MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum B str. Eklund 17B plasmid pCLL

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010680	TAAGT	2	10	451	460	40 %	40 %	20 %	0 %	187935829
2	NC_010680	GAAAT	2	10	1074	1083	60 %	20 %	20 %	0 %	187935828
3	NC_010680	TAGAA	2	10	1661	1670	60 %	20 %	20 %	0 %	187935828
4	NC_010680	TGTTT	2	10	4161	4170	0 %	80 %	20 %	0 %	187935809
5	NC_010680	AATGA	2	10	4507	4516	60 %	20 %	20 %	0 %	187935809
6	NC_010680	TGAAA	2	10	5412	5421	60 %	20 %	20 %	0 %	187935805
7	NC_010680	AGAAA	2	10	6345	6354	80 %	0 %	20 %	0 %	187935815
8	NC_010680	TAAAT	2	10	6369	6378	60 %	40 %	0 %	0 %	187935815
9	NC_010680	ACTAA	2	10	6388	6397	60 %	20 %	0 %	20 %	187935815
10	NC_010680	CATTT	2	10	7083	7092	20 %	60 %	0 %	20 %	187935827
11	NC_010680	TTCAA	2	10	8672	8681	40 %	40 %	0 %	20 %	187935822
12	NC_010680	ATACT	2	10	9590	9599	40 %	40 %	0 %	20 %	187935817
13	NC_010680	GGAAT	2	10	9832	9841	40 %	20 %	40 %	0 %	187935817
14	NC_010680	AATAA	2	10	11070	11079	80 %	20 %	0 %	0 %	187935800
15	NC_010680	GAACA	2	10	12301	12310	60 %	0 %	20 %	20 %	187935801
16	NC_010680	GAAAA	2	10	12593	12602	80 %	0 %	20 %	0 %	187935801
17	NC_010680	AAAAT	2	10	12982	12991	80 %	20 %	0 %	0 %	187935801
18	NC_010680	AGTTA	2	10	15026	15035	40 %	40 %	20 %	0 %	187935841
19	NC_010680	ATTTA	2	10	16661	16670	40 %	60 %	0 %	0 %	187935804
20	NC_010680	AAATT	2	10	16864	16873	60 %	40 %	0 %	0 %	187935804
21	NC_010680	TTTGT	2	10	18212	18221	0 %	80 %	20 %	0 %	187935848
22	NC_010680	AAAAG	2	10	18496	18505	80 %	0 %	20 %	0 %	187935814
23	NC_010680	ATTAT	2	10	18534	18543	40 %	60 %	0 %	0 %	187935814
24	NC_010680	AATAA	2	10	18674	18683	80 %	20 %	0 %	0 %	187935808
25	NC_010680	ACAGT	2	10	20162	20171	40 %	20 %	20 %	20 %	187935798
26	NC_010680	TTATA	2	10	20908	20917	40 %	60 %	0 %	0 %	187935832
27	NC_010680	ATTTG	2	10	22798	22807	20 %	60 %	20 %	0 %	187935836
28	NC_010680	GTATT	2	10	23536	23545	20 %	60 %	20 %	0 %	187935824
29	NC_010680	ATATA	2	10	24488	24497	60 %	40 %	0 %	0 %	187935839
30	NC_010680	AAAAT	2	10	24859	24868	80 %	20 %	0 %	0 %	187935839
31	NC_010680	TAATG	2	10	26672	26681	40 %	40 %	20 %	0 %	187935807
32	NC_010680	TAAAT	2	10	27212	27221	60 %	40 %	0 %	0 %	187935807
33	NC_010680	TTACA	2	10	27580	27589	40 %	40 %	0 %	20 %	187935807
34	NC_010680	TTAGT	2	10	27658	27667	20 %	60 %	20 %	0 %	187935807
35	NC_010680	AATCA	2	10	28974	28983	60 %	20 %	0 %	20 %	187935837
36	NC_010680	TAAAA	2	10	29775	29784	80 %	20 %	0 %	0 %	187935837
37	NC_010680	CTATA	2	10	29853	29862	40 %	40 %	0 %	20 %	187935837
38	NC_010680	ATATA	2	10	30891	30900	60 %	40 %	0 %	0 %	187935837
39	NC_010680	ATATT	2	10	31427	31436	40 %	60 %	0 %	0 %	187935837
40	NC_010680	ATTAA	2	10	35060	35069	60 %	40 %	0 %	0 %	187935825
41	NC_010680	TAAAT	2	10	36243	36252	60 %	40 %	0 %	0 %	187935803
42	NC_010680	TGTTT	2	10	36267	36276	0 %	80 %	20 %	0 %	187935803
43	NC_010680	TATGA	2	10	36712	36721	40 %	40 %	20 %	0 %	187935803
44	NC_010680	ATTTT	2	10	36739	36748	20 %	80 %	0 %	0 %	187935803
45	NC_010680	TCTAA	2	10	37621	37630	40 %	40 %	0 %	20 %	187935806
46	NC_010680	AATAA	2	10	38294	38303	80 %	20 %	0 %	0 %	187935806
47	NC_010680	GAAAT	2	10	38984	38993	60 %	20 %	20 %	0 %	187935818
48	NC_010680	ATAGC	2	10	39621	39630	40 %	20 %	20 %	20 %	187935797
49	NC_010680	AGAAA	2	10	41261	41270	80 %	0 %	20 %	0 %	187935844
50	NC_010680	GTCAA	2	10	41440	41449	40 %	20 %	20 %	20 %	187935845
51	NC_010680	GTAGA	2	10	42919	42928	40 %	20 %	40 %	0 %	187935838
52	NC_010680	GAAAA	2	10	42955	42964	80 %	0 %	20 %	0 %	187935833
53	NC_010680	TAAAT	2	10	43084	43093	60 %	40 %	0 %	0 %	187935833
54	NC_010680	AAATA	2	10	45451	45460	80 %	20 %	0 %	0 %	187935833

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.