MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 plasmid pBS512_7

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010672	CTG	2	6	452	457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010672	GAA	2	6	506	511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010672	GAA	2	6	544	549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010672	GGA	2	6	596	601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010672	TAC	2	6	761	766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010672	CGG	2	6	1048	1053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010672	ACG	2	6	1162	1167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010672	GGA	2	6	1259	1264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010672	GAT	2	6	1301	1306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010672	GCA	2	6	1307	1312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010672	GTG	2	6	1390	1395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010672	CGG	2	6	1412	1417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010672	GAA	2	6	1437	1442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010672	GCT	2	6	1598	1603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010672	TTA	2	6	2871	2876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010672	ATC	2	6	2892	2897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010672	GTG	2	6	3444	3449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010672	GCG	2	6	3516	3521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010672	TGG	2	6	3626	3631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010672	GTG	2	6	3664	3669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010672	GGT	2	6	3687	3692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010672	AAT	2	6	3723	3728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010672	CAG	2	6	3753	3758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010672	GTG	2	6	3798	3803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010672	TGC	2	6	3815	3820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010672	GAA	2	6	4080	4085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010672	TAA	2	6	4145	4150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010672	AGA	2	6	4208	4213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010672	TGA	2	6	4216	4221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010672	TTG	2	6	4378	4383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010672	ATG	2	6	4495	4500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010672	CAG	2	6	4530	4535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010672	TGA	2	6	4552	4557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010672	ATG	3	9	4642	4650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010672	CAG	2	6	4728	4733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010672	GCA	3	9	4749	4757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010672	GCG	2	6	4779	4784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010672	GCA	2	6	4791	4796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010672	GCT	2	6	4806	4811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010672	ATG	2	6	4870	4875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010672	ATC	2	6	4908	4913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010672	ATA	2	6	4981	4986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010672	GCC	2	6	5079	5084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_010672	TGA	2	6	5185	5190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010672	AAC	2	6	5196	5201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010672	CTG	2	6	5293	5298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010672	TTG	2	6	5425	5430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010672	AAT	2	6	5439	5444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010672	ATT	2	6	5448	5453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010672	AGG	2	6	5489	5494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010672	AAT	2	6	6024	6029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010672	TTA	2	6	6048	6053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010672	TAT	2	6	6123	6128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010672	AGG	2	6	6130	6135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010672	TCT	3	9	6215	6223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010672	TCT	2	6	6268	6273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010672	CTG	2	6	6300	6305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010672	GGT	2	6	6336	6341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010672	GGA	2	6	6393	6398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010672	CTC	2	6	6461	6466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_010672	GCT	2	6	6484	6489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010672	CGC	2	6	6955	6960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_010672	CAG	2	6	7386	7391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.