MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum B str. Eklund 17B plasmid pCLL

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010680	TA	3	6	31	36	50 %	50 %	0 %	0 %	187935816
2	NC_010680	AT	3	6	105	110	50 %	50 %	0 %	0 %	187935816
3	NC_010680	TA	3	6	346	351	50 %	50 %	0 %	0 %	187935829
4	NC_010680	AT	3	6	398	403	50 %	50 %	0 %	0 %	187935829
5	NC_010680	AT	3	6	1022	1027	50 %	50 %	0 %	0 %	187935828
6	NC_010680	AT	4	8	1561	1568	50 %	50 %	0 %	0 %	187935828
7	NC_010680	TA	3	6	1996	2001	50 %	50 %	0 %	0 %	187935828
8	NC_010680	AT	4	8	3704	3711	50 %	50 %	0 %	0 %	187935809
9	NC_010680	AT	3	6	5979	5984	50 %	50 %	0 %	0 %	187935815
10	NC_010680	AT	4	8	5987	5994	50 %	50 %	0 %	0 %	187935815
11	NC_010680	AT	4	8	6011	6018	50 %	50 %	0 %	0 %	187935815
12	NC_010680	AT	3	6	6141	6146	50 %	50 %	0 %	0 %	187935815
13	NC_010680	CA	3	6	8083	8088	50 %	0 %	0 %	50 %	187935827
14	NC_010680	TA	4	8	8429	8436	50 %	50 %	0 %	0 %	187935822
15	NC_010680	AG	3	6	8698	8703	50 %	0 %	50 %	0 %	187935822
16	NC_010680	TG	3	6	8783	8788	0 %	50 %	50 %	0 %	187935822
17	NC_010680	TA	3	6	9487	9492	50 %	50 %	0 %	0 %	187935817
18	NC_010680	TA	3	6	10160	10165	50 %	50 %	0 %	0 %	187935817
19	NC_010680	AT	3	6	10752	10757	50 %	50 %	0 %	0 %	187935800
20	NC_010680	TA	3	6	11828	11833	50 %	50 %	0 %	0 %	187935796
21	NC_010680	GA	3	6	11973	11978	50 %	0 %	50 %	0 %	187935796
22	NC_010680	TA	3	6	12171	12176	50 %	50 %	0 %	0 %	187935801
23	NC_010680	TA	3	6	12223	12228	50 %	50 %	0 %	0 %	187935801
24	NC_010680	TA	3	6	12861	12866	50 %	50 %	0 %	0 %	187935801
25	NC_010680	GA	3	6	13166	13171	50 %	0 %	50 %	0 %	187935801
26	NC_010680	AT	3	6	13241	13246	50 %	50 %	0 %	0 %	187935801
27	NC_010680	GA	3	6	13269	13274	50 %	0 %	50 %	0 %	187935831
28	NC_010680	TA	4	8	13785	13792	50 %	50 %	0 %	0 %	187935831
29	NC_010680	TA	3	6	14184	14189	50 %	50 %	0 %	0 %	187935831
30	NC_010680	GA	3	6	14380	14385	50 %	0 %	50 %	0 %	187935831
31	NC_010680	TA	3	6	15007	15012	50 %	50 %	0 %	0 %	187935841
32	NC_010680	TA	3	6	15181	15186	50 %	50 %	0 %	0 %	187935841
33	NC_010680	AT	3	6	16049	16054	50 %	50 %	0 %	0 %	187935821
34	NC_010680	AT	3	6	16090	16095	50 %	50 %	0 %	0 %	187935821
35	NC_010680	AT	4	8	16166	16173	50 %	50 %	0 %	0 %	187935821
36	NC_010680	AT	3	6	16460	16465	50 %	50 %	0 %	0 %	187935823
37	NC_010680	AG	3	6	16711	16716	50 %	0 %	50 %	0 %	187935804
38	NC_010680	AT	3	6	16995	17000	50 %	50 %	0 %	0 %	187935810
39	NC_010680	TA	4	8	18074	18081	50 %	50 %	0 %	0 %	187935848
40	NC_010680	AT	3	6	18111	18116	50 %	50 %	0 %	0 %	187935848
41	NC_010680	AT	3	6	18555	18560	50 %	50 %	0 %	0 %	187935814
42	NC_010680	AT	3	6	18782	18787	50 %	50 %	0 %	0 %	187935808
43	NC_010680	TA	3	6	18939	18944	50 %	50 %	0 %	0 %	187935808
44	NC_010680	GA	3	6	20110	20115	50 %	0 %	50 %	0 %	187935798
45	NC_010680	AT	3	6	20877	20882	50 %	50 %	0 %	0 %	187935832
46	NC_010680	AT	3	6	20947	20952	50 %	50 %	0 %	0 %	187935832
47	NC_010680	CT	3	6	21265	21270	0 %	50 %	0 %	50 %	187935832
48	NC_010680	AT	3	6	21467	21472	50 %	50 %	0 %	0 %	187935832
