MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 plasmid pBS512_7

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010672	TGA	3	9	102	110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187918708
2	NC_010672	GCG	2	6	162	167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187918708
3	NC_010672	CCG	2	6	220	225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187918708
4	NC_010672	GCC	2	6	241	246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187918708
5	NC_010672	GGT	2	6	318	323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187918708
6	NC_010672	GAT	2	6	394	399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187918708
7	NC_010672	CTG	2	6	452	457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010672	GAA	2	6	506	511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010672	GAA	2	6	544	549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010672	GGA	2	6	596	601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010672	TAC	2	6	761	766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010672	CGG	2	6	1048	1053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010672	ACG	2	6	1162	1167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010672	GGA	2	6	1259	1264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010672	GAT	2	6	1301	1306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010672	GCA	2	6	1307	1312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010672	GTG	2	6	1390	1395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010672	CGG	2	6	1412	1417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010672	GAA	2	6	1437	1442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010672	GCT	2	6	1598	1603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010672	CAG	2	6	1785	1790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187918710
22	NC_010672	GCA	2	6	1793	1798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187918710
23	NC_010672	TGT	2	6	1978	1983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187918705
24	NC_010672	TTG	2	6	2113	2118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187918704
25	NC_010672	TCT	2	6	2188	2193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187918704
26	NC_010672	GGT	2	6	2321	2326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187918706
27	NC_010672	TTG	2	6	2327	2332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187918706
28	NC_010672	CTG	2	6	2347	2352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187918706
29	NC_010672	TGC	2	6	2496	2501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187918709
30	NC_010672	CTG	2	6	2566	2571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187918709
31	NC_010672	TGC	2	6	2579	2584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187918709
32	NC_010672	CAT	2	6	2656	2661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187918709
33	NC_010672	TGT	2	6	2738	2743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187918709
34	NC_010672	TTA	2	6	2871	2876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010672	ATC	2	6	2892	2897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010672	TTC	2	6	3129	3134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187918707
37	NC_010672	GTG	2	6	3444	3449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010672	GCG	2	6	3516	3521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010672	TGG	2	6	3626	3631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010672	GTG	2	6	3664	3669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010672	GGT	2	6	3687	3692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010672	AAT	2	6	3723	3728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010672	CAG	2	6	3753	3758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010672	GTG	2	6	3798	3803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010672	TGC	2	6	3815	3820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010672	GAA	2	6	4080	4085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010672	TAA	2	6	4145	4150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010672	AGA	2	6	4208	4213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010672	TGA	2	6	4216	4221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010672	TTG	2	6	4378	4383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010672	ATG	2	6	4495	4500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010672	CAG	2	6	4530	4535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010672	TGA	2	6	4552	4557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010672	ATG	3	9	4642	4650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010672	CAG	2	6	4728	4733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010672	GCA	3	9	4749	4757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010672	GCG	2	6	4779	4784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010672	GCA	2	6	4791	4796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010672	GCT	2	6	4806	4811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010672	ATG	2	6	4870	4875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010672	ATC	2	6	4908	4913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010672	ATA	2	6	4981	4986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010672	GCC	2	6	5079	5084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_010672	TGA	2	6	5185	5190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010672	AAC	2	6	5196	5201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010672	CTG	2	6	5293	5298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010672	TTG	2	6	5425	5430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010672	AAT	2	6	5439	5444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010672	ATT	2	6	5448	5453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010672	AGG	2	6	5489	5494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010672	GAA	2	6	5556	5561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187918711
72	NC_010672	AAT	2	6	5567	5572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187918711
73	NC_010672	TAA	2	6	5592	5597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187918711
74	NC_010672	GAA	2	6	5667	5672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187918711
75	NC_010672	TAT	2	6	5871	5876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187918711
76	NC_010672	ATG	2	6	5887	5892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187918711
77	NC_010672	AAT	2	6	5934	5939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187918711
78	NC_010672	TGT	2	6	5981	5986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187918711
79	NC_010672	AAT	2	6	6024	6029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010672	TTA	2	6	6048	6053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010672	TAT	2	6	6123	6128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010672	AGG	2	6	6130	6135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010672	TCT	3	9	6215	6223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010672	TCT	2	6	6268	6273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010672	CTG	2	6	6300	6305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010672	GGT	2	6	6336	6341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010672	GGA	2	6	6393	6398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010672	CTC	2	6	6461	6466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_010672	GCT	2	6	6484	6489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010672	GCG	2	6	6845	6850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187918712
91	NC_010672	CGC	2	6	6955	6960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_010672	CAG	2	6	7386	7391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.