MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Francisella tularensis subsp. mediasiatica FSC147 chromosome

Total Repeats: 920

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010677	CAAGAT	2	12	766	777	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187930914
2	NC_010677	TATTTC	2	12	2865	2876	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_010677	AAGGTT	2	12	6290	6301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010677	AGATAT	2	12	7831	7842	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	187930918
5	NC_010677	TCTAGT	2	12	8751	8762	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	187930919
6	NC_010677	CTAAAA	2	12	12311	12322	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	187930920
7	NC_010677	TGGTGA	2	12	14296	14307	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	187930922
8	NC_010677	ACCAAT	2	12	14332	14343	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	187930922
9	NC_010677	ATAAGT	2	12	19514	19525	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010677	TAAATT	2	12	23460	23471	50 %	50 %	0 %	0 %	187930931
11	NC_010677	TAAAAA	2	12	35858	35869	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	187930938
12	NC_010677	TTATGT	2	12	37620	37631	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	187930940
13	NC_010677	AAGGAT	2	12	38162	38173	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187930940
14	NC_010677	TAAATA	2	12	41094	41105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187930944
15	NC_010677	GTTATT	2	12	42657	42668	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	187930945
16	NC_010677	CTTGAG	2	12	43912	43923	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_010677	CTTTTT	2	12	58868	58879	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_010677	GCTGGA	2	12	59426	59437	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	187930959
19	NC_010677	AATCAC	2	12	61145	61156	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010677	GATATT	2	12	61381	61392	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010677	CTATAT	2	12	65414	65425	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	187930962
22	NC_010677	GAAGCT	2	12	69071	69082	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	187930963
23	NC_010677	TTTTGA	2	12	69685	69696	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	187930963
24	NC_010677	ATTTGC	2	12	70725	70736	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	187930964
25	NC_010677	GTAACT	2	12	71967	71978	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_010677	CCAAAA	2	12	72230	72241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187930965
27	NC_010677	ATTCAT	2	12	75369	75380	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	187930969
28	NC_010677	TAAAGA	2	12	76484	76495	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	187930970
29	NC_010677	GTTTTA	2	12	80310	80321	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010677	TATATC	2	12	83873	83884	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_010677	TTTATC	2	12	84540	84551	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_010677	CTGCTT	2	12	86732	86743	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	187930975
33	NC_010677	TACTGA	2	12	86898	86909	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	187930975
34	NC_010677	AGATGG	2	12	88997	89008	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	187930977
35	NC_010677	TTATAT	2	12	89342	89353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187930977
36	NC_010677	TCAAGA	2	12	89911	89922	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187930978
37	NC_010677	GAAGCA	2	12	90136	90147	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	187930979
38	NC_010677	GAGTAT	2	12	92133	92144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930980
39	NC_010677	CCAGAT	2	12	92271	92282	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	187930980
40	NC_010677	GTAAAG	2	12	92815	92826	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187930980
41	NC_010677	ATGATA	2	12	96434	96445	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010677	CAAATC	2	12	98431	98442	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	187930984
43	NC_010677	AGCTAA	2	12	99921	99932	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187930985
44	NC_010677	ATGATA	2	12	102125	102136	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010677	TACTCG	2	12	103709	103720	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	187930989
46	NC_010677	TGGTGC	2	12	106779	106790	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	187930993
47	NC_010677	TGCAAA	2	12	107839	107850	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187930994
48	NC_010677	ATATTG	2	12	109300	109311	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	187930994
49	NC_010677	TAACAT	2	12	111934	111945	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	187930997
50	NC_010677	TCAGTC	2	12	112072	112083	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	187930998
51	NC_010677	TGCAAA	2	12	114105	114116	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187930999
52	NC_010677	TTGGTA	2	12	114888	114899	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	187931000
53	NC_010677	TATTGG	2	12	115576	115587	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	187931000
54	NC_010677	TCCATG	2	12	118786	118797	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010677	TTTTGA	2	12	120972	120983	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	187931004
56	NC_010677	TGAAGA	2	12	121238	121249	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187931005
57	NC_010677	GGCAAA	2	12	130971	130982	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	187931012
58	NC_010677	ATTATG	2	12	131630	131641	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	187931013
59	NC_010677	ATAAAT	2	12	133104	133115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187931015
60	NC_010677	AGGCTA	2	12	133352	133363	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	187931016
61	NC_010677	GTTAGA	2	12	148060	148071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187931030
62	NC_010677	AAAGCT	2	12	149310	149321	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187931032
63	NC_010677	TAAAGC	2	12	149510	149521	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187931032
64	NC_010677	ATTATA	2	12	150679	150690	50 %	50 %	0 %	0 %	187931032
65	NC_010677	AAATGC	2	12	150757	150768	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187931032
66	NC_010677	AGATAC	2	12	152982	152993	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187931033
67	NC_010677	GGAGCA	2	12	156108	156119	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	187931037
68	NC_010677	TGGTGT	2	12	161269	161280	0 %	50 %	50 %	0 %	187931041
69	NC_010677	ATCCGT	2	12	162794	162805	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	187931041
70	NC_010677	TGATGT	2	12	163234	163245	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	187931041
71	NC_010677	AGCTTG	2	12	167012	167023	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_010677	GTTGAG	2	12	172598	172609	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010677	AAAAAC	2	12	172815	172826	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_010677	GCAAAT	2	12	182319	182330	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187931049
75	NC_010677	CAAATA	2	12	182830	182841	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	187931049
76	NC_010677	CAACAT	2	12	183943	183954	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	187931049