49	NC_010680	TA	3	6	21539	21544	50 %	50 %	0 %	0 %	187935832
50	NC_010680	AT	3	6	21847	21852	50 %	50 %	0 %	0 %	187935832
51	NC_010680	TA	3	6	22085	22090	50 %	50 %	0 %	0 %	187935832
52	NC_010680	TG	3	6	22143	22148	0 %	50 %	50 %	0 %	187935832
53	NC_010680	AT	3	6	22407	22412	50 %	50 %	0 %	0 %	187935832
54	NC_010680	AT	3	6	22512	22517	50 %	50 %	0 %	0 %	187935832
55	NC_010680	TA	3	6	22813	22818	50 %	50 %	0 %	0 %	187935836
56	NC_010680	AT	3	6	23068	23073	50 %	50 %	0 %	0 %	187935836
57	NC_010680	TA	3	6	23365	23370	50 %	50 %	0 %	0 %	187935824
58	NC_010680	TA	3	6	23617	23622	50 %	50 %	0 %	0 %	187935824
59	NC_010680	TA	3	6	23744	23749	50 %	50 %	0 %	0 %	187935824
60	NC_010680	AT	3	6	23911	23916	50 %	50 %	0 %	0 %	187935824
61	NC_010680	AT	3	6	24002	24007	50 %	50 %	0 %	0 %	187935824
62	NC_010680	AG	3	6	24429	24434	50 %	0 %	50 %	0 %	187935839
63	NC_010680	AT	3	6	24472	24477	50 %	50 %	0 %	0 %	187935839
64	NC_010680	AG	3	6	24584	24589	50 %	0 %	50 %	0 %	187935839
65	NC_010680	AT	3	6	24590	24595	50 %	50 %	0 %	0 %	187935839
66	NC_010680	TA	3	6	24661	24666	50 %	50 %	0 %	0 %	187935839
67	NC_010680	TA	4	8	24779	24786	50 %	50 %	0 %	0 %	187935839
68	NC_010680	TA	3	6	24853	24858	50 %	50 %	0 %	0 %	187935839
69	NC_010680	AG	3	6	25190	25195	50 %	0 %	50 %	0 %	187935807
70	NC_010680	AT	3	6	25248	25253	50 %	50 %	0 %	0 %	187935807
71	NC_010680	AT	3	6	25394	25399	50 %	50 %	0 %	0 %	187935807
72	NC_010680	AT	3	6	26050	26055	50 %	50 %	0 %	0 %	187935807
73	NC_010680	AG	3	6	26748	26753	50 %	0 %	50 %	0 %	187935807
74	NC_010680	AT	3	6	27018	27023	50 %	50 %	0 %	0 %	187935807
75	NC_010680	AT	3	6	27199	27204	50 %	50 %	0 %	0 %	187935807
76	NC_010680	AT	4	8	27337	27344	50 %	50 %	0 %	0 %	187935807
77	NC_010680	AT	3	6	27952	27957	50 %	50 %	0 %	0 %	187935807
78	NC_010680	AT	3	6	28092	28097	50 %	50 %	0 %	0 %	187935807
79	NC_010680	AT	3	6	28178	28183	50 %	50 %	0 %	0 %	187935807
80	NC_010680	AT	4	8	28285	28292	50 %	50 %	0 %	0 %	187935807
81	NC_010680	AT	3	6	28432	28437	50 %	50 %	0 %	0 %	187935807
82	NC_010680	AT	3	6	28507	28512	50 %	50 %	0 %	0 %	187935807
83	NC_010680	AT	3	6	28593	28598	50 %	50 %	0 %	0 %	187935807
84	NC_010680	AT	3	6	28937	28942	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
85	NC_010680	TA	3	6	29486	29491	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
86	NC_010680	AT	4	8	29633	29640	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
87	NC_010680	TA	3	6	29723	29728	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
88	NC_010680	AT	3	6	29876	29881	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
89	NC_010680	TA	3	6	29972	29977	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
90	NC_010680	TA	3	6	30121	30126	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
91	NC_010680	AT	3	6	30527	30532	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
92	NC_010680	TA	3	6	30547	30552	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
93	NC_010680	AT	3	6	30690	30695	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
