MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia phytofirmans PsJN chromosome 1

Total Repeats: 67141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010681	CAG	2	6	353	358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922036
2	NC_010681	CGC	2	6	400	405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922036
3	NC_010681	CGC	2	6	424	429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922036
4	NC_010681	GGC	2	6	620	625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922036
5	NC_010681	GCG	2	6	674	679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922036
6	NC_010681	AAC	2	6	713	718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187922036
7	NC_010681	CGC	2	6	748	753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922036
8	NC_010681	CCG	2	6	798	803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922036
9	NC_010681	GCC	2	6	842	847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922036
10	NC_010681	CGC	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922036
11	NC_010681	CGC	2	6	985	990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922036
12	NC_010681	GGC	2	6	1046	1051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922036
13	NC_010681	GTG	2	6	1160	1165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187922036
14	NC_010681	CGA	2	6	1189	1194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922036
15	NC_010681	CTA	2	6	1204	1209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922036
16	NC_010681	CTG	3	9	1223	1231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922036
17	NC_010681	CGA	2	6	1234	1239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922036
18	NC_010681	AGA	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922036
19	NC_010681	TTC	2	6	1280	1285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187922036
20	NC_010681	CGA	2	6	1366	1371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922036
21	NC_010681	GCC	2	6	1417	1422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922036
22	NC_010681	TTC	2	6	1499	1504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187922036
23	NC_010681	AAG	2	6	1611	1616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922036
24	NC_010681	CTG	2	6	1628	1633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922036
25	NC_010681	AGA	2	6	1671	1676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922036
26	NC_010681	GAA	2	6	1720	1725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922036
27	NC_010681	AGA	2	6	1788	1793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922036
28	NC_010681	CGG	2	6	1819	1824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922036
29	NC_010681	TGC	2	6	1842	1847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922036
30	NC_010681	CGA	2	6	1867	1872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922036
31	NC_010681	GCA	2	6	1875	1880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922036
32	NC_010681	CCT	2	6	2186	2191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187922037
33	NC_010681	TCG	2	6	2218	2223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922037
34	NC_010681	CGC	2	6	2226	2231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922037
35	NC_010681	CAC	2	6	2318	2323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187922037
36	NC_010681	GCG	2	6	2344	2349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922037
37	NC_010681	CTC	2	6	2382	2387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187922037
38	NC_010681	CGC	2	6	2489	2494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922037
39	NC_010681	CAG	2	6	2601	2606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922037
40	NC_010681	TGC	2	6	2632	2637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922037
41	NC_010681	TGG	3	9	2638	2646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187922037
42	NC_010681	CTG	2	6	2775	2780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922037
43	NC_010681	CGA	2	6	2789	2794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922037
44	NC_010681	TGG	2	6	2866	2871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187922037
45	NC_010681	GAA	2	6	2940	2945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922037
46	NC_010681	CGC	2	6	2966	2971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922037
47	NC_010681	GAA	2	6	3069	3074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922037
48	NC_010681	ACG	2	6	3088	3093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922037
49	NC_010681	ACG	2	6	3220	3225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922037
50	NC_010681	CGT	2	6	3236	3241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922037
51	NC_010681	ACA	2	6	3403	3408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187922038
52	NC_010681	CGA	2	6	3542	3547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922038
53	NC_010681	GAC	2	6	3651	3656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922038
54	NC_010681	TGA	2	6	3691	3696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187922038
55	NC_010681	CGG	2	6	3710	3715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922038
56	NC_010681	CGG	2	6	3746	3751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922038
57	NC_010681	CGC	2	6	3813	3818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922038
58	NC_010681	AAG	2	6	3825	3830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922038
59	NC_010681	CGA	2	6	3959	3964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922038
60	NC_010681	GAA	2	6	4080	4085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922038
61	NC_010681	GCG	2	6	4102	4107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922038
62	NC_010681	TGC	2	6	4147	4152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922038
63	NC_010681	GCG	2	6	4174	4179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922038
64	NC_010681	AAC	2	6	4254	4259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187922038
65	NC_010681	GAA	2	6	4352	4357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922038
66	NC_010681	CGA	2	6	4379	4384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922038
67	NC_010681	GTC	2	6	4466	4471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922038
68	NC_010681	ATT	2	6	4551	4556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187922038
69	NC_010681	GCA	2	6	4558	4563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922038
70	NC_010681	GCG	2	6	4575	4580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922038
71	NC_010681	TCG	2	6	4708	4713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922038
72	NC_010681	GCT	2	6	4823	4828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922038
73	NC_010681	TTC	2	6	4829	4834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187922038
74	NC_010681	CAT	4	12	4919	4930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922038
75	NC_010681	TGT	2	6	4969	4974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187922038
76	NC_010681	TTC	2	6	4980	4985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187922038
77	NC_010681	GAT	2	6	5003	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187922038
78	NC_010681	GCC	2	6	5036	5041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922038
79	NC_010681	GTT	2	6	5220	5225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187922038
80	NC_010681	CAT	2	6	5267	5272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922038