77	NC_010677	TAAATA	2	12	186741	186752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187931051
78	NC_010677	TGCAGC	2	12	188954	188965	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	187931053
79	NC_010677	TTATAG	2	12	190419	190430	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	187931054
80	NC_010677	AGATAA	2	12	190441	190452	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	187931054
81	NC_010677	GAAAGT	2	12	192048	192059	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187931055
82	NC_010677	CTGGTA	2	12	192236	192247	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	187931055
83	NC_010677	GCAAAT	2	12	200477	200488	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187931062
84	NC_010677	TAGGTG	2	12	203393	203404	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	187931064
85	NC_010677	TAGTGC	2	12	208246	208257	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_010677	ATTTTT	2	12	208905	208916	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010677	TTAATA	2	12	215289	215300	50 %	50 %	0 %	0 %	187931071
88	NC_010677	ACTTTG	2	12	217458	217469	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	187931072
89	NC_010677	ATTGTT	2	12	220039	220050	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	187931074
90	NC_010677	AGCAAC	2	12	221031	221042	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010677	TAGATC	2	12	221994	222005	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_010677	CTGTTG	2	12	227123	227134	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	187931082
93	NC_010677	AGAAAA	2	12	228139	228150	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	187931083
94	NC_010677	TTGATT	2	12	228407	228418	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	187931083
95	NC_010677	GGTAAA	2	12	228862	228873	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187931083
96	NC_010677	TATATG	2	12	231262	231273	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	187931083
97	NC_010677	GTTGAG	2	12	231941	231952	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	187931084
98	NC_010677	TCCACA	2	12	237345	237356	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_010677	TGCCTA	2	12	242109	242120	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	187931091
100	NC_010677	TGATTT	2	12	245144	245155	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010677	ATAAAC	2	12	246574	246585	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_010677	ATTAAA	2	12	248119	248130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187931095
103	NC_010677	TTTCAT	2	12	249823	249834	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	187931098
104	NC_010677	TGTTTT	2	12	254862	254873	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010677	GTTTTA	2	12	258954	258965	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010677	AAAATA	2	12	263566	263577	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010677	AGTATG	2	12	265371	265382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010677	GTAAAG	2	12	267212	267223	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187931110
109	NC_010677	TGAATC	2	12	271743	271754	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	187931114
110	NC_010677	TCATCC	2	12	275195	275206	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	187931117
111	NC_010677	GGTGAA	2	12	275923	275934	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	187931118
112	NC_010677	TAGGTT	2	12	280500	280511	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	187931120
113	NC_010677	AATATA	2	12	284135	284146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010677	ATAACA	2	12	284739	284750	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	187931122
115	NC_010677	ATTTTG	2	12	284901	284912	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	187931122
116	NC_010677	GTCAAG	2	12	286416	286427	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_010677	GGTAAT	2	12	287276	287287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010677	CAAAAA	2	12	289761	289772	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	187931124
119	NC_010677	TTATAA	2	12	292867	292878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010677	AGTTTA	2	12	299131	299142	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	187931131
121	NC_010677	TTCCCA	2	12	302478	302489	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_010677	CAAAAG	2	12	305657	305668	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_010677	ACTCTA	2	12	306824	306835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_010677	TAAGAT	2	12	307906	307917	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010677	TGGGCT	2	12	311312	311323	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_010677	ACAGCA	2	12	311787	311798	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	187931133
127	NC_010677	AATTCA	2	12	312909	312920	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	187931135
128	NC_010677	CTTGAT	2	12	314170	314181	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	187931135
129	NC_010677	GTTTTA	2	12	315809	315820	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010677	TGGTAC	2	12	317560	317571	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	187931139
131	NC_010677	GTAACT	2	12	318096	318107	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	187931140
132	NC_010677	CTTGCT	2	12	323564	323575	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	187931145
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135	NC_010677	GGTATG	2	12	336325	336336	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	187931151
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140	NC_010677	GTTTTA	2	12	350092	350103	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010677	TAATCT	2	12	350759	350770	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_010677	AAGATA	2	12	352362	352373	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_010677	ATTTTG	2	12	374334	374345	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	187931182
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229	NC_010677	TGCTGG	2	12	553685	553696	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	187931317
230	NC_010677	AGTAAC	2	12	555676	555687	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
231	NC_010677	GTTTTA	2	12	556078	556089	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
232	NC_010677	TATTTG	2	12	556660	556671	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
233	NC_010677	GTTTTG	2	12	558658	558669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187931320
234	NC_010677	AAAAAT	2	12	560277	560288	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	187931321
235	NC_010677	TTACAA	2	12	560390	560401	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	187931321
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237	NC_010677	ATCACT	2	12	563358	563369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187931324
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239	NC_010677	ATCACA	2	12	565991	566002	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	187931326
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350	NC_010677	CTTCAA	2	12	832568	832579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187931528
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471	NC_010677	GTACTT	2	12	1064142	1064153	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	187931699
472	NC_010677	TAAAAC	2	12	1064835	1064846	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	187931699
473	NC_010677	TAATTA	2	12	1066293	1066304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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