MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 plasmid pBS512_211

Total Repeats: 435

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010660	T	6	6	1097	1102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010660	A	6	6	1740	1745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010660	T	7	7	1794	1800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010660	A	6	6	1989	1994	100 %	0 %	0 %	0 %	187734305
5	NC_010660	T	7	7	2027	2033	0 %	100 %	0 %	0 %	187734305
6	NC_010660	A	6	6	2141	2146	100 %	0 %	0 %	0 %	187734305
7	NC_010660	A	7	7	2253	2259	100 %	0 %	0 %	0 %	187734305
8	NC_010660	T	7	7	2526	2532	0 %	100 %	0 %	0 %	187734305
9	NC_010660	A	7	7	2562	2568	100 %	0 %	0 %	0 %	187734305
10	NC_010660	T	6	6	2810	2815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010660	A	6	6	2897	2902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010660	T	6	6	2971	2976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010660	T	6	6	3019	3024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010660	T	6	6	3038	3043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010660	T	6	6	3111	3116	0 %	100 %	0 %	0 %	187734378
16	NC_010660	A	6	6	3779	3784	100 %	0 %	0 %	0 %	187734378
17	NC_010660	T	6	6	4216	4221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010660	A	7	7	4225	4231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010660	T	6	6	4303	4308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010660	T	6	6	4809	4814	0 %	100 %	0 %	0 %	187734436
21	NC_010660	T	6	6	6063	6068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010660	A	6	6	6831	6836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010660	G	6	6	7678	7683	0 %	0 %	100 %	0 %	187734373
24	NC_010660	T	7	7	8363	8369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010660	A	6	6	11763	11768	100 %	0 %	0 %	0 %	187734514
26	NC_010660	T	7	7	11800	11806	0 %	100 %	0 %	0 %	187734514
27	NC_010660	T	6	6	11988	11993	0 %	100 %	0 %	0 %	187734514
28	NC_010660	T	6	6	12072	12077	0 %	100 %	0 %	0 %	187734514
29	NC_010660	G	6	6	12111	12116	0 %	0 %	100 %	0 %	187734514
30	NC_010660	A	6	6	12293	12298	100 %	0 %	0 %	0 %	187734514
31	NC_010660	A	7	7	12824	12830	100 %	0 %	0 %	0 %	187734514
32	NC_010660	T	8	8	13023	13030	0 %	100 %	0 %	0 %	187734514
33	NC_010660	A	8	8	13039	13046	100 %	0 %	0 %	0 %	187734514
34	NC_010660	T	6	6	13120	13125	0 %	100 %	0 %	0 %	187734514
35	NC_010660	T	6	6	13137	13142	0 %	100 %	0 %	0 %	187734514
36	NC_010660	T	6	6	13422	13427	0 %	100 %	0 %	0 %	187734514
37	NC_010660	A	7	7	14418	14424	100 %	0 %	0 %	0 %	187734453
38	NC_010660	T	6	6	14606	14611	0 %	100 %	0 %	0 %	187734453
39	NC_010660	A	6	6	15762	15767	100 %	0 %	0 %	0 %	187734306
40	NC_010660	T	6	6	16180	16185	0 %	100 %	0 %	0 %	187734306
41	NC_010660	A	6	6	16923	16928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010660	T	6	6	17031	17036	0 %	100 %	0 %	0 %	187734323
43	NC_010660	T	6	6	17723	17728	0 %	100 %	0 %	0 %	187734318
44	NC_010660	A	7	7	18166	18172	100 %	0 %	0 %	0 %	187734290
45	NC_010660	T	6	6	18739	18744	0 %	100 %	0 %	0 %	187734441
46	NC_010660	A	7	7	19530	19536	100 %	0 %	0 %	0 %	187734441
47	NC_010660	A	6	6	19778	19783	100 %	0 %	0 %	0 %	187734403
48	NC_010660	A	6	6	22015	22020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010660	A	6	6	22710	22715	100 %	0 %	0 %	0 %	187734372
50	NC_010660	T	7	7	23068	23074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010660	T	9	9	23123	23131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010660	G	8	8	23308	23315	0 %	0 %	100 %	0 %	187734502
53	NC_010660	A	6	6	23992	23997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010660	T	6	6	24781	24786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010660	A	8	8	25133	25140	100 %	0 %	0 %	0 %	187734450
56	NC_010660	T	6	6	25414	25419	0 %	100 %	0 %	0 %	187734450
57	NC_010660	A	6	6	26727	26732	100 %	0 %	0 %	0 %	187734339
58	NC_010660	A	6	6	26793	26798	100 %	0 %	0 %	0 %	187734339
