MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia hermsii DAH chromosome

Total Repeats: 552

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010673	ATAATC	2	12	2006	2017	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	187917885
2	NC_010673	ACAATG	2	12	3960	3971	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187917887
3	NC_010673	TGAAAA	2	12	4168	4179	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	187917887
4	NC_010673	TAAATT	2	12	8639	8650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010673	CAATAA	2	12	9394	9405	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	187917891
6	NC_010673	TATGAA	2	12	10461	10472	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	187917892
7	NC_010673	GAAAGG	2	12	10632	10643	50 %	0 %	50 %	0 %	187917893
8	NC_010673	TCAAAT	2	12	13689	13700	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	187917897
9	NC_010673	TTTTAA	2	12	14471	14482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187917897
10	NC_010673	ACTAAT	2	12	16255	16266	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	187917900
11	NC_010673	GCTGAT	2	12	20859	20870	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	187917904
12	NC_010673	GAGCTG	2	12	22145	22156	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	187917905
13	NC_010673	TTTAAA	2	12	22629	22640	50 %	50 %	0 %	0 %	187917906
14	NC_010673	GAAGAT	2	12	22907	22918	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187917906
15	NC_010673	TACAAT	2	12	23004	23015	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	187917906
16	NC_010673	ATTCTT	2	12	23416	23427	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_010673	AAAGAT	2	12	26963	26974	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	187917910
18	NC_010673	CTTAAA	2	12	27931	27942	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	187917912
19	NC_010673	AAAGAA	2	12	31108	31119	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	187917915
20	NC_010673	TATCAA	2	12	32685	32696	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	187917917
21	NC_010673	TATATT	2	12	35174	35185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187917918
22	NC_010673	TATCAA	2	12	36901	36912	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	187917920
23	NC_010673	ATAAAA	2	12	37072	37083	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	187917920
24	NC_010673	TAAATT	2	12	37697	37708	50 %	50 %	0 %	0 %	187917920
25	NC_010673	CTCTCA	2	12	41356	41367	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	187917924
26	NC_010673	AACAAA	2	12	45643	45654	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	187917927
27	NC_010673	CAATTC	2	12	47260	47271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187917929
28	NC_010673	TCATCT	2	12	48375	48386	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	187917931
29	NC_010673	GCAACA	2	12	48444	48455	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	187917931
30	NC_010673	TATCTT	2	12	49779	49790	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	187917933
31	NC_010673	TATTAA	2	12	65864	65875	50 %	50 %	0 %	0 %	187917950
32	NC_010673	TATCAA	2	12	66170	66181	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	187917950
33	NC_010673	GAAAAT	2	12	66685	66696	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	187917950
34	NC_010673	TAAAAA	2	12	66898	66909	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	187917951
35	NC_010673	TAGAAA	2	12	66973	66984	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	187917951
36	NC_010673	ACTGAA	2	12	68028	68039	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187917951
37	NC_010673	CAATGA	2	12	71007	71018	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187917954
38	NC_010673	ATTAAA	2	12	71191	71202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187917954
39	NC_010673	AATTGA	2	12	71805	71816	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	187917954
40	NC_010673	AAAGAA	2	12	77317	77328	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	187917959
41	NC_010673	CTTCAA	2	12	78010	78021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187917960
42	NC_010673	TCTCTT	2	12	78573	78584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187917960
43	NC_010673	AACATA	2	12	78978	78989	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_010673	TCCCTG	2	12	82077	82088	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	187917964
45	NC_010673	AAAATT	2	12	82582	82593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187917965
46	NC_010673	AGAAAT	2	12	86766	86777	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	187917968
47	NC_010673	AAACAA	2	12	86894	86905	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	187917968
48	NC_010673	TCAAAC	2	12	88353	88364	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	187917969
49	NC_010673	AGAAAA	2	12	92973	92984	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	187917973
50	NC_010673	AATTTC	2	12	94908	94919	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	187917976
51	NC_010673	TAAGCT	2	12	94931	94942	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	187917976
52	NC_010673	ATTTCA	2	12	96199	96210	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	187917976
53	NC_010673	AAATAA	2	12	97546	97557	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	187917978
54	NC_010673	AATCTT	2	12	98602	98613	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	187917979
55	NC_010673	TGGACT	2	12	99661	99672	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	187917979
56	NC_010673	AGCTAA	2	12	102645	102656	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187917982
57	NC_010673	TCATAT	2	12	103537	103548	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	187917984
