930847
61	NC_010683	GA	3	6	20230	20235	50 %	0 %	50 %	0 %	187930847
62	NC_010683	GA	3	6	20295	20300	50 %	0 %	50 %	0 %	187930847
63	NC_010683	GC	3	6	21396	21401	0 %	0 %	50 %	50 %	187930848
64	NC_010683	GC	3	6	21609	21614	0 %	0 %	50 %	50 %	187930848
65	NC_010683	GC	3	6	23267	23272	0 %	0 %	50 %	50 %	187930850
66	NC_010683	AG	3	6	23693	23698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010683	CA	3	6	24002	24007	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_010683	GC	3	6	25168	25173	0 %	0 %	50 %	50 %	187930852
69	NC_010683	GC	3	6	25977	25982	0 %	0 %	50 %	50 %	187930852
70	NC_010683	CA	3	6	26053	26058	50 %	0 %	0 %	50 %	187930852
71	NC_010683	GC	3	6	26141	26146	0 %	0 %	50 %	50 %	187930853
72	NC_010683	CG	3	6	26180	26185	0 %	0 %	50 %	50 %	187930853
73	NC_010683	CG	3	6	26517	26522	0 %	0 %	50 %	50 %	187930853
74	NC_010683	TG	3	6	26947	26952	0 %	50 %	50 %	0 %	187930853
75	NC_010683	GT	3	6	27176	27181	0 %	50 %	50 %	0 %	187930854
76	NC_010683	CG	3	6	28265	28270	0 %	0 %	50 %	50 %	187930855
77	NC_010683	CG	3	6	28336	28341	0 %	0 %	50 %	50 %	187930855
78	NC_010683	CG	3	6	28730	28735	0 %	0 %	50 %	50 %	187930855
79	NC_010683	CG	3	6	29861	29866	0 %	0 %	50 %	50 %	187930855
80	NC_010683	TA	3	6	29899	29904	50 %	50 %	0 %	0 %	187930855
81	NC_010683	TC	3	6	30327	30332	0 %	50 %	0 %	50 %	187930856
82	NC_010683	CA	3	6	30653	30658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_010683	CA	3	6	30768	30773	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_010683	GC	3	6	31128	31133	0 %	0 %	50 %	50 %	187930857
85	NC_010683	GC	5	10	31533	31542	0 %	0 %	50 %	50 %	187930857
86	NC_010683	AC	3	6	32222	32227	50 %	0 %	0 %	50 %	187930858
87	NC_010683	CG	3	6	32538	32543	0 %	0 %	50 %	50 %	187930858
88	NC_010683	GC	3	6	32784	32789	0 %	0 %	50 %	50 %	187930858
89	NC_010683	CG	3	6	32983	32988	0 %	0 %	50 %	50 %	187930858
90	NC_010683	GT	3	6	33062	33067	0 %	50 %	50 %	0 %	187930858
91	NC_010683	GC	3	6	33313	33318	0 %	0 %	50 %	50 %	187930858
92	NC_010683	CG	3	6	33348	33353	0 %	0 %	50 %	50 %	187930858
93	NC_010683	GC	3	6	34133	34138	0 %	0 %	50 %	50 %	187930859
94	NC_010683	GC	3	6	34211	34216	0 %	0 %	50 %	50 %	187930859
95	NC_010683	GC	3	6	35263	35268	0 %	0 %	50 %	50 %	187930860
96	NC_010683	CG	3	6	36124	36129	0 %	0 %	50 %	50 %	187930860
97	NC_010683	CG	3	6	36588	36593	0 %	0 %	50 %	50 %	187930860
98	NC_010683	GC	3	6	37734	37739	0 %	0 %	50 %	50 %	187930861
99	NC_010683	GC	3	6	38041	38046	0 %	0 %	50 %	50 %	187930861
100	NC_010683	CG	3	6	38159	38164	0 %	0 %	50 %	50 %	187930861
101	NC_010683	GC	3	6	38251	38256	0 %	0 %	50 %	50 %	187930861
102	NC_010683	GC	3	6	38589	38594	0 %	0 %	50 %	50 %	187930861
103	NC_010683	GC	3	6	39496	39501	0 %	0 %	50 %	50 %	187930862
104	NC_010683	GC	4	8	40277	40284	0 %	0 %	50 %	50 %	187930862
105	NC_010683	GC	3	6	40475	40480	0 %	0 %	50 %	50 %	187930863
