MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 plasmid pBS512_211

Total Repeats: 374

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010660	AG	3	6	65	70	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010660	CT	3	6	393	398	0 %	50 %	0 %	50 %	187734302
3	NC_010660	TC	4	8	668	675	0 %	50 %	0 %	50 %	187734302
4	NC_010660	TG	3	6	1369	1374	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010660	AT	3	6	1874	1879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010660	GA	3	6	2036	2041	50 %	0 %	50 %	0 %	187734305
7	NC_010660	CT	3	6	2517	2522	0 %	50 %	0 %	50 %	187734305
8	NC_010660	AT	3	6	4170	4175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010660	CT	3	6	5359	5364	0 %	50 %	0 %	50 %	187734319
10	NC_010660	TC	4	8	5634	5641	0 %	50 %	0 %	50 %	187734319
11	NC_010660	TG	3	6	6335	6340	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010660	AG	3	6	7373	7378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010660	TG	3	6	7388	7393	0 %	50 %	50 %	0 %	187734373
14	NC_010660	AT	3	6	8371	8376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010660	CT	3	6	10546	10551	0 %	50 %	0 %	50 %	187734277
16	NC_010660	TA	3	6	12095	12100	50 %	50 %	0 %	0 %	187734514
17	NC_010660	TG	3	6	12155	12160	0 %	50 %	50 %	0 %	187734514
18	NC_010660	TA	3	6	12557	12562	50 %	50 %	0 %	0 %	187734514
19	NC_010660	AT	3	6	12692	12697	50 %	50 %	0 %	0 %	187734514
20	NC_010660	AT	4	8	13250	13257	50 %	50 %	0 %	0 %	187734514
21	NC_010660	TA	3	6	13603	13608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010660	AT	3	6	14430	14435	50 %	50 %	0 %	0 %	187734453
23	NC_010660	AT	3	6	14505	14510	50 %	50 %	0 %	0 %	187734453
24	NC_010660	AT	3	6	14643	14648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010660	GC	3	6	15293	15298	0 %	0 %	50 %	50 %	187734487
26	NC_010660	TA	3	6	15669	15674	50 %	50 %	0 %	0 %	187734306
27	NC_010660	AT	3	6	15821	15826	50 %	50 %	0 %	0 %	187734306
28	NC_010660	AT	3	6	15953	15958	50 %	50 %	0 %	0 %	187734306
29	NC_010660	GT	3	6	16175	16180	0 %	50 %	50 %	0 %	187734306
30	NC_010660	TA	4	8	16188	16195	50 %	50 %	0 %	0 %	187734306
31	NC_010660	AT	5	10	16264	16273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010660	CT	3	6	16754	16759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010660	AC	3	6	19124	19129	50 %	0 %	0 %	50 %	187734441
34	NC_010660	GA	3	6	19430	19435	50 %	0 %	50 %	0 %	187734441
35	NC_010660	TG	3	6	19683	19688	0 %	50 %	50 %	0 %	187734403
36	NC_010660	AT	3	6	22994	22999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010660	AT	3	6	23712	23717	50 %	50 %	0 %	0 %	187734502
38	NC_010660	AT	3	6	23720	23725	50 %	50 %	0 %	0 %	187734502
39	NC_010660	TC	3	6	23868	23873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_010660	TG	3	6	23881	23886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010660	AG	3	6	24354	24359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010660	CT	3	6	24791	24796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010660	AG	3	6	24802	24807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010660	AT	3	6	25434	25439	50 %	50 %	0 %	0 %	187734450
45	NC_010660	AT	3	6	25595	25600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010660	GA	3	6	25903	25908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010660	TC	4	8	28453	28460	0 %	50 %	0 %	50 %	187734510
48	NC_010660	CG	3	6	28682	28687	0 %	0 %	50 %	50 %	187734510
