MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia phytofirmans PsJN plasmid pBPHYT01

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010679	GCGCC	2	10	16811	16820	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2	NC_010679	CCGCG	2	10	20121	20130	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3	NC_010679	CGGCG	2	10	21341	21350	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4	NC_010679	ATTAA	2	10	21378	21387	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010679	GTAGA	2	10	21471	21480	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010679	GAAGC	2	10	23191	23200	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_010679	GCTTC	2	10	32649	32658	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_010679	GCCCG	2	10	38674	38683	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9	NC_010679	CCCTA	2	10	41737	41746	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
10	NC_010679	CCCTA	2	10	45354	45363	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
11	NC_010679	ACCGC	2	10	49582	49591	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_010679	CGGGC	2	10	49606	49615	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_010679	CCCTA	2	10	49985	49994	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
14	NC_010679	ACCGC	2	10	51883	51892	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_010679	CGGGC	2	10	51907	51916	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16	NC_010679	CCCTA	2	10	52286	52295	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
17	NC_010679	TCGGA	2	10	59071	59080	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_010679	ACCGC	2	10	59962	59971	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_010679	CGGGC	2	10	59986	59995	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
20	NC_010679	CCCTA	2	10	60365	60374	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
21	NC_010679	CGGGC	2	10	62640	62649	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_010679	TCGCT	2	10	98603	98612	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_010679	GTTGC	2	10	104988	104997	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_010679	AACGC	2	10	108392	108401	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_010679	CAAAT	2	10	114331	114340	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_010679	CGGCC	2	10	114525	114534	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27	NC_010679	ACGGC	2	10	121016	121025	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.