MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum B str. Eklund 17B plasmid pCLL

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010680	ATTTAA	2	12	1229	1240	50 %	50 %	0 %	0 %	187935828
2	NC_010680	ATAAAA	2	12	1462	1473	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	187935828
3	NC_010680	ATCCTA	2	12	1804	1815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187935828
4	NC_010680	ATAATG	2	12	2257	2268	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	187935828
5	NC_010680	TGAAAA	2	12	3164	3175	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	187935828
6	NC_010680	AAATAA	2	12	3744	3755	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	187935809
7	NC_010680	TTTTGC	2	12	4053	4064	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	187935809
8	NC_010680	AGAATT	2	12	8341	8352	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	187935827
9	NC_010680	TAATGA	2	12	11528	11539	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	187935826
10	NC_010680	GGTGAA	2	12	12945	12956	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	187935801
11	NC_010680	AAAAGA	2	12	13049	13060	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	187935801
12	NC_010680	ATACAA	2	12	13105	13116	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	187935801
13	NC_010680	GAAAAA	2	12	14368	14379	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	187935831
14	NC_010680	ATAAAA	2	12	16753	16764	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	187935804
15	NC_010680	TTAAAT	2	12	26061	26072	50 %	50 %	0 %	0 %	187935807
16	NC_010680	TTTATC	2	12	28553	28564	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	187935807
17	NC_010680	AAATGA	2	12	29181	29192	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	187935837
18	NC_010680	TAACAT	2	12	29619	29630	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	187935837
19	NC_010680	ATAAAT	2	12	29657	29668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187935837
20	NC_010680	TAAAAA	2	12	29822	29833	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	187935837
21	NC_010680	AATAAA	2	12	30700	30711	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	187935837
22	NC_010680	CAAGCA	2	12	30856	30867	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	187935837
23	NC_010680	AGGAAC	2	12	32240	32251	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	187935837
24	NC_010680	TAGGTA	2	12	34036	34047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187935847
25	NC_010680	AAATAA	2	12	35233	35244	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	187935825
26	NC_010680	ACCATT	2	12	36831	36842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187935803
27	NC_010680	AGATAA	2	12	39730	39741	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	187935797
28	NC_010680	TGAATA	2	12	39771	39782	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	187935797
29	NC_010680	ATCTAA	2	12	40929	40940	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	187935844
30	NC_010680	AGCAAC	2	12	42458	42469	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	187935838
31	NC_010680	TATTAG	2	12	42978	42989	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	187935833
32	NC_010680	ATTTAA	2	12	43747	43758	50 %	50 %	0 %	0 %	187935833

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.