49	NC_010660	TC	3	6	28796	28801	0 %	50 %	0 %	50 %	187734510
50	NC_010660	GT	3	6	30055	30060	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010660	GC	3	6	30568	30573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_010660	CG	3	6	30831	30836	0 %	0 %	50 %	50 %	187734365
53	NC_010660	GT	3	6	31029	31034	0 %	50 %	50 %	0 %	187734365
54	NC_010660	GA	3	6	31721	31726	50 %	0 %	50 %	0 %	187734365
55	NC_010660	AG	3	6	32380	32385	50 %	0 %	50 %	0 %	187734461
56	NC_010660	AT	3	6	32531	32536	50 %	50 %	0 %	0 %	187734461
57	NC_010660	GA	3	6	33816	33821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010660	TG	3	6	36074	36079	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010660	AG	3	6	37214	37219	50 %	0 %	50 %	0 %	187734506
60	NC_010660	AT	3	6	39292	39297	50 %	50 %	0 %	0 %	187734397
61	NC_010660	TA	3	6	39534	39539	50 %	50 %	0 %	0 %	187734397
62	NC_010660	AC	3	6	39706	39711	50 %	0 %	0 %	50 %	187734397
63	NC_010660	GA	3	6	39733	39738	50 %	0 %	50 %	0 %	187734397
64	NC_010660	AT	3	6	40877	40882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010660	TA	3	6	41431	41436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010660	CT	3	6	44814	44819	0 %	50 %	0 %	50 %	187734350
67	NC_010660	TC	3	6	45280	45285	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_010660	CT	3	6	45724	45729	0 %	50 %	0 %	50 %	187734481
69	NC_010660	TC	4	8	45999	46006	0 %	50 %	0 %	50 %	187734481
70	NC_010660	TG	3	6	46700	46705	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010660	AT	3	6	47129	47134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010660	CT	3	6	47617	47622	0 %	50 %	0 %	50 %	187734345
73	NC_010660	TA	4	8	47872	47879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010660	AT	3	6	48006	48011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010660	AC	3	6	48083	48088	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_010660	TA	3	6	49352	49357	50 %	50 %	0 %	0 %	187734384
77	NC_010660	CG	3	6	49431	49436	0 %	0 %	50 %	50 %	187734384
78	NC_010660	AT	3	6	49473	49478	50 %	50 %	0 %	0 %	187734384
79	NC_010660	AC	3	6	51550	51555	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_010660	AT	3	6	52144	52149	50 %	50 %	0 %	0 %	187734274
81	NC_010660	TG	3	6	52892	52897	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010660	AG	3	6	53606	53611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010660	AT	3	6	53655	53660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010660	GA	3	6	53696	53701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010660	AT	3	6	53949	53954	50 %	50 %	0 %	0 %	187734415
86	NC_010660	CT	3	6	55982	55987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_010660	GC	3	6	57226	57231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_010660	TA	3	6	58274	58279	50 %	50 %	0 %	0 %	187734334
89	NC_010660	AG	3	6	58392	58397	50 %	0 %	50 %	0 %	187734334
90	NC_010660	TC	3	6	59860	59865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_010660	TA	3	6	60218	60223	50 %	50 %	0 %	0 %	187734276
92	NC_010660	AT	3	6	60393	60398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010660	AG	3	6	60457	60462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010660	AT	3	6	60506	60511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010660	AT	3	6	60578	60583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010660	AT	3	6	60633	60638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010660	GA	3	6	61367	61372	50 %	0 %	50 %	0 %	187734401