81	NC_010681	GAT	2	6	5349	5354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187922038
82	NC_010681	ACG	2	6	5379	5384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922038
83	NC_010681	CAT	2	6	5433	5438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922038
84	NC_010681	AGA	2	6	5446	5451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922038
85	NC_010681	CTG	2	6	5482	5487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922038
86	NC_010681	AGC	2	6	5638	5643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922038
87	NC_010681	CGT	2	6	5709	5714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922038
88	NC_010681	GAT	2	6	5778	5783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187922038
89	NC_010681	TTG	2	6	5968	5973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187922039
90	NC_010681	AGC	2	6	6023	6028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922039
91	NC_010681	CCG	2	6	6043	6048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922039
92	NC_010681	CAT	2	6	6050	6055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922039
93	NC_010681	CGG	2	6	6086	6091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922039
94	NC_010681	CGC	2	6	6155	6160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922039
95	NC_010681	AGG	2	6	6226	6231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187922039
96	NC_010681	CGA	2	6	6245	6250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922039
97	NC_010681	GCG	2	6	6259	6264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922039
98	NC_010681	CGC	2	6	7759	7764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922040
99	NC_010681	CAG	2	6	7908	7913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922040
100	NC_010681	CGT	2	6	8008	8013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922040
101	NC_010681	CGC	2	6	8034	8039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922040
102	NC_010681	GAC	2	6	8178	8183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922040
103	NC_010681	GCT	2	6	8201	8206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922040
104	NC_010681	TCA	2	6	8269	8274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922040
105	NC_010681	CAC	2	6	8402	8407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187922040
106	NC_010681	GGA	2	6	8579	8584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187922040
107	NC_010681	CGG	2	6	8753	8758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922040
108	NC_010681	CGG	2	6	8761	8766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922040
109	NC_010681	ACA	2	6	8790	8795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187922040
110	NC_010681	CTG	2	6	8796	8801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922040
111	NC_010681	ACG	2	6	8898	8903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922040
112	NC_010681	TCG	3	9	8962	8970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922040
113	NC_010681	CGA	2	6	8996	9001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922040
114	NC_010681	GCG	2	6	9046	9051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922040
115	NC_010681	CGG	2	6	9107	9112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922040
116	NC_010681	GAA	2	6	9135	9140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922040
117	NC_010681	CGG	2	6	9158	9163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922040
118	NC_010681	CGG	2	6	9266	9271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922040
119	NC_010681	AGC	2	6	9336	9341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922040
120	NC_010681	GCA	2	6	9374	9379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922040
121	NC_010681	AAG	2	6	9621	9626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187922040
122	NC_010681	GCA	2	6	9658	9663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922040
123	NC_010681	CGG	2	6	9682	9687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922040
124	NC_010681	TGG	2	6	9733	9738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187922040
125	NC_010681	GTT	2	6	9905	9910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187922040
126	NC_010681	CAG	2	6	9989	9994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922040
127	NC_010681	GAC	2	6	10088	10093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922040
128	NC_010681	CGT	2	6	10172	10177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922040
129	NC_010681	CGG	2	6	10201	10206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922040
130	NC_010681	CGG	2	6	10210	10215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922040
131	NC_010681	AAC	2	6	10460	10465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187922041
132	NC_010681	TGA	2	6	10503	10508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187922041
133	NC_010681	TCG	2	6	10523	10528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922041
134	NC_010681	CGG	2	6	10638	10643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922041
135	NC_010681	CGG	2	6	10664	10669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922041
136	NC_010681	CGT	2	6	10671	10676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922041
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252	NC_010681	GGC	2	6	19111	19116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922047
253	NC_010681	GAG	2	6	19156	19161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187922047
254	NC_010681	TCT	2	6	19167	19172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187922047
255	NC_010681	CGA	2	6	19227	19232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922047
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257	NC_010681	ACG	2	6	19293	19298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922047
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371	NC_010681	TCG	2	6	29148	29153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922053
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373	NC_010681	CAC	2	6	29300	29305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187922053
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375	NC_010681	CTG	2	6	29433	29438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922053
376	NC_010681	CGC	2	6	29495	29500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922053
377	NC_010681	GAT	2	6	29632	29637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187922053
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380	NC_010681	TCA	2	6	30151	30156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187922054
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383	NC_010681	CGG	2	6	30275	30280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187922054
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400	NC_010681	CGA	2	6	31052	31057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922054
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497	NC_010681	CGC	2	6	36503	36508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187922059
498	NC_010681	CAA	2	6	36525	36530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187922059
499	NC_010681	CGT	2	6	36613	36618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187922059
500	NC_010681	AGC	2	6	36695	36700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187922059

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