MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Burkholderia phytofirmans PsJN plasmid pBPHYT01

Total Repeats: 403

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010679	GCCG	2	8	295	302	0 %	0 %	50 %	50 %	187921868
2	NC_010679	ACGG	2	8	494	501	25 %	0 %	50 %	25 %	187921868
3	NC_010679	TAAC	2	8	586	593	50 %	25 %	0 %	25 %	187921868
4	NC_010679	CGGC	2	8	1095	1102	0 %	0 %	50 %	50 %	187921869
5	NC_010679	CAAC	2	8	1449	1456	50 %	0 %	0 %	50 %	187921869
6	NC_010679	GCCG	2	8	1954	1961	0 %	0 %	50 %	50 %	187921869
7	NC_010679	GACG	2	8	2050	2057	25 %	0 %	50 %	25 %	187921869
8	NC_010679	GCCT	2	8	2636	2643	0 %	25 %	25 %	50 %	187921870
9	NC_010679	GCCG	2	8	2717	2724	0 %	0 %	50 %	50 %	187921870
10	NC_010679	CTTT	2	8	3005	3012	0 %	75 %	0 %	25 %	187921870
11	NC_010679	TACC	2	8	3206	3213	25 %	25 %	0 %	50 %	187921870
12	NC_010679	ACGA	2	8	3286	3293	50 %	0 %	25 %	25 %	187921870
13	NC_010679	GCTT	2	8	3429	3436	0 %	50 %	25 %	25 %	187921870
14	NC_010679	GTCA	2	8	4002	4009	25 %	25 %	25 %	25 %	187921871
15	NC_010679	CCGA	2	8	4530	4537	25 %	0 %	25 %	50 %	187921871
16	NC_010679	CGTG	2	8	4748	4755	0 %	25 %	50 %	25 %	187921872
17	NC_010679	AGAA	2	8	4840	4847	75 %	0 %	25 %	0 %	187921872
18	NC_010679	ACGG	2	8	4905	4912	25 %	0 %	50 %	25 %	187921872
19	NC_010679	TCGC	2	8	5060	5067	0 %	25 %	25 %	50 %	187921872
20	NC_010679	ACGA	2	8	5088	5095	50 %	0 %	25 %	25 %	187921872
21	NC_010679	GCTC	2	8	6019	6026	0 %	25 %	25 %	50 %	187921872
22	NC_010679	GCTC	2	8	6107	6114	0 %	25 %	25 %	50 %	187921872
23	NC_010679	CGGA	2	8	6391	6398	25 %	0 %	50 %	25 %	187921872
24	NC_010679	AGGA	2	8	6873	6880	50 %	0 %	50 %	0 %	187921873
25	NC_010679	GGCG	2	8	6949	6956	0 %	0 %	75 %	25 %	187921873
26	NC_010679	CGGC	2	8	7863	7870	0 %	0 %	50 %	50 %	187921874
27	NC_010679	CAGG	2	8	8121	8128	25 %	0 %	50 %	25 %	187921874
28	NC_010679	GGAC	2	8	8152	8159	25 %	0 %	50 %	25 %	187921874
29	NC_010679	GGCA	2	8	8446	8453	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_010679	TGCC	2	8	8465	8472	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_010679	GTTG	2	8	8856	8863	0 %	50 %	50 %	0 %	187921875
32	NC_010679	CAGT	2	8	8888	8895	25 %	25 %	25 %	25 %	187921875
33	NC_010679	TCGC	2	8	8970	8977	0 %	25 %	25 %	50 %	187921875
34	NC_010679	CAAC	2	8	9031	9038	50 %	0 %	0 %	50 %	187921875
35	NC_010679	TCAG	2	8	9561	9568	25 %	25 %	25 %	25 %	187921875
36	NC_010679	CACT	2	8	9919	9926	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_010679	TGCC	2	8	10026	10033	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010679	CCGG	2	8	10190	10197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010679	CCGT	2	8	11188	11195	0 %	25 %	25 %	50 %	187921877
40	NC_010679	TGGC	2	8	11225	11232	0 %	25 %	50 %	25 %	187921877
41	NC_010679	TCAA	2	8	12026	12033	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_010679	AAGT	2	8	12689	12696	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010679	AATA	2	8	13287	13294	75 %	25 %	0 %	0 %	187921879
44	NC_010679	CATT	2	8	13737	13744	25 %	50 %	0 %	25 %	187921879
45	NC_010679	TGGT	2	8	14363	14370	0 %	50 %	50 %	0 %	187921880
46	NC_010679	GCAA	2	8	14396	14403	50 %	0 %	25 %	25 %	187921880
47	NC_010679	TCCA	2	8	14610	14617	25 %	25 %	0 %	50 %	187921880
