MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum B str. Eklund 17B plasmid pCLL

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010680	AGA	2	6	617	622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010680	TAA	2	6	649	654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010680	TAT	2	6	5671	5676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010680	TTA	2	6	6432	6437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010680	GGT	2	6	9102	9107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010680	AGG	2	6	11378	11383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010680	TAA	2	6	14490	14495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010680	GCA	2	6	14636	14641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010680	TTA	2	6	14697	14702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010680	ATG	2	6	14790	14795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010680	TAA	2	6	14890	14895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010680	GAA	2	6	14915	14920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010680	ATA	2	6	14934	14939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010680	ATA	2	6	14951	14956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010680	TTA	2	6	14957	14962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010680	GGA	2	6	14976	14981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010680	GGA	2	6	15346	15351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010680	ACC	2	6	15842	15847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_010680	AGG	2	6	15892	15897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010680	GAG	2	6	16382	16387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010680	ATA	2	6	17635	17640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010680	AAT	2	6	17673	17678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010680	ATT	2	6	17812	17817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010680	TAC	2	6	18310	18315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010680	AAG	3	9	18372	18380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010680	GTA	2	6	18625	18630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010680	TAT	2	6	18650	18655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010680	AGG	2	6	18657	18662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010680	TAA	2	6	19049	19054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010680	AGT	2	6	19087	19092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010680	GTA	2	6	19188	19193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010680	GTA	2	6	19228	19233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010680	GAA	2	6	19387	19392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010680	AGG	2	6	19733	19738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010680	TTA	2	6	20199	20204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010680	GAA	2	6	20234	20239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010680	TAA	2	6	20467	20472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010680	TGA	2	6	20632	20637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010680	ATT	2	6	20639	20644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010680	AGA	2	6	20668	20673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010680	TAA	2	6	20723	20728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010680	AAT	3	9	20729	20737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010680	ATT	2	6	20766	20771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010680	TAA	3	9	20862	20870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010680	GAT	2	6	23240	23245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010680	TTG	2	6	23264	23269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010680	TCC	2	6	24164	24169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_010680	ATT	2	6	24214	24219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010680	TTA	2	6	24254	24259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010680	TAA	2	6	24340	24345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010680	AAT	2	6	25013	25018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010680	AGG	2	6	28666	28671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010680	GTT	2	6	32683	32688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010680	TTA	2	6	32713	32718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010680	AAT	2	6	32745	32750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010680	TAA	2	6	32766	32771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010680	ATA	2	6	32772	32777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010680	CAA	2	6	32784	32789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010680	ATG	2	6	32805	32810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010680	GAT	2	6	32859	32864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010680	ATT	2	6	32889	32894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010680	TAA	2	6	33032	33037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010680	TTA	2	6	33084	33089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010680	TAT	2	6	33090	33095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010680	TTA	2	6	33140	33145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010680	TAT	2	6	33317	33322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010680	TAA	2	6	33417	33422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010680	TTA	3	9	34182	34190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010680	GTA	2	6	34835	34840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010680	TAA	2	6	34893	34898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010680	GTT	2	6	34900	34905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010680	AAC	2	6	34912	34917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010680	TAT	2	6	34953	34958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010680	TTA	2	6	34982	34987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010680	GGA	2	6	34999	35004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010680	GAA	2	6	35354	35359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010680	TAA	2	6	35546	35551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010680	ATT	2	6	35745	35750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010680	ATA	2	6	35770	35775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010680	ATT	2	6	35885	35890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010680	TAA	2	6	35904	35909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010680	AGG	3	9	37333	37341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010680	AAG	2	6	37501	37506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010680	AGG	2	6	37517	37522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010680	GAA	2	6	38340	38345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010680	GTA	2	6	38457	38462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010680	TAA	2	6	38514	38519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010680	TTC	2	6	39885	39890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010680	CTT	2	6	39899	39904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010680	TAA	2	6	39933	39938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010680	TTA	2	6	40056	40061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010680	CTT	2	6	40068	40073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010680	TGT	2	6	40219	40224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010680	ATA	2	6	40225	40230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010680	GAT	2	6	40521	40526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010680	AAG	2	6	41294	41299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010680	CTT	2	6	41313	41318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010680	GAG	2	6	41420	41425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010680	AGG	2	6	41734	41739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010680	AGG	2	6	42415	42420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010680	AAT	2	6	47537	47542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.