MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Burkholderia phytofirmans PsJN chromosome 1

Total Repeats: 75124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010681	CGC	2	6	150	155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_010681	GCT	2	6	223	228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010681	TTG	2	6	236	241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010681	CCG	2	6	268	273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_010681	CAG	2	6	353	358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922036
6	NC_010681	CGC	2	6	400	405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922036
7	NC_010681	CGC	2	6	424	429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922036
8	NC_010681	GGC	2	6	620	625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922036
9	NC_010681	GCG	2	6	674	679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922036
10	NC_010681	AAC	2	6	713	718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187922036
11	NC_010681	CGC	2	6	748	753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922036
12	NC_010681	CCG	2	6	798	803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922036
13	NC_010681	GCC	2	6	842	847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922036
14	NC_010681	CGC	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922036
15	NC_010681	CGC	2	6	985	990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922036
16	NC_010681	GGC	2	6	1046	1051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922036
17	NC_010681	GTG	2	6	1160	1165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187922036
18	NC_010681	CGA	2	6	1189	1194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922036
19	NC_010681	CTA	2	6	1204	1209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922036
20	NC_010681	CTG	3	9	1223	1231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922036
21	NC_010681	CGA	2	6	1234	1239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922036
22	NC_010681	AGA	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922036
23	NC_010681	TTC	2	6	1280	1285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187922036
24	NC_010681	CGA	2	6	1366	1371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922036
25	NC_010681	GCC	2	6	1417	1422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922036
26	NC_010681	TTC	2	6	1499	1504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187922036
27	NC_010681	AAG	2	6	1611	1616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922036
28	NC_010681	CTG	2	6	1628	1633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922036
29	NC_010681	AGA	2	6	1671	1676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922036
30	NC_010681	GAA	2	6	1720	1725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922036
31	NC_010681	AGA	2	6	1788	1793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922036
32	NC_010681	CGG	2	6	1819	1824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922036
33	NC_010681	TGC	2	6	1842	1847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922036
34	NC_010681	CGA	2	6	1867	1872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922036
35	NC_010681	GCA	2	6	1875	1880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922036
36	NC_010681	CGG	2	6	2033	2038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010681	CGG	2	6	2080	2085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010681	CCT	2	6	2186	2191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187922037
39	NC_010681	TCG	2	6	2218	2223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922037
40	NC_010681	CGC	2	6	2226	2231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922037
41	NC_010681	CAC	2	6	2318	2323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187922037
42	NC_010681	GCG	2	6	2344	2349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922037
43	NC_010681	CTC	2	6	2382	2387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187922037
44	NC_010681	CGC	2	6	2489	2494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922037
45	NC_010681	CAG	2	6	2601	2606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922037
46	NC_010681	TGC	2	6	2632	2637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922037
47	NC_010681	TGG	3	9	2638	2646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187922037
48	NC_010681	CTG	2	6	2775	2780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922037
49	NC_010681	CGA	2	6	2789	2794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922037
50	NC_010681	TGG	2	6	2866	2871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187922037
51	NC_010681	GAA	2	6	2940	2945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922037
52	NC_010681	CGC	2	6	2966	2971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922037
53	NC_010681	GAA	2	6	3069	3074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922037
54	NC_010681	ACG	2	6	3088	3093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922037
55	NC_010681	ACG	2	6	3220	3225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922037
56	NC_010681	CGT	2	6	3236	3241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922037
57	NC_010681	AGC	2	6	3336	3341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010681	GCA	2	6	3348	3353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010681	ACA	2	6	3403	3408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187922038
60	NC_010681	CGA	2	6	3542	3547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922038
61	NC_010681	GAC	2	6	3651	3656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922038
62	NC_010681	TGA	2	6	3691	3696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187922038
63	NC_010681	CGG	2	6	3710	3715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922038
64	NC_010681	CGG	2	6	3746	3751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922038
65	NC_010681	CGC	2	6	3813	3818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922038
66	NC_010681	AAG	2	6	3825	3830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922038
67	NC_010681	CGA	2	6	3959	3964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922038
68	NC_010681	GAA	2	6	4080	4085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922038
69	NC_010681	GCG	2	6	4102	4107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922038
70	NC_010681	TGC	2	6	4147	4152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922038
71	NC_010681	GCG	2	6	4174	4179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922038
72	NC_010681	AAC	2	6	4254	4259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187922038
