MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 plasmid pBS512_211

Total Repeats: 590

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010660	CAGC	2	8	26	33	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010660	ATCT	2	8	122	129	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_010660	TCGT	2	8	169	176	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_010660	GCGA	2	8	256	263	25 %	0 %	50 %	25 %	187734302
5	NC_010660	CTTT	2	8	723	730	0 %	75 %	0 %	25 %	187734302
6	NC_010660	CCAT	2	8	975	982	25 %	25 %	0 %	50 %	187734302
7	NC_010660	CTTC	2	8	1250	1257	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_010660	ATCA	2	8	1407	1414	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_010660	GTAG	2	8	1686	1693	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010660	TCTA	2	8	2067	2074	25 %	50 %	0 %	25 %	187734305
11	NC_010660	ACAA	2	8	2376	2383	75 %	0 %	0 %	25 %	187734305
12	NC_010660	TCTT	2	8	2499	2506	0 %	75 %	0 %	25 %	187734305
13	NC_010660	AATT	2	8	3063	3070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010660	AAAT	2	8	3080	3087	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010660	CGCT	2	8	3278	3285	0 %	25 %	25 %	50 %	187734378
16	NC_010660	TTAT	2	8	3489	3496	25 %	75 %	0 %	0 %	187734378
17	NC_010660	TTGG	2	8	3573	3580	0 %	50 %	50 %	0 %	187734378
18	NC_010660	GCCA	2	8	4562	4569	25 %	0 %	25 %	50 %	187734436
19	NC_010660	CAGC	2	8	4695	4702	25 %	0 %	25 %	50 %	187734436
20	NC_010660	AGGA	2	8	5035	5042	50 %	0 %	50 %	0 %	187734412
21	NC_010660	GCGA	2	8	5222	5229	25 %	0 %	50 %	25 %	187734319
22	NC_010660	CTTT	2	8	5689	5696	0 %	75 %	0 %	25 %	187734319
23	NC_010660	CCAT	2	8	5941	5948	25 %	25 %	0 %	50 %	187734319
24	NC_010660	CTTC	2	8	6216	6223	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010660	ATCA	2	8	6373	6380	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_010660	GCTG	2	8	6943	6950	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_010660	TGGC	2	8	7076	7083	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_010660	CCGG	2	8	7663	7670	0 %	0 %	50 %	50 %	187734373
29	NC_010660	CGAC	2	8	8095	8102	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010660	TCTG	2	8	8214	8221	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_010660	CAGC	2	8	8794	8801	25 %	0 %	25 %	50 %	187734407
32	NC_010660	GGAT	2	8	9086	9093	25 %	25 %	50 %	0 %	187734407
33	NC_010660	GTCA	2	8	9253	9260	25 %	25 %	25 %	25 %	187734407
34	NC_010660	CTTT	2	8	9746	9753	0 %	75 %	0 %	25 %	187734407
35	NC_010660	GCGA	2	8	10489	10496	25 %	0 %	50 %	25 %	187734277
36	NC_010660	AGGA	2	8	11100	11107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010660	TATT	2	8	11779	11786	25 %	75 %	0 %	0 %	187734514
38	NC_010660	TGTT	2	8	12739	12746	0 %	75 %	25 %	0 %	187734514
39	NC_010660	AAAT	2	8	13083	13090	75 %	25 %	0 %	0 %	187734514
40	NC_010660	ACAT	2	8	13130	13137	50 %	25 %	0 %	25 %	187734514
41	NC_010660	TTTA	2	8	13454	13461	25 %	75 %	0 %	0 %	187734514
42	NC_010660	CATG	2	8	14357	14364	25 %	25 %	25 %	25 %	187734453
43	NC_010660	ATTG	2	8	14657	14664	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010660	CCTG	2	8	15103	15110	0 %	25 %	25 %	50 %	187734487
45	NC_010660	TCAT	2	8	15713	15720	25 %	50 %	0 %	25 %	187734306
46	NC_010660	TCTT	2	8	16052	16059	0 %	75 %	0 %	25 %	187734306
47	NC_010660	CATT	2	8	16382	16389	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_010660	TTTG	2	8	16847	16854	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010660	ATTG	2	8	17003	17010	25 %	50 %	25 %	0 %	187734323