58	NC_010673	TAAATC	2	12	103946	103957	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	187917984
59	NC_010673	TTAAAT	2	12	106683	106694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010673	CATTAA	2	12	106873	106884	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	187917987
61	NC_010673	AAAAAC	2	12	108333	108344	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	187917988
62	NC_010673	ATTGGT	2	12	108367	108378	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	187917988
63	NC_010673	TGGAAT	2	12	108708	108719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187917988
64	NC_010673	ATTATC	2	12	113136	113147	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	187917994
65	NC_010673	CACCAA	2	12	113558	113569	50 %	0 %	0 %	50 %	187917994
66	NC_010673	AAAAGA	2	12	116051	116062	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	187917996
67	NC_010673	TAAAAG	2	12	117058	117069	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	187917996
68	NC_010673	AAACTC	2	12	118393	118404	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	187917998
69	NC_010673	ACTTCA	2	12	123478	123489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187918006
70	NC_010673	GCTCTC	2	12	124316	124327	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	187918006
71	NC_010673	CAATTT	2	12	124939	124950	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	187918007
72	NC_010673	ATCTAT	2	12	131212	131223	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	187918012
73	NC_010673	ACTGAA	2	12	132633	132644	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187918013
74	NC_010673	TGATAT	2	12	132989	133000	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	187918013
75	NC_010673	TCAATT	2	12	133570	133581	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	187918014
76	NC_010673	ATTAAA	2	12	133767	133778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187918014
77	NC_010673	ATCAAA	2	12	134193	134204	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	187918014
78	NC_010673	CATCTT	2	12	137114	137125	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	187918016
79	NC_010673	TTCCTT	2	12	138890	138901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187918017
80	NC_010673	CTATCA	2	12	146099	146110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187918023
81	NC_010673	AAACTA	2	12	146962	146973	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	187918024
82	NC_010673	TTTATA	2	12	147399	147410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187918024
83	NC_010673	TTTCAT	2	12	147713	147724	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	187918024
84	NC_010673	ATTTGC	2	12	147741	147752	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	187918024
85	NC_010673	AAATAA	2	12	147978	147989	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010673	GAGCTG	2	12	148345	148356	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	187918025
87	NC_010673	GAGCTG	2	12	148363	148374	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	187918025
88	NC_010673	TCAATT	2	12	148686	148697	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	187918025
89	NC_010673	AAATTT	2	12	151308	151319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010673	ATTTAA	2	12	152484	152495	50 %	50 %	0 %	0 %	187918027
91	NC_010673	AGTAGG	2	12	153129	153140	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	187918028
92	NC_010673	TTAAAA	2	12	157143	157154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187918031
93	NC_010673	TAACAA	2	12	158561	158572	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	187918033
94	NC_010673	AATTCA	2	12	159395	159406	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	187918034
95	NC_010673	TAAAAA	2	12	164157	164168	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	187918038
96	NC_010673	AATAAA	2	12	164362	164373	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	187918038
97	NC_010673	AATCAA	2	12	166999	167010	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	187918040
98	NC_010673	TATACA	2	12	168171	168182	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_010673	ATATAA	2	12	168912	168923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187918041
100	NC_010673	AAAATG	2	12	169088	169099	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	187918041
101	NC_010673	ATTAAA	2	12	170600	170611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187918044
102	NC_010673	TCTTTA	2	12	173085	173096	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	187918046
103	NC_010673	ACCTTA	2	12	176900	176911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187918050
104	NC_010673	TTCCTT	2	12	178680	178691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187918052
105	NC_010673	TTTATC	2	12	179271	179282	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	187918052
106	NC_010673	CTCATA	2	12	187205	187216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187918061
107	NC_010673	CCTATC	2	12	188607	188618	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	187918064
108	NC_010673	ATCTTA	2	12	189345	189356	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	187918065
109	NC_010673	TTAATT	2	12	189384	189395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187918065
110	NC_010673	TCATAT	2	12	192334	192345	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_010673	AAAATA	2	12	192589	192600	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	187918069
112	NC_010673	CAAATA	2	12	193748	193759	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	187918070
113	NC_010673	GAATAA	2	12	195291	195302	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	187918071
