MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia phytofirmans PsJN chromosome 2

Total Repeats: 155

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010676	ATTCAA	2	12	47994	48005	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_010676	GTGATA	2	12	49875	49886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010676	GGCTCA	2	12	157289	157300	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010676	GTAAGG	2	12	268860	268871	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010676	GTCAAG	2	12	308937	308948	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_010676	GAAATT	2	12	314178	314189	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010676	TCGATA	2	12	314884	314895	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_010676	TCAGTC	5	30	338255	338284	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010676	TCATCC	2	12	349060	349071	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010676	CGCGTC	2	12	354600	354611	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010676	CGGTGC	3	18	398056	398073	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010676	CTTTCA	2	12	431348	431359	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010676	CTGTTT	2	12	434735	434746	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_010676	CGACAT	2	12	445767	445778	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010676	CGGCTA	2	12	478198	478209	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010676	CGTGTT	2	12	508687	508698	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_010676	TGCGCG	2	12	522348	522359	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010676	CGCTGG	2	12	526460	526471	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010676	GGCTCG	2	12	526774	526785	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010676	ACTGAG	2	12	533763	533774	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_010676	GGGCGC	2	12	536007	536018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010676	CACACT	2	12	559629	559640	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010676	CAAAAG	2	12	604606	604617	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_010676	GGTATC	2	12	605802	605813	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_010676	CGTTGG	2	12	652309	652320	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_010676	GAGCCG	2	12	670617	670628	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010676	GCGCGT	2	12	673404	673415	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010676	ACTCGA	2	12	684993	685004	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010676	TCGTGA	2	12	695610	695621	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_010676	TGAAAA	2	12	696639	696650	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010676	CCACGC	2	12	719099	719110	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_010676	TTTATA	2	12	732069	732080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010676	ATGCCG	2	12	733532	733543	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010676	GGGTGC	2	12	751793	751804	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_010676	CGCGCT	2	12	774584	774595	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010676	CCGCTT	2	12	863709	863720	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
37	NC_010676	ATTGCG	2	12	891057	891068	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_010676	CAGAGT	2	12	892245	892256	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_010676	AAAGGA	2	12	920384	920395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010676	AATGTA	2	12	948478	948489	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010676	AAAATG	2	12	978672	978683	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010676	ATGCAG	2	12	980860	980871	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_010676	GGCGCG	2	12	998035	998046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010676	TGATCG	2	12	1001671	1001682	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_010676	CTAGCG	2	12	1007607	1007618	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010676	CATGCA	2	12	1025519	1025530	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010676	CCAACC	2	12	1028995	1029006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_010676	ACCCGG	2	12	1044388	1044399	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010676	GTACTC	2	12	1070380	1070391	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010676	GGGAAG	2	12	1140351	1140362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010676	CGTGCA	2	12	1140572	1140583	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010676	GGCGCG	2	12	1146640	1146651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010676	GCGCAG	2	12	1161484	1161495	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010676	CGGCTT	2	12	1173125	1173136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010676	GGAACC	2	12	1246195	1246206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010676	AGGCGA	2	12	1294187	1294198	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_010676	AACCCG	2	12	1307647	1307658	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_010676	AGCGCG	2	12	1309607	1309618	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010676	ATGCAA	2	12	1309624	1309635	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_010676	CGACCG	2	12	1332552	1332563	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010676	GACATA	4	24	1332596	1332619	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_010676	GACATC	2	12	1332620	1332631	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010676	CTTCCG	2	12	1370709	1370720	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_010676	GCGCGA	2	12	1452918	1452929	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010676	GCCGGT	2	12	1509074	1509085	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010676	AACGGC	2	12	1518318	1518329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010676	TGCGCG	2	12	1531352	1531363	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010676	AGCCTG	2	12	1536988	1536999	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010676	GACCCG	2	12	1564773	1564784	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_010676	GATGCG	2	12	1586087	1586098	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_010676	TGCGGT	7	42	1598656	1598697	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_010676	GCAAAC	2	12	1601065	1601076	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010676	ATTCGA	2	12	1610878	1610889	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_010676	GCGGTT	2	12	1615579	1615590	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_010676	GCAACA	2	12	1640069	1640080	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010676	CGCGCC	2	12	1659410	1659421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_010676	GAAGGT	2	12	1671955	1671966	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010676	CGCCGG	2	12	1707389	1707400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_010676	ATGTCG	2	12	1767544	1767555	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_010676	CGACCT	2	12	1805534	1805545	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
