MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Burkholderia phytofirmans PsJN plasmid pBPHYT01

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010679	GCTCCG	2	12	1506	1517	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	187921869
2	NC_010679	GTAAGA	2	12	5596	5607	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187921872
3	NC_010679	GTGAGC	2	12	17494	17505	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	187921882
4	NC_010679	GCGCCG	2	12	19826	19837	0 %	0 %	50 %	50 %	187921885
5	NC_010679	TCATCG	2	12	23130	23141	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	187921891
6	NC_010679	AAAATG	2	12	25228	25239	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010679	CGTTGT	2	12	25695	25706	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	187921896
8	NC_010679	GCGTCA	2	12	29810	29821	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	187921900
9	NC_010679	TGCGAT	2	12	36460	36471	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	187921916
10	NC_010679	AACGGC	2	12	39580	39591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921923
11	NC_010679	GATTGA	2	12	42605	42616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187921928
12	NC_010679	ACGGCA	2	12	44707	44718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921933
13	NC_010679	CCTACT	2	12	49398	49409	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	187921943
14	NC_010679	AACACG	2	12	52794	52805	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010679	CAGGTA	2	12	53700	53711	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	187921949
16	NC_010679	CGTGCG	2	12	55087	55098	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	187921950
17	NC_010679	ACGCCG	2	12	55892	55903	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	187921950
18	NC_010679	CATCGA	2	12	57548	57559	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	187921951
19	NC_010679	AGCGGC	2	12	59293	59304	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	187921955
20	NC_010679	GCGTTG	2	12	62694	62705	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	187921962
21	NC_010679	AGCCGA	2	12	68827	68838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921967
22	NC_010679	CTACAC	2	12	71896	71907	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	187921968
23	NC_010679	CGATGC	2	12	79778	79789	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	187921976
24	NC_010679	CGGCAA	2	12	81556	81567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921977
25	NC_010679	GCCGAA	2	12	81868	81879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187921978
26	NC_010679	AGGCAG	2	12	83473	83484	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	187921979
27	NC_010679	GCGCAC	2	12	84513	84524	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	187921980
28	NC_010679	GTTCGC	2	12	84903	84914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187921981
29	NC_010679	CGGTGC	2	12	85130	85141	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	187921981
30	NC_010679	ACATGA	2	12	85752	85763	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187921982
31	NC_010679	GGCGAC	2	12	87112	87123	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	187921984
32	NC_010679	GGAAAA	2	12	90089	90100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187921985
33	NC_010679	CGCCGG	2	12	91746	91757	0 %	0 %	50 %	50 %	187921988
34	NC_010679	CGCTCA	2	12	92689	92700	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	187921989
35	NC_010679	CGCGAG	2	12	98864	98875	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	187921995
36	NC_010679	CGATGG	2	12	98989	99000	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	187921995
37	NC_010679	GCGTTT	2	12	105923	105934	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	187922008
38	NC_010679	TTGACC	2	12	105982	105993	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	187922008
39	NC_010679	ACCGCC	2	12	114577	114588	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_010679	TTTCGG	2	12	115760	115771	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	187922025
41	NC_010679	CTACTG	2	12	118394	118405	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.