114	NC_010673	GTAGAA	2	12	196172	196183	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187918071
115	NC_010673	CTTAAT	2	12	196469	196480	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	187918072
116	NC_010673	ATACAA	2	12	196948	196959	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	187918072
117	NC_010673	ATAAAA	2	12	198187	198198	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	187918072
118	NC_010673	ACAAAA	2	12	202459	202470	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	187918075
119	NC_010673	TAAAAA	2	12	202942	202953	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010673	AGACAA	2	12	206069	206080	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	187918078
121	NC_010673	AAACCA	2	12	212759	212770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187918083
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238	NC_010673	TCTCAA	2	12	396207	396218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187918250
239	NC_010673	CTGATC	2	12	396406	396417	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	187918250
240	NC_010673	CTGATC	2	12	397465	397476	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	187918251
241	NC_010673	ATTCAC	2	12	397807	397818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187918251
242	NC_010673	TTTTCA	2	12	407685	407696	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	187918257
243	NC_010673	ACCTTT	2	12	410010	410021	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	187918262
244	NC_010673	TATTCT	2	12	410368	410379	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	187918263
245	NC_010673	ACTTGT	2	12	410585	410596	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	187918263
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247	NC_010673	TCATAT	2	12	413344	413355	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	187918265
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249	NC_010673	ATTTAT	2	12	418780	418791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_010673	ACCTCA	3	18	420084	420101	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	187918271
251	NC_010673	ACCTCA	2	12	420117	420128	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	187918271
252	NC_010673	ACCTCA	2	12	420144	420155	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	187918271
253	NC_010673	AATAGC	2	12	420495	420506	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187918271
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255	NC_010673	CTTACC	2	12	422852	422863	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	187918273
256	NC_010673	AAGATA	2	12	424797	424808	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	187918275
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258	NC_010673	CTATTT	2	12	425597	425608	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	187918276
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262	NC_010673	AAAAAT	2	12	431134	431145	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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346	NC_010673	TTCTTG	2	12	573898	573909	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	187918416
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353	NC_010673	TTGAAT	2	12	587710	587721	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	187918430
354	NC_010673	ATTGAT	2	12	589725	589736	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	187918430
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469	NC_010673	ATTAAA	2	12	802879	802890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187918604
470	NC_010673	TAATGA	2	12	804529	804540	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	187918605
471	NC_010673	TTTTAT	2	12	804754	804765	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_010673	TCTCCT	2	12	805796	805807	0 %	50 %	0 %	50 %	187918606
473	NC_010673	TTGATT	2	12	806116	806127	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	187918606
474	NC_010673	CATTTG	2	12	807578	807589	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	187918607
475	NC_010673	TTTCAT	2	12	811262	811273	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	187918611
476	NC_010673	TTTTTA	2	12	814594	814605	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	187918613
477	NC_010673	GTTGTA	2	12	815410	815421	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	187918614
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480	NC_010673	CCACTT	2	12	817398	817409	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	187918616
481	NC_010673	TTCCAT	2	12	817462	817473	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	187918616
482	NC_010673	CTGCTC	2	12	820239	820250	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	187918619
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488	NC_010673	ATTTTA	2	12	828885	828896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
489	NC_010673	TCTTAT	2	12	830521	830532	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	187918631
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491	NC_010673	TATTAA	2	12	833513	833524	50 %	50 %	0 %	0 %	187918636
492	NC_010673	CTTGAA	2	12	834676	834687	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	187918638
493	NC_010673	TTGCTC	2	12	836352	836363	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	187918640
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497	NC_010673	ATTTGA	2	12	842121	842132	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	187918643
498	NC_010673	AATTTA	2	12	842470	842481	50 %	50 %	0 %	0 %	187918644
499	NC_010673	GATAAA	2	12	845062	845073	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	187918647
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