81	NC_010676	CGGCTC	2	12	1821479	1821490	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
82	NC_010676	TGCTCG	2	12	1822649	1822660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010676	GAGCGG	2	12	1871365	1871376	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_010676	CTGTCG	2	12	1871448	1871459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010676	GCTCGC	2	12	1875069	1875080	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_010676	ACCAAC	2	12	1879099	1879110	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_010676	GTCGAT	2	12	1903882	1903893	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_010676	GATCCC	2	12	1917200	1917211	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010676	GGTCGC	2	12	1923175	1923186	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010676	AAGGCG	2	12	1925253	1925264	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_010676	TCGATG	2	12	1925478	1925489	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_010676	GCTGCC	2	12	1925705	1925716	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
93	NC_010676	CGGTGC	2	12	1926133	1926144	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010676	AAAGAC	2	12	1926264	1926275	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_010676	GCACCT	2	12	1998781	1998792	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_010676	CTCGCC	2	12	2077499	2077510	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_010676	CGTCTC	2	12	2110420	2110431	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_010676	CTGAGA	2	12	2143577	2143588	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_010676	GCCGAT	2	12	2174076	2174087	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010676	GGCACG	2	12	2180543	2180554	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010676	CGGCCG	2	12	2202993	2203004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_010676	TTGCAA	2	12	2209224	2209235	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_010676	CGGCGC	2	12	2231944	2231955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_010676	CGCTGC	2	12	2237052	2237063	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_010676	CAAACA	2	12	2255069	2255080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010676	CGGCAG	2	12	2378974	2378985	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010676	CCGCCC	2	12	2411872	2411883	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
108	NC_010676	AGCCGG	2	12	2416751	2416762	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_010676	GCGTTC	2	12	2428938	2428949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010676	TCCCCC	2	12	2439988	2439999	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
111	NC_010676	GCGCAA	2	12	2453445	2453456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010676	ATCGCT	2	12	2495111	2495122	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010676	CGATTG	2	12	2503091	2503102	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_010676	CAACCC	2	12	2505726	2505737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_010676	TGGCGA	2	12	2545905	2545916	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_010676	AAAGCC	2	12	2549342	2549353	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_010676	GGCGAA	2	12	2566749	2566760	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_010676	AACGCA	2	12	2567910	2567921	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010676	GCAATG	2	12	2586836	2586847	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_010676	CCCCCA	2	12	2633133	2633144	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
121	NC_010676	CGGGTT	2	12	2683853	2683864	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_010676	TCGAAG	2	12	2698096	2698107	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_010676	TACGCG	2	12	2701233	2701244	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_010676	CGTCTT	2	12	2710875	2710886	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_010676	CAACGG	2	12	2715391	2715402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010676	TCTCGT	2	12	2737513	2737524	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_010676	AACACG	2	12	2766627	2766638	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010676	GGGATG	2	12	2813098	2813109	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010676	CGAAGC	2	12	2813154	2813165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010676	CGAGCC	2	12	2814889	2814900	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
131	NC_010676	GATGCG	2	12	2835501	2835512	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_010676	GCTTCG	2	12	2842011	2842022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_010676	AACCCG	2	12	2912564	2912575	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
134	NC_010676	CGTCAC	2	12	2923347	2923358	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
135	NC_010676	CCGATA	2	12	2976533	2976544	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010676	GCGACC	2	12	2985444	2985455	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
137	NC_010676	CGTTTA	2	12	3053463	3053474	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_010676	GGAGAC	2	12	3064657	3064668	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_010676	GCCACT	2	12	3077129	3077140	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
140	NC_010676	GCGCAG	2	12	3085225	3085236	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_010676	CGGGCG	2	12	3134948	3134959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_010676	CGTTGT	2	12	3170398	3170409	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_010676	GCTGCG	20	120	3188413	3188532	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_010676	CAGCTG	2	12	3294511	3294522	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_010676	GCTGTC	2	12	3309795	3309806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_010676	TTCGAC	2	12	3323692	3323703	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_010676	CGGCTG	2	12	3394668	3394679	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_010676	CCAACG	2	12	3399203	3399214	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
149	NC_010676	AATGCG	2	12	3419538	3419549	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_010676	TGCTTT	2	12	3427915	3427926	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_010676	TACGAC	2	12	3452470	3452481	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_010676	AAACAA	2	12	3490861	3490872	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_010676	ACGTCA	2	12	3516703	3516714	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_010676	CCCGTT	2	12	3575679	3575690	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
155	NC_010676	CGAAAG	2	12	3592311	3592322	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.