MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum B str. Eklund 17B plasmid pCLL

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010680	TTTAT	2	10	301	310	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010680	TAAGT	2	10	451	460	40 %	40 %	20 %	0 %	187935829
3	NC_010680	GAAAT	2	10	1074	1083	60 %	20 %	20 %	0 %	187935828
4	NC_010680	TAGAA	2	10	1661	1670	60 %	20 %	20 %	0 %	187935828
5	NC_010680	TGTTT	2	10	4161	4170	0 %	80 %	20 %	0 %	187935809
6	NC_010680	AATGA	2	10	4507	4516	60 %	20 %	20 %	0 %	187935809
7	NC_010680	TGAAA	2	10	5412	5421	60 %	20 %	20 %	0 %	187935805
8	NC_010680	AGAAA	2	10	6345	6354	80 %	0 %	20 %	0 %	187935815
9	NC_010680	TAAAT	2	10	6369	6378	60 %	40 %	0 %	0 %	187935815
10	NC_010680	ACTAA	2	10	6388	6397	60 %	20 %	0 %	20 %	187935815
11	NC_010680	CATTT	2	10	7083	7092	20 %	60 %	0 %	20 %	187935827
12	NC_010680	TTCAA	2	10	8672	8681	40 %	40 %	0 %	20 %	187935822
13	NC_010680	ATACT	2	10	9590	9599	40 %	40 %	0 %	20 %	187935817
14	NC_010680	GGAAT	2	10	9832	9841	40 %	20 %	40 %	0 %	187935817
15	NC_010680	AATAA	2	10	11070	11079	80 %	20 %	0 %	0 %	187935800
16	NC_010680	GAACA	2	10	12301	12310	60 %	0 %	20 %	20 %	187935801
17	NC_010680	GAAAA	2	10	12593	12602	80 %	0 %	20 %	0 %	187935801
18	NC_010680	AAAAT	2	10	12982	12991	80 %	20 %	0 %	0 %	187935801
19	NC_010680	AGTTA	2	10	15026	15035	40 %	40 %	20 %	0 %	187935841
20	NC_010680	ATAAA	2	10	15812	15821	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010680	ATAGT	2	10	16358	16367	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010680	ATTTA	2	10	16661	16670	40 %	60 %	0 %	0 %	187935804
23	NC_010680	AAATT	2	10	16864	16873	60 %	40 %	0 %	0 %	187935804
24	NC_010680	TTTGT	2	10	18212	18221	0 %	80 %	20 %	0 %	187935848
25	NC_010680	AAAAG	2	10	18496	18505	80 %	0 %	20 %	0 %	187935814
26	NC_010680	ATTAT	2	10	18534	18543	40 %	60 %	0 %	0 %	187935814
27	NC_010680	AATAA	2	10	18674	18683	80 %	20 %	0 %	0 %	187935808
28	NC_010680	TAAAG	2	10	19117	19126	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010680	ATTAT	2	10	19268	19277	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010680	TATAA	2	10	19299	19308	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010680	AAATT	2	10	19410	19419	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010680	ACAGT	2	10	20162	20171	40 %	20 %	20 %	20 %	187935798
33	NC_010680	AGTTA	2	10	20315	20324	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010680	TAAAA	2	10	20357	20366	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010680	ATAGA	2	10	20431	20440	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010680	TTATA	2	10	20908	20917	40 %	60 %	0 %	0 %	187935832
37	NC_010680	ATTTG	2	10	22798	22807	20 %	60 %	20 %	0 %	187935836
38	NC_010680	GTATT	2	10	23536	23545	20 %	60 %	20 %	0 %	187935824
39	NC_010680	ATATA	2	10	24192	24201	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010680	ATATA	2	10	24488	24497	60 %	40 %	0 %	0 %	187935839
41	NC_010680	AAAAT	2	10	24859	24868	80 %	20 %	0 %	0 %	187935839
42	NC_010680	TAATG	2	10	26672	26681	40 %	40 %	20 %	0 %	187935807
43	NC_010680	TAAAT	2	10	27212	27221	60 %	40 %	0 %	0 %	187935807
44	NC_010680	TTACA	2	10	27580	27589	40 %	40 %	0 %	20 %	187935807
45	NC_010680	TTAGT	2	10	27658	27667	20 %	60 %	20 %	0 %	187935807
46	NC_010680	AATCA	2	10	28974	28983	60 %	20 %	0 %	20 %	187935837
47	NC_010680	TAAAA	2	10	29775	29784	80 %	20 %	0 %	0 %	187935837
48	NC_010680	CTATA	2	10	29853	29862	40 %	40 %	0 %	20 %	187935837
49	NC_010680	ATATA	2	10	30891	30900	60 %	40 %	0 %	0 %	187935837
50	NC_010680	ATATT	2	10	31427	31436	40 %	60 %	0 %	0 %	187935837
51	NC_010680	AAGAA	2	10	33129	33138	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010680	GAAGC	2	10	33225	33234	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_010680	AAAAC	2	10	33271	33280	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_010680	ATTAT	2	10	34823	34832	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010680	ATTAA	2	10	35060	35069	60 %	40 %	0 %	0 %	187935825
56	NC_010680	TGAAT	2	10	35449	35458	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010680	TAAAT	2	10	36243	36252	60 %	40 %	0 %	0 %	187935803
58	NC_010680	TGTTT	2	10	36267	36276	0 %	80 %	20 %	0 %	187935803
59	NC_010680	TATGA	2	10	36712	36721	40 %	40 %	20 %	0 %	187935803
60	NC_010680	ATTTT	2	10	36739	36748	20 %	80 %	0 %	0 %	187935803
61	NC_010680	TCTAA	2	10	37621	37630	40 %	40 %	0 %	20 %	187935806
62	NC_010680	AATAA	2	10	38294	38303	80 %	20 %	0 %	0 %	187935806
63	NC_010680	GAAAT	2	10	38984	38993	60 %	20 %	20 %	0 %	187935818
64	NC_010680	ATAGC	2	10	39621	39630	40 %	20 %	20 %	20 %	187935797
65	NC_010680	AGAAA	2	10	41261	41270	80 %	0 %	20 %	0 %	187935844
66	NC_010680	ATTTA	2	10	41348	41357	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010680	GTCAA	2	10	41440	41449	40 %	20 %	20 %	20 %	187935845
68	NC_010680	TTAAA	2	10	42396	42405	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010680	GTAGA	2	10	42919	42928	40 %	20 %	40 %	0 %	187935838
70	NC_010680	GAAAA	2	10	42955	42964	80 %	0 %	20 %	0 %	187935833
71	NC_010680	TAAAT	2	10	43084	43093	60 %	40 %	0 %	0 %	187935833
72	NC_010680	AAATA	2	10	45451	45460	80 %	20 %	0 %	0 %	187935833
73	NC_010680	TAAAC	2	10	47552	47561	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.