73	NC_010681	GAA	2	6	4352	4357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922038
74	NC_010681	CGA	2	6	4379	4384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922038
75	NC_010681	GTC	2	6	4466	4471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922038
76	NC_010681	ATT	2	6	4551	4556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187922038
77	NC_010681	GCA	2	6	4558	4563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922038
78	NC_010681	GCG	2	6	4575	4580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922038
79	NC_010681	TCG	2	6	4708	4713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922038
80	NC_010681	GCT	2	6	4823	4828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922038
81	NC_010681	TTC	2	6	4829	4834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187922038
82	NC_010681	CAT	4	12	4919	4930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922038
83	NC_010681	TGT	2	6	4969	4974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187922038
84	NC_010681	TTC	2	6	4980	4985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187922038
85	NC_010681	GAT	2	6	5003	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187922038
86	NC_010681	GCC	2	6	5036	5041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922038
87	NC_010681	GTT	2	6	5220	5225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187922038
88	NC_010681	CAT	2	6	5267	5272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922038
89	NC_010681	GAT	2	6	5349	5354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187922038
90	NC_010681	ACG	2	6	5379	5384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922038
91	NC_010681	CAT	2	6	5433	5438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922038
92	NC_010681	AGA	2	6	5446	5451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922038
93	NC_010681	CTG	2	6	5482	5487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922038
94	NC_010681	AGC	2	6	5638	5643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922038
95	NC_010681	CGT	2	6	5709	5714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922038
96	NC_010681	GAT	2	6	5778	5783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187922038
97	NC_010681	GCT	2	6	5856	5861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010681	TTG	2	6	5968	5973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187922039
99	NC_010681	AGC	2	6	6023	6028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922039
100	NC_010681	CCG	2	6	6043	6048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922039
101	NC_010681	CAT	2	6	6050	6055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922039
102	NC_010681	CGG	2	6	6086	6091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922039
103	NC_010681	CGC	2	6	6155	6160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922039
104	NC_010681	AGG	2	6	6226	6231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187922039
105	NC_010681	CGA	2	6	6245	6250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922039
106	NC_010681	GCG	2	6	6259	6264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922039
107	NC_010681	GCT	2	6	6509	6514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010681	GTC	2	6	6569	6574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_010681	GTA	2	6	6699	6704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010681	ATC	2	6	7135	7140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010681	GGC	2	6	7167	7172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010681	TTC	2	6	7215	7220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010681	CCA	2	6	7350	7355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_010681	ATC	2	6	7368	7373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010681	TAT	2	6	7443	7448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010681	TGC	2	6	7458	7463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_010681	TTA	2	6	7616	7621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010681	CGC	2	6	7759	7764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922040
119	NC_010681	CAG	2	6	7908	7913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922040
120	NC_010681	CGT	2	6	8008	8013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922040
121	NC_010681	CGC	2	6	8034	8039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922040
122	NC_010681	GAC	2	6	8178	8183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922040
123	NC_010681	GCT	2	6	8201	8206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922040
124	NC_010681	TCA	2	6	8269	8274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922040
125	NC_010681	CAC	2	6	8402	8407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187922040
126	NC_010681	GGA	2	6	8579	8584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187922040
127	NC_010681	CGG	2	6	8753	8758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922040
128	NC_010681	CGG	2	6	8761	8766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922040
129	NC_010681	ACA	2	6	8790	8795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187922040
130	NC_010681	CTG	2	6	8796	8801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922040
131	NC_010681	ACG	2	6	8898	8903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922040
132	NC_010681	TCG	3	9	8962	8970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922040
133	NC_010681	CGA	2	6	8996	9001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922040
134	NC_010681	GCG	2	6	9046	9051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922040
135	NC_010681	CGG	2	6	9107	9112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922040
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137	NC_010681	CGG	2	6	9158	9163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922040
138	NC_010681	CGG	2	6	9266	9271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922040
139	NC_010681	AGC	2	6	9336	9341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922040
140	NC_010681	GCA	2	6	9374	9379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922040
141	NC_010681	AAG	2	6	9621	9626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922040
142	NC_010681	GCA	2	6	9658	9663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922040
143	NC_010681	CGG	2	6	9682	9687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922040
144	NC_010681	TGG	2	6	9733	9738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187922040
145	NC_010681	GTT	2	6	9905	9910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187922040
146	NC_010681	CAG	2	6	9989	9994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922040