98	NC_010660	TG	3	6	62811	62816	0 %	50 %	50 %	0 %	187734321
99	NC_010660	AT	3	6	63936	63941	50 %	50 %	0 %	0 %	187734398
100	NC_010660	TC	4	8	64335	64342	0 %	50 %	0 %	50 %	187734438
101	NC_010660	CG	3	6	64451	64456	0 %	0 %	50 %	50 %	187734346
102	NC_010660	TC	3	6	64638	64643	0 %	50 %	0 %	50 %	187734346
103	NC_010660	CA	3	6	64644	64649	50 %	0 %	0 %	50 %	187734346
104	NC_010660	GC	3	6	64867	64872	0 %	0 %	50 %	50 %	187734346
105	NC_010660	TG	3	6	65869	65874	0 %	50 %	50 %	0 %	187734281
106	NC_010660	CT	3	6	66916	66921	0 %	50 %	0 %	50 %	187734505
107	NC_010660	TA	3	6	67982	67987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010660	AT	3	6	68251	68256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010660	AT	3	6	68310	68315	50 %	50 %	0 %	0 %	187734494
110	NC_010660	TA	4	8	68570	68577	50 %	50 %	0 %	0 %	187734494
111	NC_010660	AT	3	6	69054	69059	50 %	50 %	0 %	0 %	187734494
112	NC_010660	AT	3	6	69394	69399	50 %	50 %	0 %	0 %	187734494
113	NC_010660	GA	3	6	69502	69507	50 %	0 %	50 %	0 %	187734494
114	NC_010660	AT	3	6	69709	69714	50 %	50 %	0 %	0 %	187734494
115	NC_010660	TA	4	8	69800	69807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010660	AT	3	6	70132	70137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010660	TG	3	6	70223	70228	0 %	50 %	50 %	0 %	187734381
118	NC_010660	GA	3	6	70631	70636	50 %	0 %	50 %	0 %	187734354
119	NC_010660	AG	3	6	70788	70793	50 %	0 %	50 %	0 %	187734354
120	NC_010660	TG	3	6	70946	70951	0 %	50 %	50 %	0 %	187734396
121	NC_010660	CG	3	6	71013	71018	0 %	0 %	50 %	50 %	187734396
122	NC_010660	TG	3	6	71701	71706	0 %	50 %	50 %	0 %	187734427
123	NC_010660	GT	3	6	72254	72259	0 %	50 %	50 %	0 %	187734427
124	NC_010660	AG	3	6	72629	72634	50 %	0 %	50 %	0 %	187734427
125	NC_010660	CG	3	6	72709	72714	0 %	0 %	50 %	50 %	187734496
126	NC_010660	AG	3	6	73107	73112	50 %	0 %	50 %	0 %	187734496
127	NC_010660	GT	3	6	73661	73666	0 %	50 %	50 %	0 %	187734496
128	NC_010660	CG	3	6	73697	73702	0 %	0 %	50 %	50 %	187734496
129	NC_010660	AT	3	6	74179	74184	50 %	50 %	0 %	0 %	187734496
130	NC_010660	AG	3	6	76120	76125	50 %	0 %	50 %	0 %	187734417
131	NC_010660	AC	3	6	76467	76472	50 %	0 %	0 %	50 %	187734417
132	NC_010660	AT	3	6	76775	76780	50 %	50 %	0 %	0 %	187734311
133	NC_010660	AT	3	6	76785	76790	50 %	50 %	0 %	0 %	187734311
134	NC_010660	GC	3	6	77074	77079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_010660	TC	3	6	77429	77434	0 %	50 %	0 %	50 %	187734416
136	NC_010660	GT	3	6	77735	77740	0 %	50 %	50 %	0 %	187734416
137	NC_010660	GT	3	6	78734	78739	0 %	50 %	50 %	0 %	187734376
138	NC_010660	GA	3	6	78741	78746	50 %	0 %	50 %	0 %	187734376
139	NC_010660	TG	3	6	78861	78866	0 %	50 %	50 %	0 %	187734376
140	NC_010660	CG	3	6	78928	78933	0 %	0 %	50 %	50 %	187734376
141	NC_010660	AG	4	8	79041	79048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010660	GC	3	6	79730	79735	0 %	0 %	50 %	50 %	187734317
143	NC_010660	AC	3	6	80166	80171	50 %	0 %	0 %	50 %	187734511
144	NC_010660	TG	3	6	80525	80530	0 %	50 %	50 %	0 %	187734511
145	NC_010660	GT	3	6	81724	81729	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010660	CA	3	6	82161	82166	50 %	0 %	0 %	50 %	187734352
147	NC_010660	TA	3	6	82988	82993	50 %	50 %	0 %	0 %	187734428
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.