MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 plasmid pBS512_5

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010659	GAA	2	6	376	381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734271
2	NC_010659	GAT	2	6	409	414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734271
3	NC_010659	GCT	2	6	453	458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734271
4	NC_010659	CGC	2	6	672	677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734271
5	NC_010659	CGT	2	6	841	846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734271
6	NC_010659	GCG	2	6	1231	1236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734271
7	NC_010659	GCA	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734269
8	NC_010659	CCA	2	6	1624	1629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734269
9	NC_010659	TGC	2	6	1745	1750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734269
10	NC_010659	GCT	2	6	1752	1757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734269
11	NC_010659	CGT	2	6	1808	1813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734269
12	NC_010659	CTG	2	6	1853	1858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734269
13	NC_010659	ATA	2	6	1972	1977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734269
14	NC_010659	ATC	2	6	2010	2015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734269
15	NC_010659	GGA	2	6	2203	2208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187734270
16	NC_010659	CAT	2	6	2238	2243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734270
17	NC_010659	GAA	2	6	2248	2253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734270
18	NC_010659	AAC	2	6	2355	2360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734270
19	NC_010659	TTG	2	6	2370	2375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734270
20	NC_010659	ATG	2	6	2499	2504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734270
21	NC_010659	GCC	2	6	2612	2617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734270
22	NC_010659	TTG	2	6	2619	2624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734270
23	NC_010659	ATC	2	6	2694	2699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734270
24	NC_010659	GCC	2	6	2759	2764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734270
25	NC_010659	TTG	2	6	2784	2789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734270
26	NC_010659	GGA	2	6	2802	2807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187734270
27	NC_010659	CAG	2	6	2855	2860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734270
28	NC_010659	GCT	2	6	3025	3030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734270
29	NC_010659	TGT	2	6	3121	3126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734270
30	NC_010659	AAC	2	6	3159	3164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734270
31	NC_010659	GCT	2	6	3329	3334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734270
32	NC_010659	GGC	3	9	3400	3408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734270
33	NC_010659	GCA	2	6	3556	3561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734270
34	NC_010659	AGG	2	6	3564	3569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187734270
35	NC_010659	GTA	2	6	3615	3620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734270
36	NC_010659	TCT	2	6	3861	3866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734268
37	NC_010659	TAA	2	6	3873	3878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734268
38	NC_010659	GTT	2	6	3955	3960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734268
39	NC_010659	AAT	2	6	4018	4023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734268
40	NC_010659	CTC	2	6	4027	4032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187734268
41	NC_010659	ATT	2	6	4146	4151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734268
42	NC_010659	CTT	2	6	4170	4175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734268
43	NC_010659	ATC	2	6	4196	4201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734268
44	NC_010659	TTA	2	6	4285	4290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734268
45	NC_010659	CAC	2	6	4417	4422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734268
46	NC_010659	TAT	2	6	4553	4558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734268
47	NC_010659	CCA	2	6	4576	4581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734268
48	NC_010659	TGT	2	6	4633	4638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734268
49	NC_010659	TAT	2	6	4697	4702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734268

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.