MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12J chromosome 2

Total Repeats: 164

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010678	CTTTT	2	10	2247	2256	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_010678	GGTGG	2	10	4263	4272	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010678	TCGGT	2	10	5775	5784	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_010678	AGGCA	2	10	20550	20559	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_010678	CTTTT	2	10	26745	26754	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_010678	CAACG	2	10	62409	62418	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_010678	GATTC	2	10	69460	69469	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_010678	AACTA	2	10	77945	77954	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_010678	GCCCC	2	10	86531	86540	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
10	NC_010678	GGCTG	2	10	106356	106365	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_010678	TGCAA	2	10	107639	107648	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_010678	TCGCT	2	10	111686	111695	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_010678	GTGGG	2	10	113015	113024	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010678	GCCGC	2	10	114104	114113	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15	NC_010678	GCGCA	3	15	116881	116895	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_010678	AAGGC	2	10	121400	121409	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_010678	GCGCA	2	10	122662	122671	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_010678	GGGAA	2	10	125399	125408	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010678	GCCAG	2	10	127869	127878	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_010678	GCCCA	2	10	127887	127896	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_010678	GGTGA	2	10	128465	128474	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010678	CGGCA	2	10	129716	129725	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_010678	GTGTT	2	10	132798	132807	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010678	GCGTT	2	10	132808	132817	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_010678	GCTTG	2	10	132849	132858	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_010678	CATCA	2	10	140076	140085	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_010678	AAGCA	2	10	142347	142356	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_010678	GCAAA	2	10	165642	165651	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_010678	GCCGC	2	10	170940	170949	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
30	NC_010678	CATGC	2	10	171706	171715	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_010678	TCGCT	2	10	187479	187488	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_010678	AGCGA	2	10	187737	187746	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_010678	ACGAT	2	10	199297	199306	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_010678	CAACC	2	10	199327	199336	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
35	NC_010678	AAAAC	2	10	204377	204386	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_010678	GCGAA	2	10	220072	220081	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_010678	TGTGA	2	10	223349	223358	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010678	CGGTT	2	10	227742	227751	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_010678	CGGCG	2	10	268617	268626	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
40	NC_010678	CCGTC	2	10	270490	270499	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_010678	TCGCT	2	10	278520	278529	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_010678	CCGGC	2	10	296951	296960	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
43	NC_010678	TTTCC	2	10	310061	310070	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_010678	CGTCG	2	10	310483	310492	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_010678	ATCCG	2	10	310710	310719	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_010678	TGGCG	2	10	358563	358572	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_010678	GGCGG	2	10	369332	369341	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
48	NC_010678	GCTCG	2	10	376732	376741	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_010678	CCGGG	2	10	376787	376796	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
50	NC_010678	CAAGC	2	10	380267	380276	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_010678	GTTTG	2	10	382911	382920	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010678	CCGTT	2	10	387755	387764	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_010678	CAGGC	2	10	397745	397754	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_010678	GGCGG	2	10	410175	410184	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
55	NC_010678	GCTTC	2	10	421384	421393	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_010678	CCTGC	2	10	428762	428771	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
57	NC_010678	GCCGC	2	10	429281	429290	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
58	NC_010678	CTTCC	2	10	429654	429663	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
59	NC_010678	GTGCG	2	10	429757	429766	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
60	NC_010678	AGCGA	2	10	435668	435677	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_010678	CAGCG	2	10	466657	466666	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NC_010678	TCGCT	2	10	477585	477594	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_010678	CCCGA	2	10	501765	501774	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
64	NC_010678	GTTGG	2	10	514560	514569	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010678	GAATT	2	10	526073	526082	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010678	ATGGG	2	10	526145	526154	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010678	TTCTT	2	10	526257	526266	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_010678	GCGCG	2	10	545379	545388	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
69	NC_010678	CCGGC	2	10	554556	554565	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
70	NC_010678	GTAAA	2	10	560841	560850	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010678	GGCGG	2	10	578129	578138	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
72	NC_010678	GTTGG	2	10	590990	590999	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010678	GCGCA	2	10	593224	593233	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_010678	GCAAT	2	10	593369	593378	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_010678	ACCGA	2	10	593555	593564	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_010678	ATGGG	2	10	594202	594211	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010678	CAGGG	2	10	599929	599938	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
78	NC_010678	ACGCA	2	10	601394	601403	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_010678	CATCA	2	10	604438	604447	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_010678	GCAGG	2	10	610759	610768	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
81	NC_010678	ATCTG	2	10	618387	618396	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_010678	TCCAT	2	10	618446	618455	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_010678	GAAGC	2	10	621344	621353	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_010678	CGCGC	2	10	647365	647374	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
