MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia phytofirmans PsJN chromosome 1

Total Repeats: 3182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010681	ACGTG	2	10	360	369	20 %	20 %	40 %	20 %	187922036
2	NC_010681	ACCAC	2	10	1830	1839	40 %	0 %	0 %	60 %	187922036
3	NC_010681	AGCGC	2	10	3670	3679	20 %	0 %	40 %	40 %	187922038
4	NC_010681	GTGCT	2	10	4239	4248	0 %	40 %	40 %	20 %	187922038
5	NC_010681	GAAGC	2	10	5334	5343	40 %	0 %	40 %	20 %	187922038
6	NC_010681	TCGGA	2	10	7966	7975	20 %	20 %	40 %	20 %	187922040
7	NC_010681	GACTC	2	10	9771	9780	20 %	20 %	20 %	40 %	187922040
8	NC_010681	GATGA	2	10	9948	9957	40 %	20 %	40 %	0 %	187922040
9	NC_010681	CGGTA	2	10	13888	13897	20 %	20 %	40 %	20 %	187922042
10	NC_010681	GCGCA	2	10	16577	16586	20 %	0 %	40 %	40 %	187922046
11	NC_010681	TTTGA	2	10	21623	21632	20 %	60 %	20 %	0 %	187922049
12	NC_010681	CCAGC	2	10	22619	22628	20 %	0 %	20 %	60 %	187922049
13	NC_010681	GTCCG	2	10	23975	23984	0 %	20 %	40 %	40 %	187922049
14	NC_010681	GGTCA	2	10	24092	24101	20 %	20 %	40 %	20 %	187922049
15	NC_010681	ATCGC	2	10	25875	25884	20 %	20 %	20 %	40 %	187922051
16	NC_010681	TCGCT	2	10	27995	28004	0 %	40 %	20 %	40 %	187922052
17	NC_010681	CGGCG	2	10	30290	30299	0 %	0 %	60 %	40 %	187922054
18	NC_010681	ACCGA	2	10	31170	31179	40 %	0 %	20 %	40 %	187922054
19	NC_010681	GCGCC	2	10	33043	33052	0 %	0 %	40 %	60 %	187922056
20	NC_010681	CGCAA	2	10	33421	33430	40 %	0 %	20 %	40 %	187922056
21	NC_010681	GCACC	2	10	33931	33940	20 %	0 %	20 %	60 %	187922057
22	NC_010681	GTCCA	2	10	35970	35979	20 %	20 %	20 %	40 %	187922059
23	NC_010681	GGCGC	2	10	36487	36496	0 %	0 %	60 %	40 %	187922059
24	NC_010681	TCGAG	2	10	38983	38992	20 %	20 %	40 %	20 %	187922060
25	NC_010681	AGGGC	2	10	40100	40109	20 %	0 %	60 %	20 %	187922063
26	NC_010681	TCGTC	2	10	42667	42676	0 %	40 %	20 %	40 %	187922065
27	NC_010681	TCGAA	2	10	43379	43388	40 %	20 %	20 %	20 %	187922066
28	NC_010681	GACGC	2	10	43795	43804	20 %	0 %	40 %	40 %	187922066
29	NC_010681	TGCCC	2	10	49945	49954	0 %	20 %	20 %	60 %	187922070
30	NC_010681	TCGGC	2	10	50265	50274	0 %	20 %	40 %	40 %	187922071
31	NC_010681	CTCGG	2	10	53647	53656	0 %	20 %	40 %	40 %	187922073
32	NC_010681	CGCGT	2	10	53911	53920	0 %	20 %	40 %	40 %	187922073
33	NC_010681	ATCTG	2	10	54803	54812	20 %	40 %	20 %	20 %	187922074
34	NC_010681	CCAGC	2	10	55920	55929	20 %	0 %	20 %	60 %	187922075
35	NC_010681	GTCGC	2	10	56870	56879	0 %	20 %	40 %	40 %	187922076
36	NC_010681	TGAAA	2	10	57729	57738	60 %	20 %	20 %	0 %	187922077
37	NC_010681	GAAGG	2	10	59045	59054	40 %	0 %	60 %	0 %	187922078
38	NC_010681	TGTCG	2	10	63359	63368	0 %	40 %	40 %	20 %	187922081