147	NC_010681	GAC	2	6	10088	10093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922040
148	NC_010681	CGT	2	6	10172	10177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922040
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150	NC_010681	CGG	2	6	10210	10215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922040
151	NC_010681	AAC	2	6	10460	10465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187922041
152	NC_010681	TGA	2	6	10503	10508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187922041
153	NC_010681	TCG	2	6	10523	10528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922041
154	NC_010681	CGG	2	6	10638	10643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922041
155	NC_010681	CGG	2	6	10664	10669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922041
156	NC_010681	CGT	2	6	10671	10676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922041
157	NC_010681	CGC	2	6	10677	10682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922041
158	NC_010681	CAA	2	6	10693	10698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187922041
159	NC_010681	TGT	2	6	10778	10783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187922041
160	NC_010681	GCT	2	6	10803	10808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922041
161	NC_010681	AGG	2	6	10994	10999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187922041
162	NC_010681	CAT	2	6	11061	11066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922041
163	NC_010681	GAC	2	6	11152	11157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922041
164	NC_010681	CGG	2	6	11165	11170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922041
165	NC_010681	GAC	2	6	11191	11196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922041
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167	NC_010681	ACA	2	6	11319	11324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187922042
168	NC_010681	CGG	2	6	11409	11414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922042
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173	NC_010681	CGA	2	6	11856	11861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922042
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175	NC_010681	ACT	2	6	11895	11900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922042
176	NC_010681	GCG	2	6	11932	11937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922042
177	NC_010681	TGA	2	6	12053	12058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187922042
178	NC_010681	CCA	2	6	12094	12099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187922042
179	NC_010681	TGC	2	6	12101	12106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922042
180	NC_010681	AAC	2	6	12274	12279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187922042
181	NC_010681	CGC	2	6	12314	12319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922042
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189	NC_010681	CGA	2	6	12735	12740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922042
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196	NC_010681	ATT	2	6	13149	13154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187922042
197	NC_010681	GCC	2	6	13343	13348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922042
198	NC_010681	CTT	2	6	13483	13488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187922042
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212	NC_010681	TCG	3	9	14641	14649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922043
213	NC_010681	CCA	2	6	14707	14712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187922043
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218	NC_010681	CGT	2	6	15281	15286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922044
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220	NC_010681	GGC	2	6	15491	15496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922044
221	NC_010681	GTC	2	6	15504	15509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922044
222	NC_010681	GAT	2	6	15542	15547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187922044
223	NC_010681	GAC	2	6	15756	15761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
224	NC_010681	ATG	2	6	15765	15770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187922045
225	NC_010681	TTG	2	6	15853	15858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187922045
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227	NC_010681	GCG	2	6	16019	16024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
228	NC_010681	GCG	3	9	16064	16072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
229	NC_010681	AAT	2	6	16097	16102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
230	NC_010681	TCA	2	6	16116	16121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922046
231	NC_010681	CAG	2	6	16224	16229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922046
232	NC_010681	GCA	2	6	16338	16343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922046
233	NC_010681	ACT	2	6	16344	16349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922046
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237	NC_010681	GCG	2	6	16494	16499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922046
238	NC_010681	CGT	2	6	16669	16674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922046
239	NC_010681	GTT	2	6	16702	16707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187922046
240	NC_010681	TGA	2	6	16842	16847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187922046
241	NC_010681	CAT	2	6	16877	16882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922046
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245	NC_010681	CGA	2	6	17136	17141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922046
246	NC_010681	GCG	2	6	17162	17167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922046
247	NC_010681	GAA	2	6	17173	17178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922046
248	NC_010681	CGG	2	6	17205	17210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922046
249	NC_010681	CAG	2	6	17276	17281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922046
250	NC_010681	CGG	2	6	17340	17345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922046
251	NC_010681	TGC	2	6	17422	17427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922046
252	NC_010681	GTG	2	6	17438	17443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187922046
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254	NC_010681	CGA	2	6	17529	17534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922046
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