85	NC_010678	TAACA	2	10	647551	647560	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_010678	AGCGA	2	10	653088	653097	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_010678	GAGCT	2	10	663427	663436	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_010678	CAGCG	2	10	687761	687770	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
89	NC_010678	CTCGA	2	10	692048	692057	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_010678	GCAGC	2	10	701302	701311	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_010678	TGCAA	2	10	717222	717231	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_010678	ATCCG	2	10	745074	745083	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_010678	TCTGT	2	10	775413	775422	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_010678	ACCCC	2	10	787194	787203	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
95	NC_010678	CCACG	2	10	787781	787790	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
96	NC_010678	GGTGT	2	10	791912	791921	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010678	GACAA	2	10	791931	791940	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_010678	CAAAA	2	10	798832	798841	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_010678	ATGCG	2	10	804370	804379	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_010678	GCGAC	2	10	806698	806707	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_010678	CGGGT	2	10	808761	808770	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
102	NC_010678	TGCCG	2	10	809169	809178	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_010678	GATGA	2	10	815854	815863	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010678	CTCCC	2	10	817853	817862	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
105	NC_010678	CACGA	2	10	819320	819329	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_010678	ACAGC	2	10	821166	821175	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_010678	AACAA	2	10	822712	822721	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_010678	CCGCC	2	10	828457	828466	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
109	NC_010678	CGCTT	2	10	840022	840031	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_010678	CGCAC	2	10	841901	841910	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
111	NC_010678	AGCGA	2	10	859967	859976	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_010678	GAATT	2	10	868550	868559	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010678	GGCGT	2	10	886242	886251	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
114	NC_010678	CCCCA	2	10	895599	895608	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
115	NC_010678	CGACA	2	10	895626	895635	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_010678	GCGGA	2	10	900374	900383	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
117	NC_010678	CACGC	2	10	902418	902427	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
118	NC_010678	TGCCC	2	10	905345	905354	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
119	NC_010678	TTTTG	2	10	905977	905986	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010678	GGATA	3	15	912887	912901	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010678	TGCGC	2	10	917793	917802	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_010678	CATCA	2	10	917945	917954	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_010678	AACCG	2	10	918047	918056	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_010678	CCATT	2	10	919836	919845	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_010678	TGCCG	2	10	933494	933503	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
126	NC_010678	GCCAC	2	10	935939	935948	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
127	NC_010678	GCCCA	2	10	936223	936232	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
128	NC_010678	CAATA	2	10	937172	937181	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_010678	CTGAT	2	10	958164	958173	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_010678	CTGCA	2	10	958207	958216	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_010678	ACAGC	2	10	962991	963000	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_010678	CGGCA	2	10	982156	982165	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
133	NC_010678	GCGCC	2	10	997247	997256	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
134	NC_010678	GCCAT	2	10	1033712	1033721	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_010678	CCGGG	2	10	1041084	1041093	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
136	NC_010678	AAACC	2	10	1041160	1041169	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_010678	ACCGC	2	10	1041192	1041201	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
138	NC_010678	CGGCG	2	10	1045065	1045074	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
139	NC_010678	ACCGC	2	10	1045216	1045225	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
140	NC_010678	CCTGG	2	10	1045258	1045267	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
141	NC_010678	GCCGC	2	10	1045894	1045903	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
142	NC_010678	GTCGG	2	10	1046560	1046569	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
143	NC_010678	GCGCG	2	10	1047041	1047050	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
144	NC_010678	GGGAG	2	10	1060788	1060797	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010678	CCGCA	2	10	1093051	1093060	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
146	NC_010678	GCGCC	2	10	1117707	1117716	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
147	NC_010678	ATTCT	2	10	1134414	1134423	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_010678	CGATG	2	10	1138374	1138383	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
149	NC_010678	ACGCA	2	10	1140373	1140382	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
150	NC_010678	GTTCT	2	10	1158161	1158170	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_010678	CCCTC	2	10	1158851	1158860	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
152	NC_010678	ACCCG	2	10	1173949	1173958	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
153	NC_010678	TGCAA	2	10	1189376	1189385	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
154	NC_010678	ACGCC	2	10	1189635	1189644	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
155	NC_010678	GGCGC	2	10	1189858	1189867	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
156	NC_010678	CGCGC	2	10	1199012	1199021	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
157	NC_010678	CTAGC	2	10	1215706	1215715	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
158	NC_010678	CAGAT	2	10	1218392	1218401	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
159	NC_010678	CCTAG	2	10	1219685	1219694	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
160	NC_010678	CGGTT	2	10	1265470	1265479	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
161	NC_010678	GACAG	2	10	1270780	1270789	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
162	NC_010678	ACGGG	2	10	1272111	1272120	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
163	NC_010678	TGCCC	2	10	1299144	1299153	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
164	NC_010678	AGCGA	2	10	1299209	1299218	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.