39	NC_010681	GATCA	2	10	65769	65778	40 %	20 %	20 %	20 %	187922084
40	NC_010681	GCTCG	2	10	67408	67417	0 %	20 %	40 %	40 %	187922085
41	NC_010681	GACAG	2	10	73285	73294	40 %	0 %	40 %	20 %	187922091
42	NC_010681	GGTCG	2	10	73666	73675	0 %	20 %	60 %	20 %	187922091
43	NC_010681	TCGCG	2	10	74440	74449	0 %	20 %	40 %	40 %	187922092
44	NC_010681	TGCGG	2	10	75114	75123	0 %	20 %	60 %	20 %	187922093
45	NC_010681	AGCCC	2	10	75469	75478	20 %	0 %	20 %	60 %	187922094
46	NC_010681	TGGGG	2	10	75954	75963	0 %	20 %	80 %	0 %	187922094
47	NC_010681	AAGGC	2	10	76891	76900	40 %	0 %	40 %	20 %	187922094
48	NC_010681	CATGG	2	10	80811	80820	20 %	20 %	40 %	20 %	187922097
49	NC_010681	ATCGC	2	10	80836	80845	20 %	20 %	20 %	40 %	187922097
50	NC_010681	TCCGT	2	10	85423	85432	0 %	40 %	20 %	40 %	187922101
51	NC_010681	ACCGA	2	10	86887	86896	40 %	0 %	20 %	40 %	187922102
52	NC_010681	TTCGC	2	10	92155	92164	0 %	40 %	20 %	40 %	187922105
53	NC_010681	GGCGA	2	10	95266	95275	20 %	0 %	60 %	20 %	187922108
54	NC_010681	GCGCA	2	10	95434	95443	20 %	0 %	40 %	40 %	187922108
55	NC_010681	CGCGG	2	10	95889	95898	0 %	0 %	60 %	40 %	187922109
56	NC_010681	GCGTT	2	10	96052	96061	0 %	40 %	40 %	20 %	187922109
57	NC_010681	CGAGC	2	10	96521	96530	20 %	0 %	40 %	40 %	187922110
58	NC_010681	CCGGC	2	10	98083	98092	0 %	0 %	40 %	60 %	187922111
59	NC_010681	CAGCG	2	10	99194	99203	20 %	0 %	40 %	40 %	187922112
60	NC_010681	CCGCA	2	10	99226	99235	20 %	0 %	20 %	60 %	187922112
61	NC_010681	GCCGC	2	10	101925	101934	0 %	0 %	40 %	60 %	187922114
62	NC_010681	CGAGC	2	10	102030	102039	20 %	0 %	40 %	40 %	187922114
63	NC_010681	TCGCC	2	10	105255	105264	0 %	20 %	20 %	60 %	187922116
64	NC_010681	CGTGA	2	10	105723	105732	20 %	20 %	40 %	20 %	187922116
65	NC_010681	CAGTG	2	10	109907	109916	20 %	20 %	40 %	20 %	187922120
66	NC_010681	CGAAG	2	10	110407	110416	40 %	0 %	40 %	20 %	187922121
67	NC_010681	TGCGC	2	10	115662	115671	0 %	20 %	40 %	40 %	187922126
68	NC_010681	CGCTG	2	10	116834	116843	0 %	20 %	40 %	40 %	187922126
69	NC_010681	GCGCG	2	10	117255	117264	0 %	0 %	60 %	40 %	187922126
70	NC_010681	CTTGC	2	10	119746	119755	0 %	40 %	20 %	40 %	187922128
71	NC_010681	GTCAG	2	10	119855	119864	20 %	20 %	40 %	20 %	187922128
72	NC_010681	GCAGC	2	10	120246	120255	20 %	0 %	40 %	40 %	187922128
73	NC_010681	CCGGG	2	10	122582	122591	0 %	0 %	60 %	40 %	187922130
74	NC_010681	CATGG	2	10	126534	126543	20 %	20 %	40 %	20 %	187922134
75	NC_010681	CCGGC	2	10	127825	127834	0 %	0 %	40 %	60 %	187922135
76	NC_010681	GAACG	2	10	128150	128159	40 %	0 %	40 %	20 %	187922135
77	NC_010681	CTGCT	2	10	132337	132346	0 %	40 %	20 %	40 %	187922138
78	NC_010681	GAAAA	2	10	134671	134680	80 %	0 %	20 %	0 %	187922139