48	NC_010679	TCGT	2	8	15149	15156	0 %	50 %	25 %	25 %	187921881
49	NC_010679	GGCC	2	8	15327	15334	0 %	0 %	50 %	50 %	187921881
50	NC_010679	GGTC	2	8	15771	15778	0 %	25 %	50 %	25 %	187921881
51	NC_010679	GGCC	2	8	16066	16073	0 %	0 %	50 %	50 %	187921881
52	NC_010679	CAAG	2	8	16086	16093	50 %	0 %	25 %	25 %	187921881
53	NC_010679	AATT	2	8	16753	16760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010679	GCCT	2	8	17256	17263	0 %	25 %	25 %	50 %	187921882
55	NC_010679	AGGC	2	8	18048	18055	25 %	0 %	50 %	25 %	187921884
56	NC_010679	GGCC	2	8	19074	19081	0 %	0 %	50 %	50 %	187921885
57	NC_010679	GTGG	2	8	19153	19160	0 %	25 %	75 %	0 %	187921885
58	NC_010679	GGCC	2	8	19370	19377	0 %	0 %	50 %	50 %	187921885
59	NC_010679	GCAC	2	8	19476	19483	25 %	0 %	25 %	50 %	187921885
60	NC_010679	GCGG	2	8	20188	20195	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61	NC_010679	GCCG	2	8	20528	20535	0 %	0 %	50 %	50 %	187921886
62	NC_010679	CCGA	2	8	20965	20972	25 %	0 %	25 %	50 %	187921887
63	NC_010679	CCAC	2	8	21256	21263	25 %	0 %	0 %	75 %	187921887
64	NC_010679	AGCA	2	8	21794	21801	50 %	0 %	25 %	25 %	187921888
65	NC_010679	TGCG	2	8	21861	21868	0 %	25 %	50 %	25 %	187921888
66	NC_010679	CTGC	2	8	21910	21917	0 %	25 %	25 %	50 %	187921888
67	NC_010679	CAGA	2	8	22179	22186	50 %	0 %	25 %	25 %	187921889
68	NC_010679	ATGA	2	8	22278	22285	50 %	25 %	25 %	0 %	187921889
69	NC_010679	CAGA	2	8	22447	22454	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_010679	CGAA	2	8	23093	23100	50 %	0 %	25 %	25 %	187921891
71	NC_010679	CAGA	2	8	23205	23212	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_010679	ATTC	2	8	23354	23361	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010679	GACC	2	8	23615	23622	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_010679	AAGC	2	8	23645	23652	50 %	0 %	25 %	25 %	187921892
75	NC_010679	AGGC	2	8	23933	23940	25 %	0 %	50 %	25 %	187921892
76	NC_010679	GCGG	2	8	24017	24024	0 %	0 %	75 %	25 %	187921892
77	NC_010679	TGAG	2	8	24152	24159	25 %	25 %	50 %	0 %	187921892
78	NC_010679	ACGC	2	8	24203	24210	25 %	0 %	25 %	50 %	187921892
79	NC_010679	CGCC	2	8	24402	24409	0 %	0 %	25 %	75 %	187921893
80	NC_010679	TATC	2	8	24627	24634	25 %	50 %	0 %	25 %	187921893
81	NC_010679	TGCA	2	8	24661	24668	25 %	25 %	25 %	25 %	187921893
82	NC_010679	ATGG	2	8	26012	26019	25 %	25 %	50 %	0 %	187921896
83	NC_010679	TGGA	2	8	26334	26341	25 %	25 %	50 %	0 %	187921896
84	NC_010679	AGCG	2	8	26574	26581	25 %	0 %	50 %	25 %	187921896
85	NC_010679	AAAC	2	8	26635	26642	75 %	0 %	0 %	25 %	187921896
86	NC_010679	GCTG	2	8	26783	26790	0 %	25 %	50 %	25 %	187921896
87	NC_010679	GCCA	2	8	26795	26802	25 %	0 %	25 %	50 %	187921896
88	NC_010679	GCCG	2	8	27957	27964	0 %	0 %	50 %	50 %	187921898
89	NC_010679	CCGG	2	8	28248	28255	0 %	0 %	50 %	50 %	187921898
90	NC_010679	CCGG	2	8	28379	28386	0 %	0 %	50 %	50 %	187921898
91	NC_010679	CGTT	2	8	28543	28550	0 %	50 %	25 %	25 %	187921898
92	NC_010679	CTAT	2	8	28890	28897	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_010679	CATC	2	8	29216	29223	25 %	25 %	0 %	50 %	187921900
94	NC_010679	AGCG	2	8	29373	29380	25 %	0 %	50 %	25 %	187921900
95	NC_010679	ACGA	2	8	29677	29684	50 %	0 %	25 %	25 %	187921900
96	NC_010679	CGCT	2	8	30534	30541	0 %	25 %	25 %	50 %	187921901
