MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12J chromosome 2

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010678	GGCGAG	2	12	4063	4074	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_010678	AATCGC	2	12	38455	38466	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010678	GTGCCG	2	12	97446	97457	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010678	CCCATC	2	12	127467	127478	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_010678	CGGCAT	2	12	138640	138651	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010678	TGTCGG	2	12	138983	138994	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_010678	GCGCCG	2	12	140792	140803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_010678	GCCGGA	2	12	140804	140815	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010678	TCACGC	2	12	172382	172393	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010678	CGCGTG	2	12	217218	217229	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010678	ACGCCG	2	12	227708	227719	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_010678	GTTTTG	2	12	233110	233121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010678	ACCGAT	2	12	238931	238942	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010678	GTTCAA	2	12	269639	269650	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_010678	AAGGGG	2	12	311991	312002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010678	AGCGGC	2	12	376754	376765	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010678	GGAAAA	2	12	396186	396197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010678	CGTGCC	2	12	417978	417989	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010678	AAAACG	2	12	419552	419563	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_010678	AGAGGA	2	12	433917	433928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010678	CGATGC	2	12	440724	440735	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010678	ATCAAC	2	12	470823	470834	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010678	TGACGG	2	12	566405	566416	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_010678	GCGGCC	2	12	572617	572628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010678	CGCCAC	2	12	612807	612818	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_010678	GGCGCG	2	12	729568	729579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010678	TCAAAC	2	12	763271	763282	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010678	CCAAGC	2	12	787058	787069	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010678	ACCGCG	2	12	846226	846237	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010678	ATCGGT	2	12	847820	847831	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_010678	ACCGCT	2	12	881685	881696	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010678	GCCGTC	2	12	893128	893139	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010678	CGGGCA	2	12	902488	902499	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010678	GAAGAT	2	12	981996	982007	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010678	ACCCTG	2	12	995885	995896	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010678	AGCGCG	2	12	1023680	1023691	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010678	CGCCCG	2	12	1026955	1026966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_010678	ACAACG	2	12	1042252	1042263	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010678	CAAAAA	2	12	1066003	1066014	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_010678	CCGCGC	2	12	1096531	1096542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_010678	CGATCT	2	12	1145269	1145280	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010678	CATTCC	2	12	1155184	1155195	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010678	GACCCC	2	12	1166865	1166876	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_010678	CCGATC	2	12	1204683	1204694	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010678	TCTCCT	2	12	1229236	1229247	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010678	GTGCGG	2	12	1242973	1242984	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_010678	GTGCAC	2	12	1261373	1261384	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010678	GTTCAC	2	12	1285389	1285400	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.