106	NC_010683	CG	3	6	40643	40648	0 %	0 %	50 %	50 %	187930863
107	NC_010683	AG	3	6	40696	40701	50 %	0 %	50 %	0 %	187930863
108	NC_010683	CG	3	6	41019	41024	0 %	0 %	50 %	50 %	187930863
109	NC_010683	TG	3	6	41386	41391	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010683	CG	3	6	41930	41935	0 %	0 %	50 %	50 %	187930864
111	NC_010683	GC	3	6	42795	42800	0 %	0 %	50 %	50 %	187930865
112	NC_010683	GC	3	6	42880	42885	0 %	0 %	50 %	50 %	187930865
113	NC_010683	CG	3	6	43023	43028	0 %	0 %	50 %	50 %	187930865
114	NC_010683	CA	3	6	43167	43172	50 %	0 %	0 %	50 %	187930865
115	NC_010683	GC	3	6	43300	43305	0 %	0 %	50 %	50 %	187930865
116	NC_010683	GC	3	6	43779	43784	0 %	0 %	50 %	50 %	187930866
117	NC_010683	GA	3	6	44013	44018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010683	GC	3	6	44877	44882	0 %	0 %	50 %	50 %	187930867
119	NC_010683	CG	3	6	45011	45016	0 %	0 %	50 %	50 %	187930867
120	NC_010683	CG	3	6	45880	45885	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_010683	GC	3	6	46188	46193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_010683	GC	3	6	46426	46431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_010683	GC	3	6	46502	46507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_010683	CT	3	6	46748	46753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_010683	GC	4	8	46806	46813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_010683	GC	4	8	47377	47384	0 %	0 %	50 %	50 %	187930868
127	NC_010683	GC	3	6	47506	47511	0 %	0 %	50 %	50 %	187930868
128	NC_010683	GC	3	6	47638	47643	0 %	0 %	50 %	50 %	187930868
129	NC_010683	GC	3	6	47840	47845	0 %	0 %	50 %	50 %	187930868
130	NC_010683	CG	3	6	48011	48016	0 %	0 %	50 %	50 %	187930868
131	NC_010683	GA	3	6	48256	48261	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010683	GC	3	6	48389	48394	0 %	0 %	50 %	50 %	187930869
133	NC_010683	GC	3	6	48486	48491	0 %	0 %	50 %	50 %	187930869
134	NC_010683	CG	3	6	48581	48586	0 %	0 %	50 %	50 %	187930869
135	NC_010683	GC	3	6	48785	48790	0 %	0 %	50 %	50 %	187930869
136	NC_010683	GT	3	6	48899	48904	0 %	50 %	50 %	0 %	187930869
137	NC_010683	TG	3	6	49380	49385	0 %	50 %	50 %	0 %	187930870
138	NC_010683	GC	3	6	49436	49441	0 %	0 %	50 %	50 %	187930870
139	NC_010683	CG	3	6	49466	49471	0 %	0 %	50 %	50 %	187930870
140	NC_010683	GT	3	6	50127	50132	0 %	50 %	50 %	0 %	187930871
141	NC_010683	AC	3	6	50753	50758	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_010683	GC	3	6	50832	50837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_010683	GC	3	6	51587	51592	0 %	0 %	50 %	50 %	187930875
144	NC_010683	GC	3	6	51676	51681	0 %	0 %	50 %	50 %	187930875
145	NC_010683	GC	3	6	51858	51863	0 %	0 %	50 %	50 %	187930876
146	NC_010683	GC	3	6	52066	52071	0 %	0 %	50 %	50 %	187930876
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.