MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia hermsii DAH chromosome

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010673	TAAATT	2	12	8639	8650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010673	ATTCTT	2	12	23416	23427	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_010673	AACATA	2	12	78978	78989	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_010673	TTAAAT	2	12	106683	106694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010673	AAATAA	2	12	147978	147989	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010673	AAATTT	2	12	151308	151319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010673	TATACA	2	12	168171	168182	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_010673	TCATAT	2	12	192334	192345	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_010673	TAAAAA	2	12	202942	202953	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010673	AAAATT	2	12	247835	247846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010673	AATTTC	2	12	279181	279192	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_010673	TCTCCC	2	12	319899	319910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_010673	AACAAA	2	12	349804	349815	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_010673	ATTTAT	2	12	418780	418791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010673	AAAAAT	2	12	431134	431145	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010673	ATTAGT	2	12	438500	438511	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010673	TTCGCC	2	12	448079	448090	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010673	TTATTT	2	12	448806	448817	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010673	TTATAT	2	12	451620	451631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010673	CAATTG	2	12	464450	464461	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_010673	TTAATT	2	12	489594	489605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010673	GATATT	2	12	542160	542171	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010673	TTAATT	2	12	559133	559144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010673	TATTTT	2	12	570290	570301	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010673	ATAAGT	2	12	602466	602477	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010673	CTTTAT	2	12	610219	610230	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_010673	TAAATT	2	12	622729	622740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010673	TTAAAC	2	12	664126	664137	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_010673	TAAAAT	2	12	711670	711681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010673	TTTATT	2	12	724710	724721	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010673	TAGTTT	2	12	749981	749992	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010673	TTTTAT	2	12	804754	804765	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010673	ATTTTA	2	12	828885	828896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010673	TATTTT	2	12	902238	902249	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010673	GTACTT	2	12	919740	919751	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.