MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Burkholderia phytofirmans PsJN plasmid pBPHYT01

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010679	G	6	6	2296	2301	0 %	0 %	100 %	0 %	187921869
2	NC_010679	A	6	6	2428	2433	100 %	0 %	0 %	0 %	187921870
3	NC_010679	C	6	6	3882	3887	0 %	0 %	0 %	100 %	187921871
4	NC_010679	G	6	6	9641	9646	0 %	0 %	100 %	0 %	187921875
5	NC_010679	T	7	7	12108	12114	0 %	100 %	0 %	0 %	187921878
6	NC_010679	T	6	6	12258	12263	0 %	100 %	0 %	0 %	187921878
7	NC_010679	C	6	6	13439	13444	0 %	0 %	0 %	100 %	187921879
8	NC_010679	T	6	6	16473	16478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010679	G	6	6	20167	20172	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010679	G	7	7	22869	22875	0 %	0 %	100 %	0 %	187921891
11	NC_010679	T	6	6	25779	25784	0 %	100 %	0 %	0 %	187921896
12	NC_010679	T	6	6	28524	28529	0 %	100 %	0 %	0 %	187921898
13	NC_010679	A	6	6	36842	36847	100 %	0 %	0 %	0 %	187921917
14	NC_010679	A	6	6	38847	38852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010679	C	6	6	40924	40929	0 %	0 %	0 %	100 %	187921925
16	NC_010679	T	6	6	41018	41023	0 %	100 %	0 %	0 %	187921925
17	NC_010679	T	6	6	45686	45691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010679	T	6	6	47070	47075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010679	T	6	6	47356	47361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010679	A	7	7	47497	47503	100 %	0 %	0 %	0 %	187921938
21	NC_010679	T	6	6	50806	50811	0 %	100 %	0 %	0 %	187921946
22	NC_010679	A	6	6	61573	61578	100 %	0 %	0 %	0 %	187921960
23	NC_010679	T	8	8	62395	62402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010679	T	6	6	63091	63096	0 %	100 %	0 %	0 %	187921962
25	NC_010679	A	6	6	64798	64803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010679	A	6	6	67696	67701	100 %	0 %	0 %	0 %	187921967
27	NC_010679	G	6	6	68784	68789	0 %	0 %	100 %	0 %	187921967
28	NC_010679	T	7	7	69047	69053	0 %	100 %	0 %	0 %	187921967
29	NC_010679	A	6	6	71144	71149	100 %	0 %	0 %	0 %	187921967
30	NC_010679	G	6	6	71239	71244	0 %	0 %	100 %	0 %	187921967
31	NC_010679	T	7	7	73228	73234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010679	A	6	6	77455	77460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010679	G	6	6	78390	78395	0 %	0 %	100 %	0 %	187921974
34	NC_010679	A	6	6	78491	78496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010679	C	6	6	79678	79683	0 %	0 %	0 %	100 %	187921976
36	NC_010679	T	6	6	82755	82760	0 %	100 %	0 %	0 %	187921978
37	NC_010679	A	6	6	91604	91609	100 %	0 %	0 %	0 %	187921988
38	NC_010679	A	6	6	96627	96632	100 %	0 %	0 %	0 %	187921991
39	NC_010679	A	6	6	97625	97630	100 %	0 %	0 %	0 %	187921993
40	NC_010679	C	6	6	102347	102352	0 %	0 %	0 %	100 %	187922001
41	NC_010679	A	6	6	102794	102799	100 %	0 %	0 %	0 %	187922003
42	NC_010679	T	7	7	102989	102995	0 %	100 %	0 %	0 %	187922003
43	NC_010679	T	7	7	105094	105100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010679	A	7	7	105175	105181	100 %	0 %	0 %	0 %	187922007
45	NC_010679	T	7	7	107499	107505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010679	T	6	6	107762	107767	0 %	100 %	0 %	0 %	187922011
47	NC_010679	T	6	6	110486	110491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010679	T	8	8	110879	110886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010679	A	6	6	111158	111163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010679	A	7	7	112596	112602	100 %	0 %	0 %	0 %	187922022
51	NC_010679	C	7	7	113698	113704	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52	NC_010679	T	6	6	113878	113883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010679	G	6	6	114606	114611	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010679	T	6	6	117011	117016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010679	T	6	6	117110	117115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010679	T	7	7	117909	117915	0 %	100 %	0 %	0 %	187922030
57	NC_010679	C	6	6	118085	118090	0 %	0 %	0 %	100 %	187922030
58	NC_010679	A	8	8	118335	118342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010679	T	7	7	120105	120111	0 %	100 %	0 %	0 %	187922033

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.