MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 plasmid pBS512_211

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010660	AG	3	6	65	70	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010660	TG	3	6	1369	1374	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010660	AT	3	6	1874	1879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010660	AT	3	6	4170	4175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010660	TG	3	6	6335	6340	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010660	AG	3	6	7373	7378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010660	AT	3	6	8371	8376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010660	TA	3	6	13603	13608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010660	AT	3	6	14643	14648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010660	AT	5	10	16264	16273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010660	CT	3	6	16754	16759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_010660	AT	3	6	22994	22999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010660	TC	3	6	23868	23873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_010660	TG	3	6	23881	23886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010660	AG	3	6	24354	24359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010660	CT	3	6	24791	24796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_010660	AG	3	6	24802	24807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010660	AT	3	6	25595	25600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010660	GA	3	6	25903	25908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010660	GT	3	6	30055	30060	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010660	GC	3	6	30568	30573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_010660	GA	3	6	33816	33821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010660	TG	3	6	36074	36079	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010660	AT	3	6	40877	40882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010660	TA	3	6	41431	41436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010660	TC	3	6	45280	45285	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010660	TG	3	6	46700	46705	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010660	AT	3	6	47129	47134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010660	TA	4	8	47872	47879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010660	AT	3	6	48006	48011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010660	AC	3	6	48083	48088	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010660	AC	3	6	51550	51555	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010660	TG	3	6	52892	52897	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010660	AG	3	6	53606	53611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010660	AT	3	6	53655	53660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010660	GA	3	6	53696	53701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010660	CT	3	6	55982	55987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010660	GC	3	6	57226	57231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010660	TC	3	6	59860	59865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_010660	AT	3	6	60393	60398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010660	AG	3	6	60457	60462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010660	AT	3	6	60506	60511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010660	AT	3	6	60578	60583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010660	AT	3	6	60633	60638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010660	TA	3	6	67982	67987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010660	AT	3	6	68251	68256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010660	TA	4	8	69800	69807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010660	AT	3	6	70132	70137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010660	GC	3	6	77074	77079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010660	AG	4	8	79041	79048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010660	GT	3	6	81724	81729	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010660	TC	3	6	91432	91437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_010660	CG	3	6	97446	97451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_010660	GA	4	8	97673	97680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010660	AT	3	6	98789	98794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010660	AT	3	6	100642	100647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010660	AT	3	6	105383	105388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010660	AT	3	6	105404	105409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010660	AT	3	6	111515	111520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010660	AG	3	6	111544	111549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010660	CA	3	6	125843	125848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_010660	AG	3	6	131125	131130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010660	TA	3	6	131161	131166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010660	TA	3	6	136518	136523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010660	CA	3	6	142545	142550	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_010660	CA	3	6	143142	143147	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_010660	GT	3	6	143237	143242	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010660	AT	4	8	145424	145431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010660	AT	3	6	145788	145793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010660	AT	3	6	145842	145847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010660	AT	3	6	149504	149509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010660	GA	3	6	156732	156737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010660	TG	3	6	163361	163366	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010660	TG	3	6	165749	165754	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010660	AT	3	6	169140	169145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010660	TA	3	6	171910	171915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010660	TA	3	6	171921	171926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010660	CA	3	6	172395	172400	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_010660	TG	3	6	172422	172427	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010660	AT	3	6	174238	174243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010660	GT	3	6	178322	178327	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010660	CA	3	6	179010	179015	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_010660	AT	3	6	180333	180338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010660	AC	3	6	180953	180958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_010660	TG	3	6	181293	181298	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010660	AC	3	6	183431	183436	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_010660	AG	3	6	184748	184753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010660	CA	3	6	185339	185344	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010660	GA	3	6	185838	185843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010660	GC	3	6	185882	185887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_010660	CA	3	6	185960	185965	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_010660	CA	3	6	186038	186043	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_010660	TG	3	6	190139	190144	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010660	AT	3	6	190210	190215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010660	TC	4	8	195368	195375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_010660	CT	3	6	198718	198723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_010660	AT	4	8	198860	198867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010660	AT	3	6	200520	200525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010660	GA	3	6	208055	208060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010660	AT	3	6	209855	209860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010660	CA	3	6	210311	210316	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.