79	NC_010681	GTTTC	2	10	136114	136123	0 %	60 %	20 %	20 %	187922141
80	NC_010681	TCGCG	2	10	138971	138980	0 %	20 %	40 %	40 %	187922143
81	NC_010681	CGATG	2	10	139512	139521	20 %	20 %	40 %	20 %	187922143
82	NC_010681	TCGAC	2	10	141320	141329	20 %	20 %	20 %	40 %	187922145
83	NC_010681	CGATG	2	10	143332	143341	20 %	20 %	40 %	20 %	187922146
84	NC_010681	ACGCT	2	10	143545	143554	20 %	20 %	20 %	40 %	187922146
85	NC_010681	GGCGG	2	10	149910	149919	0 %	0 %	80 %	20 %	187922154
86	NC_010681	GCCGA	2	10	149968	149977	20 %	0 %	40 %	40 %	187922154
87	NC_010681	ATCCG	2	10	151087	151096	20 %	20 %	20 %	40 %	187922155
88	NC_010681	ATGCA	2	10	151146	151155	40 %	20 %	20 %	20 %	187922155
89	NC_010681	TGCCG	2	10	156202	156211	0 %	20 %	40 %	40 %	187922159
90	NC_010681	TGCGC	2	10	157011	157020	0 %	20 %	40 %	40 %	187922160
91	NC_010681	CAGCG	2	10	157366	157375	20 %	0 %	40 %	40 %	187922160
92	NC_010681	GCGTG	2	10	158699	158708	0 %	20 %	60 %	20 %	187922162
93	NC_010681	CGGGC	2	10	158786	158795	0 %	0 %	60 %	40 %	187922162
94	NC_010681	GCGTG	2	10	160707	160716	0 %	20 %	60 %	20 %	187922164
95	NC_010681	CTCGC	2	10	163470	163479	0 %	20 %	20 %	60 %	187922167
96	NC_010681	CCTGA	2	10	168587	168596	20 %	20 %	20 %	40 %	187922172
97	NC_010681	CCGTG	2	10	168825	168834	0 %	20 %	40 %	40 %	187922172
98	NC_010681	TCCTG	2	10	170468	170477	0 %	40 %	20 %	40 %	187922174
99	NC_010681	ACTGC	2	10	174059	174068	20 %	20 %	20 %	40 %	187922180
100	NC_010681	GCGTT	2	10	174781	174790	0 %	40 %	40 %	20 %	187922181
101	NC_010681	CCGCA	2	10	176200	176209	20 %	0 %	20 %	60 %	187922184
102	NC_010681	GGCGA	2	10	177058	177067	20 %	0 %	60 %	20 %	187922184
103	NC_010681	GGACG	2	10	177366	177375	20 %	0 %	60 %	20 %	187922184
104	NC_010681	CTGGG	2	10	177589	177598	0 %	20 %	60 %	20 %	187922184
105	NC_010681	TCGGG	2	10	178507	178516	0 %	20 %	60 %	20 %	187922185
106	NC_010681	CTGGC	2	10	179203	179212	0 %	20 %	40 %	40 %	187922185
107	NC_010681	CACGA	2	10	181390	181399	40 %	0 %	20 %	40 %	187922189
108	NC_010681	ATTCG	2	10	182602	182611	20 %	40 %	20 %	20 %	187922190
109	NC_010681	GTCGT	2	10	182667	182676	0 %	40 %	40 %	20 %	187922190
110	NC_010681	CATCC	2	10	183406	183415	20 %	20 %	0 %	60 %	187922191
111	NC_010681	ACGGT	2	10	184290	184299	20 %	20 %	40 %	20 %	187922192
112	NC_010681	CTGGC	2	10	184482	184491	0 %	20 %	40 %	40 %	187922192
113	NC_010681	TCACG	2	10	186009	186018	20 %	20 %	20 %	40 %	187922193
114	NC_010681	CTCGC	2	10	186679	186688	0 %	20 %	20 %	60 %	187922194
115	NC_010681	GCCCG	2	10	186880	186889	0 %	0 %	40 %	60 %	187922194
116	NC_010681	GCACC	2	10	187712	187721	20 %	0 %	20 %	60 %	187922194