50	NC_010660	CCAG	2	8	17501	17508	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010660	CTGT	2	8	18006	18013	0 %	50 %	25 %	25 %	187734290
52	NC_010660	TACT	2	8	18126	18133	25 %	50 %	0 %	25 %	187734290
53	NC_010660	CAGT	2	8	18194	18201	25 %	25 %	25 %	25 %	187734441
54	NC_010660	ACTG	2	8	18208	18215	25 %	25 %	25 %	25 %	187734441
55	NC_010660	CGTC	2	8	18647	18654	0 %	25 %	25 %	50 %	187734441
56	NC_010660	GCCG	2	8	19904	19911	0 %	0 %	50 %	50 %	187734403
57	NC_010660	CTGG	2	8	20020	20027	0 %	25 %	50 %	25 %	187734347
58	NC_010660	TCCG	2	8	20728	20735	0 %	25 %	25 %	50 %	187734287
59	NC_010660	ATCC	2	8	21273	21280	25 %	25 %	0 %	50 %	187734287
60	NC_010660	ATTC	2	8	21513	21520	25 %	50 %	0 %	25 %	187734287
61	NC_010660	TTGA	2	8	21826	21833	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010660	CAAC	2	8	22004	22011	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_010660	ACTA	2	8	22124	22131	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_010660	ATGA	2	8	22264	22271	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010660	TCAG	2	8	22346	22353	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_010660	AATA	2	8	23157	23164	75 %	25 %	0 %	0 %	187734502
67	NC_010660	TTTC	2	8	23327	23334	0 %	75 %	0 %	25 %	187734502
68	NC_010660	CAGA	2	8	23759	23766	50 %	0 %	25 %	25 %	187734502
69	NC_010660	AAAC	2	8	23908	23915	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_010660	ACGA	2	8	23962	23969	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_010660	ATGA	2	8	24723	24730	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010660	AAAT	2	8	25061	25068	75 %	25 %	0 %	0 %	187734450
73	NC_010660	AAGT	2	8	25583	25590	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010660	GCCT	2	8	26049	26056	0 %	25 %	25 %	50 %	187734491
75	NC_010660	GGCT	2	8	26147	26154	0 %	25 %	50 %	25 %	187734491
76	NC_010660	GCCA	2	8	27370	27377	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_010660	CAGC	2	8	27503	27510	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010660	TCGC	2	8	28388	28395	0 %	25 %	25 %	50 %	187734510
79	NC_010660	CATT	2	8	28442	28449	25 %	50 %	0 %	25 %	187734510
80	NC_010660	GCTG	2	8	28955	28962	0 %	25 %	50 %	25 %	187734510
81	NC_010660	CTCA	2	8	29450	29457	25 %	25 %	0 %	50 %	187734374
82	NC_010660	TCAG	2	8	29701	29708	25 %	25 %	25 %	25 %	187734374
83	NC_010660	CAGA	2	8	29900	29907	50 %	0 %	25 %	25 %	187734374
84	NC_010660	CCGT	2	8	30395	30402	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_010660	ATTC	2	8	30538	30545	25 %	50 %	0 %	25 %	187734420
86	NC_010660	TGCA	2	8	30605	30612	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_010660	TAAG	2	8	30693	30700	50 %	25 %	25 %	0 %	187734365
88	NC_010660	GGAT	2	8	31573	31580	25 %	25 %	50 %	0 %	187734365
89	NC_010660	ACCG	2	8	31889	31896	25 %	0 %	25 %	50 %	187734461
90	NC_010660	ACAG	2	8	32070	32077	50 %	0 %	25 %	25 %	187734461
91	NC_010660	ACGT	2	8	32751	32758	25 %	25 %	25 %	25 %	187734461
92	NC_010660	CTGG	2	8	33228	33235	0 %	25 %	50 %	25 %	187734419
93	NC_010660	GGTT	2	8	33488	33495	0 %	50 %	50 %	0 %	187734419
94	NC_010660	TCCT	2	8	33935	33942	0 %	50 %	0 %	50 %	187734335
95	NC_010660	GCAT	2	8	34206	34213	25 %	25 %	25 %	25 %	187734335
96	NC_010660	TCCA	2	8	34475	34482	25 %	25 %	0 %	50 %	187734335
97	NC_010660	TCCA	2	8	34601	34608	25 %	25 %	0 %	50 %	187734335
98	NC_010660	AATG	2	8	35153	35160	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010660	CAGT	2	8	35316	35323	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010660	CCAC	2	8	35553	35560	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
