MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. mediasiatica FSC147 chromosome

Total Repeats: 498

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010677	TTCTT	2	10	3485	3494	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_010677	ATTTT	2	10	7994	8003	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010677	CTGTA	2	10	18371	18380	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_010677	TTGAT	2	10	20026	20035	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010677	AGTTT	2	10	26998	27007	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010677	AGTTT	2	10	31628	31637	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010677	TTCTT	2	10	34388	34397	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_010677	TATTT	2	10	35397	35406	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010677	AATTT	2	10	36431	36440	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010677	GATAA	2	10	40983	40992	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010677	ATTTT	2	10	43896	43905	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010677	CTAAA	2	10	45570	45579	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_010677	AAAGT	2	10	51209	51218	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010677	GCCCT	2	10	55338	55347	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_010677	TTCTT	2	10	56462	56471	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_010677	ATTAT	2	10	58467	58476	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010677	GTTGT	2	10	58504	58513	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010677	ATACT	2	10	61106	61115	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_010677	ACAAA	2	10	63887	63896	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_010677	AGTTT	2	10	64016	64025	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010677	ATTTT	2	10	64286	64295	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010677	AGCTA	2	10	71988	71997	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_010677	TAACT	2	10	72057	72066	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_010677	TAAAA	2	10	72181	72190	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010677	TTTGT	2	10	79336	79345	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010677	ACATC	2	10	79557	79566	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_010677	AAAGT	2	10	79843	79852	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010677	ACCAA	2	10	79883	79892	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_010677	AAAGA	2	10	80345	80354	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010677	TTTCT	2	10	83479	83488	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_010677	GATTT	2	10	93704	93713	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010677	ATTTT	2	10	94137	94146	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010677	ATTAA	2	10	96424	96433	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010677	GATTT	2	10	117988	117997	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010677	TTGGT	2	10	118189	118198	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010677	GATAG	2	10	118886	118895	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010677	TTAAT	2	10	119290	119299	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010677	AATTT	2	10	131424	131433	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010677	AAACT	2	10	157416	157425	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_010677	TTTAT	2	10	160528	160537	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010677	TGATA	2	10	163517	163526	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010677	TTCTT	2	10	163973	163982	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_010677	ATAGA	2	10	164420	164429	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010677	ATTAG	2	10	164974	164983	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010677	GTTTT	2	10	165581	165590	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010677	AATGT	2	10	169388	169397	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010677	CAGAT	2	10	173156	173165	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_010677	TTCTT	2	10	175176	175185	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_010677	TTTCT	2	10	176323	176332	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_010677	TTGAT	2	10	178230	178239	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010677	GTATG	2	10	207732	207741	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010677	GGTGT	2	10	208975	208984	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010677	TTCTT	2	10	216609	216618	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_010677	AAATC	2	10	220869	220878	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_010677	TTTAT	2	10	241347	241356	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010677	TAAAA	2	10	246367	246376	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010677	AGCTA	2	10	247202	247211	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_010677	AGTAA	2	10	247392	247401	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010677	AATGT	2	10	254830	254839	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010677	AAAGA	2	10	258989	258998	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010677	TATAA	2	10	259467	259476	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010677	TTCTT	2	10	263998	264007	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_010677	AGCAG	2	10	265615	265624	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_010677	GTTTA	2	10	268833	268842	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010677	GTTTT	2	10	273457	273466	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010677	ATCTT	2	10	273554	273563	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_010677	AAATA	2	10	273626	273635	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010677	AGCAA	2	10	278118	278127	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_010677	ACAGT	2	10	278475	278484	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_010677	TAAAT	2	10	278514	278523	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010677	AGCTT	2	10	282419	282428	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_010677	AATTA	2	10	283110	283119	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010677	TTCTT	2	10	288226	288235	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_010677	TTCTT	2	10	293623	293632	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_010677	AAAAT	2	10	300118	300127	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010677	TCATG	2	10	306329	306338	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_010677	GATTA	2	10	306524	306533	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010677	CCAAG	2	10	306638	306647	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_010677	TATTC	2	10	306725	306734	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_010677	GTATG	2	10	309104	309113	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010677	TTCTT	2	10	309774	309783	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_010677	CCAAG	2	10	310540	310549	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_010677	AAAGA	2	10	315844	315853	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010677	GTAAA	2	10	328720	328729	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010677	TAAGA	2	10	330797	330806	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010677	AAAGA	2	10	331234	331243	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010677	AGAAA	2	10	331728	331737	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010677	TCAAT	2	10	332430	332439	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_010677	TTCTT	2	10	334110	334119	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_010677	CTTTT	2	10	336523	336532	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_010677	TTCTT	2	10	337136	337145	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_010677	AATTT	2	10	337668	337677	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010677	TTGCT	2	10	337869	337878	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_010677	ATCTA	2	10	339622	339631	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_010677	TCATT	2	10	339634	339643	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_010677	AATTG	2	10	342345	342354	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010677	CCAAA	2	10	342355	342364	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_010677	TATTT	2	10	349351	349360	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010677	AAAGA	2	10	350127	350136	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010677	AGAAA	2	10	351961	351970	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010677	GATAA	2	10	357859	357868	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010677	GATAA	2	10	359037	359046	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010677	TTCTT	2	10	365348	365357	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_010677	GTAAA	2	10	371170	371179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010677	ATTTA	2	10	384999	385008	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010677	CAAAC	2	10	386251	386260	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_010677	TTCTT	2	10	388297	388306	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_010677	TAATG	2	10	391449	391458	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010677	AAGAT	2	10	391760	391769	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010677	ATTTG	2	10	392171	392180	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010677	ACTAA	2	10	393938	393947	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_010677	AGTTA	2	10	402871	402880	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010677	ATTTA	2	10	403255	403264	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010677	GTATT	2	10	403436	403445	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010677	TTTAG	2	10	404891	404900	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010677	ATTGA	2	10	421320	421329	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010677	TTTCT	2	10	422022	422031	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_010677	AGTTT	2	10	422234	422243	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010677	TATGG	2	10	423318	423327	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010677	TTACA	2	10	423916	423925	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_010677	CTAAA	2	10	424179	424188	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_010677	GTTGA	2	10	429490	429499	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010677	TATTT	2	10	429555	429564	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010677	TTTGA	2	10	430607	430616	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010677	TTTTA	2	10	432778	432787	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010677	GAGTA	2	10	432846	432855	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010677	GTTTG	2	10	432857	432866	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010677	GATTT	2	10	437422	437431	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010677	ACATC	2	10	452431	452440	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_010677	TTCTT	2	10	453593	453602	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_010677	AAAGA	2	10	466166	466175	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010677	TGATC	2	10	471960	471969	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_010677	TCTTT	2	10	472344	472353	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_010677	CTGTT	2	10	472662	472671	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_010677	TAATT	2	10	472674	472683	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010677	TATTT	2	10	473173	473182	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010677	ATTTA	2	10	478763	478772	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010677	AATCT	2	10	483140	483149	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_010677	ACTAC	2	10	483919	483928	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_010677	GAACA	2	10	484357	484366	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_010677	ATGCT	2	10	487870	487879	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_010677	AAATG	2	10	490124	490133	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010677	GATTT	2	10	490382	490391	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010677	GCGAT	2	10	491541	491550	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
145	NC_010677	ATTTC	2	10	497949	497958	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_010677	TATCT	2	10	502980	502989	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_010677	AATCT	2	10	512003	512012	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_010677	ATTTA	2	10	517917	517926	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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