97	NC_010679	GGCC	2	8	30580	30587	0 %	0 %	50 %	50 %	187921901
98	NC_010679	CGCC	2	8	30639	30646	0 %	0 %	25 %	75 %	187921901
99	NC_010679	TTGT	2	8	31132	31139	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010679	GATT	2	8	31238	31245	25 %	50 %	25 %	0 %	187921902
101	NC_010679	GCGA	2	8	31324	31331	25 %	0 %	50 %	25 %	187921902
102	NC_010679	TTGC	2	8	32162	32169	0 %	50 %	25 %	25 %	187921905
103	NC_010679	CGTC	2	8	33213	33220	0 %	25 %	25 %	50 %	187921909
104	NC_010679	CCGG	2	8	33700	33707	0 %	0 %	50 %	50 %	187921910
105	NC_010679	GATA	2	8	33768	33775	50 %	25 %	25 %	0 %	187921910
106	NC_010679	TCGC	2	8	33868	33875	0 %	25 %	25 %	50 %	187921910
107	NC_010679	CTCG	2	8	33928	33935	0 %	25 %	25 %	50 %	187921910
108	NC_010679	GTTG	2	8	34263	34270	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010679	CTGG	2	8	34302	34309	0 %	25 %	50 %	25 %	187921912
110	NC_010679	GCGT	2	8	34592	34599	0 %	25 %	50 %	25 %	187921912
111	NC_010679	GGTT	2	8	34618	34625	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010679	GACG	2	8	34742	34749	25 %	0 %	50 %	25 %	187921913
113	NC_010679	GAAC	2	8	34976	34983	50 %	0 %	25 %	25 %	187921913
114	NC_010679	GCCA	2	8	35108	35115	25 %	0 %	25 %	50 %	187921914
115	NC_010679	GCCG	2	8	35387	35394	0 %	0 %	50 %	50 %	187921914
116	NC_010679	GGCG	2	8	35569	35576	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_010679	CGGG	2	8	35725	35732	0 %	0 %	75 %	25 %	187921915
118	NC_010679	GCAA	2	8	36440	36447	50 %	0 %	25 %	25 %	187921916
119	NC_010679	CGGC	2	8	36560	36567	0 %	0 %	50 %	50 %	187921916
120	NC_010679	TCAA	2	8	36739	36746	50 %	25 %	0 %	25 %	187921917
121	NC_010679	CCGC	2	8	37219	37226	0 %	0 %	25 %	75 %	187921918
122	NC_010679	CACC	2	8	37674	37681	25 %	0 %	0 %	75 %	187921919
123	NC_010679	GCGA	2	8	38223	38230	25 %	0 %	50 %	25 %	187921921
124	NC_010679	GCTC	2	8	38472	38479	0 %	25 %	25 %	50 %	187921922
125	NC_010679	GGCG	2	8	38726	38733	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
126	NC_010679	TCGT	2	8	39063	39070	0 %	50 %	25 %	25 %	187921923
127	NC_010679	AATG	2	8	39187	39194	50 %	25 %	25 %	0 %	187921923
128	NC_010679	ATCC	2	8	39201	39208	25 %	25 %	0 %	50 %	187921923
129	NC_010679	AACG	2	8	39339	39346	50 %	0 %	25 %	25 %	187921923
130	NC_010679	CCGA	2	8	39664	39671	25 %	0 %	25 %	50 %	187921923
131	NC_010679	TTCG	2	8	39798	39805	0 %	50 %	25 %	25 %	187921923
132	NC_010679	TTCC	2	8	40354	40361	0 %	50 %	0 %	50 %	187921923
133	NC_010679	ATGT	2	8	40432	40439	25 %	50 %	25 %	0 %	187921923
134	NC_010679	CGGC	2	8	40444	40451	0 %	0 %	50 %	50 %	187921923
135	NC_010679	CGGG	2	8	40513	40520	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_010679	CGAG	2	8	41105	41112	25 %	0 %	50 %	25 %	187921925
137	NC_010679	CGGC	2	8	41227	41234	0 %	0 %	50 %	50 %	187921925
138	NC_010679	TCGC	2	8	41252	41259	0 %	25 %	25 %	50 %	187921925
139	NC_010679	CGGC	2	8	41693	41700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_010679	CAAT	2	8	41753	41760	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_010679	TTCG	2	8	41906	41913	0 %	50 %	25 %	25 %	187921926
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143	NC_010679	CCGC	2	8	43130	43137	0 %	0 %	25 %	75 %	187921930
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.