101	NC_010660	CCAC	2	8	35910	35917	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
102	NC_010660	ATAC	2	8	36090	36097	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_010660	GTAA	2	8	36277	36284	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010660	TCTT	2	8	36529	36536	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_010660	ACGA	2	8	37307	37314	50 %	0 %	25 %	25 %	187734506
106	NC_010660	ATAC	2	8	37443	37450	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_010660	AGAA	2	8	37542	37549	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010660	AAAT	2	8	38826	38833	75 %	25 %	0 %	0 %	187734397
109	NC_010660	GCAG	2	8	39424	39431	25 %	0 %	50 %	25 %	187734397
110	NC_010660	GTCT	2	8	39842	39849	0 %	50 %	25 %	25 %	187734397
111	NC_010660	GAAA	2	8	39852	39859	75 %	0 %	25 %	0 %	187734397
112	NC_010660	AATA	2	8	40043	40050	75 %	25 %	0 %	0 %	187734397
113	NC_010660	GCAC	2	8	40201	40208	25 %	0 %	25 %	50 %	187734349
114	NC_010660	GCAC	2	8	41134	41141	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_010660	CGCT	2	8	41154	41161	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_010660	GCAG	2	8	42401	42408	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_010660	CAGA	2	8	42438	42445	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_010660	TAAG	2	8	42666	42673	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010660	CAGC	2	8	43063	43070	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_010660	GGAT	2	8	43355	43362	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010660	GTCA	2	8	43522	43529	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_010660	CTTT	2	8	44015	44022	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_010660	GCGA	2	8	44757	44764	25 %	0 %	50 %	25 %	187734350
124	NC_010660	AATG	2	8	45217	45224	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010660	GGAA	2	8	45226	45233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010660	GCGA	2	8	45587	45594	25 %	0 %	50 %	25 %	187734481
127	NC_010660	CTTT	2	8	46054	46061	0 %	75 %	0 %	25 %	187734481
128	NC_010660	CCAT	2	8	46306	46313	25 %	25 %	0 %	50 %	187734481
129	NC_010660	CTTC	2	8	46581	46588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_010660	ATCA	2	8	46738	46745	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_010660	CTTC	2	8	46931	46938	0 %	50 %	0 %	50 %	187734338
132	NC_010660	CTTC	2	8	49066	49073	0 %	50 %	0 %	50 %	187734384
133	NC_010660	TTTC	2	8	49660	49667	0 %	75 %	0 %	25 %	187734384
134	NC_010660	TGAC	2	8	49831	49838	25 %	25 %	25 %	25 %	187734384
135	NC_010660	GTTG	2	8	50366	50373	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010660	TTAC	2	8	51346	51353	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_010660	GTAT	2	8	51533	51540	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010660	GTGG	2	8	51713	51720	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010660	TCTG	2	8	51987	51994	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_010660	AGGA	2	8	52424	52431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010660	GATG	2	8	53331	53338	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010660	CGAA	2	8	53396	53403	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_010660	TTTA	2	8	54009	54016	25 %	75 %	0 %	0 %	187734415
144	NC_010660	ACAA	2	8	54777	54784	75 %	0 %	0 %	25 %	187734415
145	NC_010660	GAAT	2	8	55324	55331	50 %	25 %	25 %	0 %	187734415
146	NC_010660	GCAG	2	8	55402	55409	25 %	0 %	50 %	25 %	187734415
147	NC_010660	TGAC	2	8	55560	55567	25 %	25 %	25 %	25 %	187734415
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