94	NC_010680	TA	3	6	31105	31110	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
95	NC_010680	TA	3	6	31672	31677	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
96	NC_010680	AT	3	6	31900	31905	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
97	NC_010680	AT	3	6	32004	32009	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
98	NC_010680	TA	3	6	32077	32082	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
99	NC_010680	TA	3	6	32096	32101	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
100	NC_010680	TA	3	6	32176	32181	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
101	NC_010680	AT	3	6	32272	32277	50 %	50 %	0 %	0 %	187935837
102	NC_010680	AT	3	6	33473	33478	50 %	50 %	0 %	0 %	187935847
103	NC_010680	AT	5	10	33826	33835	50 %	50 %	0 %	0 %	187935847
104	NC_010680	TA	3	6	34057	34062	50 %	50 %	0 %	0 %	187935847
105	NC_010680	AT	3	6	34064	34069	50 %	50 %	0 %	0 %	187935847
106	NC_010680	AT	3	6	34268	34273	50 %	50 %	0 %	0 %	187935830
107	NC_010680	AT	3	6	34367	34372	50 %	50 %	0 %	0 %	187935830
108	NC_010680	TA	3	6	34505	34510	50 %	50 %	0 %	0 %	187935830
109	NC_010680	AT	3	6	34542	34547	50 %	50 %	0 %	0 %	187935830
110	NC_010680	AT	3	6	35101	35106	50 %	50 %	0 %	0 %	187935825
111	NC_010680	AT	3	6	35117	35122	50 %	50 %	0 %	0 %	187935825
112	NC_010680	TA	3	6	36017	36022	50 %	50 %	0 %	0 %	187935803
113	NC_010680	TA	3	6	36221	36226	50 %	50 %	0 %	0 %	187935803
114	NC_010680	AG	3	6	36261	36266	50 %	0 %	50 %	0 %	187935803
115	NC_010680	TA	3	6	36419	36424	50 %	50 %	0 %	0 %	187935803
116	NC_010680	AT	4	8	36683	36690	50 %	50 %	0 %	0 %	187935803
117	NC_010680	AG	3	6	36728	36733	50 %	0 %	50 %	0 %	187935803
118	NC_010680	TA	3	6	36749	36754	50 %	50 %	0 %	0 %	187935803
119	NC_010680	AT	4	8	37646	37653	50 %	50 %	0 %	0 %	187935806
120	NC_010680	TA	3	6	38009	38014	50 %	50 %	0 %	0 %	187935806
121	NC_010680	AT	3	6	38804	38809	50 %	50 %	0 %	0 %	187935818
122	NC_010680	AT	3	6	38832	38837	50 %	50 %	0 %	0 %	187935818
123	NC_010680	TA	3	6	39089	39094	50 %	50 %	0 %	0 %	187935818
124	NC_010680	AT	3	6	39147	39152	50 %	50 %	0 %	0 %	187935818
125	NC_010680	AT	3	6	40739	40744	50 %	50 %	0 %	0 %	187935844
126	NC_010680	TA	3	6	41616	41621	50 %	50 %	0 %	0 %	187935845
127	NC_010680	AT	4	8	41637	41644	50 %	50 %	0 %	0 %	187935845
128	NC_010680	AT	3	6	41809	41814	50 %	50 %	0 %	0 %	187935843
129	NC_010680	AT	3	6	41832	41837	50 %	50 %	0 %	0 %	187935843
130	NC_010680	TA	3	6	42042	42047	50 %	50 %	0 %	0 %	187935843
131	NC_010680	AT	3	6	42186	42191	50 %	50 %	0 %	0 %	187935813
132	NC_010680	AT	3	6	43893	43898	50 %	50 %	0 %	0 %	187935833
133	NC_010680	AT	3	6	44214	44219	50 %	50 %	0 %	0 %	187935833
134	NC_010680	TA	3	6	44310	44315	50 %	50 %	0 %	0 %	187935833
135	NC_010680	TA	3	6	44591	44596	50 %	50 %	0 %	0 %	187935833
136	NC_010680	AT	3	6	44733	44738	50 %	50 %	0 %	0 %	187935833
137	NC_010680	GA	3	6	46872	46877	50 %	0 %	50 %	0 %	187935833

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.