117	NC_010681	GTCGA	2	10	188869	188878	20 %	20 %	40 %	20 %	187922195
118	NC_010681	CAGTC	2	10	195076	195085	20 %	20 %	20 %	40 %	187922201
119	NC_010681	GCTGG	2	10	198221	198230	0 %	20 %	60 %	20 %	187922202
120	NC_010681	TGGCG	2	10	198440	198449	0 %	20 %	60 %	20 %	187922202
121	NC_010681	CGGGC	2	10	198582	198591	0 %	0 %	60 %	40 %	187922202
122	NC_010681	CCTCG	2	10	199370	199379	0 %	20 %	20 %	60 %	187922202
123	NC_010681	GCGCG	2	10	199385	199394	0 %	0 %	60 %	40 %	187922202
124	NC_010681	AGGCG	2	10	200805	200814	20 %	0 %	60 %	20 %	187922203
125	NC_010681	ACCTG	2	10	202074	202083	20 %	20 %	20 %	40 %	187922203
126	NC_010681	GCCGC	2	10	202815	202824	0 %	0 %	40 %	60 %	187922204
127	NC_010681	CGACC	2	10	203299	203308	20 %	0 %	20 %	60 %	187922204
128	NC_010681	TCGCG	2	10	207212	207221	0 %	20 %	40 %	40 %	187922208
129	NC_010681	ACGAT	2	10	212836	212845	40 %	20 %	20 %	20 %	187922212
130	NC_010681	GTTCA	2	10	213510	213519	20 %	40 %	20 %	20 %	187922212
131	NC_010681	CGATG	2	10	222621	222630	20 %	20 %	40 %	20 %	187922218
132	NC_010681	GGCGC	2	10	224639	224648	0 %	0 %	60 %	40 %	187922220
133	NC_010681	CAAAG	2	10	227297	227306	60 %	0 %	20 %	20 %	187922224
134	NC_010681	AGTCC	2	10	229414	229423	20 %	20 %	20 %	40 %	187922225
135	NC_010681	CACTG	2	10	230100	230109	20 %	20 %	20 %	40 %	187922225
136	NC_010681	AGGCA	2	10	230991	231000	40 %	0 %	40 %	20 %	187922225
137	NC_010681	AATGC	2	10	231239	231248	40 %	20 %	20 %	20 %	187922225
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142	NC_010681	ATCGG	2	10	245126	245135	20 %	20 %	40 %	20 %	187922240
143	NC_010681	CCGTG	2	10	248572	248581	0 %	20 %	40 %	40 %	187922243
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146	NC_010681	GCGAT	2	10	254144	254153	20 %	20 %	40 %	20 %	187922247
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149	NC_010681	CGAAA	2	10	259290	259299	60 %	0 %	20 %	20 %	187922252
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247	NC_010681	TCAGC	2	10	405808	405817	20 %	20 %	20 %	40 %	187922380
248	NC_010681	CGAAT	2	10	406232	406241	40 %	20 %	20 %	20 %	187922380
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251	NC_010681	CATCG	2	10	411647	411656	20 %	20 %	20 %	40 %	187922385
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259	NC_010681	CTCGG	2	10	424014	424023	0 %	20 %	40 %	40 %	187922396
260	NC_010681	GCCGT	2	10	424742	424751	0 %	20 %	40 %	40 %	187922397
261	NC_010681	GCGCG	2	10	425360	425369	0 %	0 %	60 %	40 %	187922397
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263	NC_010681	GCCGC	2	10	431507	431516	0 %	0 %	40 %	60 %	187922402
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