59	NC_010660	T	6	6	27617	27622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010660	A	6	6	29062	29067	100 %	0 %	0 %	0 %	187734510
61	NC_010660	C	8	8	29112	29119	0 %	0 %	0 %	100 %	187734510
62	NC_010660	C	6	6	29659	29664	0 %	0 %	0 %	100 %	187734374
63	NC_010660	T	8	8	30630	30637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010660	T	6	6	30780	30785	0 %	100 %	0 %	0 %	187734365
65	NC_010660	T	7	7	32928	32934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010660	T	6	6	33471	33476	0 %	100 %	0 %	0 %	187734419
67	NC_010660	C	6	6	34458	34463	0 %	0 %	0 %	100 %	187734335
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70	NC_010660	A	7	7	38959	38965	100 %	0 %	0 %	0 %	187734397
71	NC_010660	A	6	6	39719	39724	100 %	0 %	0 %	0 %	187734397
72	NC_010660	T	6	6	40468	40473	0 %	100 %	0 %	0 %	187734349
73	NC_010660	C	6	6	40991	40996	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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75	NC_010660	A	6	6	41773	41778	100 %	0 %	0 %	0 %	187734390
76	NC_010660	T	6	6	45179	45184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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79	NC_010660	T	6	6	47046	47051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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81	NC_010660	A	6	6	47572	47577	100 %	0 %	0 %	0 %	187734345
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83	NC_010660	A	6	6	47925	47930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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89	NC_010660	A	7	7	53189	53195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010660	T	6	6	53200	53205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010660	A	6	6	53265	53270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010660	A	8	8	53534	53541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010660	A	7	7	53579	53585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010660	A	6	6	54187	54192	100 %	0 %	0 %	0 %	187734415
95	NC_010660	C	6	6	54449	54454	0 %	0 %	0 %	100 %	187734415
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99	NC_010660	T	6	6	57936	57941	0 %	100 %	0 %	0 %	187734334
100	NC_010660	T	7	7	58210	58216	0 %	100 %	0 %	0 %	187734334
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102	NC_010660	T	7	7	58539	58545	0 %	100 %	0 %	0 %	187734334
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105	NC_010660	A	6	6	59995	60000	100 %	0 %	0 %	0 %	187734355
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108	NC_010660	A	6	6	60207	60212	100 %	0 %	0 %	0 %	187734276
109	NC_010660	G	9	9	60693	60701	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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111	NC_010660	C	6	6	60834	60839	0 %	0 %	0 %	100 %	187734388
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113	NC_010660	T	6	6	61575	61580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010660	A	7	7	61913	61919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010660	T	6	6	62020	62025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010660	T	6	6	63070	63075	0 %	100 %	0 %	0 %	187734321
117	NC_010660	A	7	7	63527	63533	100 %	0 %	0 %	0 %	187734465
118	NC_010660	T	6	6	63761	63766	0 %	100 %	0 %	0 %	187734398
119	NC_010660	T	6	6	64375	64380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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130	NC_010660	A	6	6	67603	67608	100 %	0 %	0 %	0 %	187734505
131	NC_010660	A	6	6	67839	67844	100 %	0 %	0 %	0 %	187734505
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138	NC_010660	T	6	6	69137	69142	0 %	100 %	0 %	0 %	187734494
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146	NC_010660	T	7	7	70157	70163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010660	C	6	6	70710	70715	0 %	0 %	0 %	100 %	187734354
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.