MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 2348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010658	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	187733611
2	NC_010658	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	187733021
3	NC_010658	CGCAG	2	10	8359	8368	20 %	0 %	40 %	40 %	187730143
4	NC_010658	CGTAC	2	10	9787	9796	20 %	20 %	20 %	40 %	187733564
5	NC_010658	CGCGC	2	10	10774	10783	0 %	0 %	40 %	60 %	187732486
6	NC_010658	CCACT	2	10	11866	11875	20 %	20 %	0 %	60 %	187732886
7	NC_010658	CAGTG	2	10	11972	11981	20 %	20 %	40 %	20 %	187732886
8	NC_010658	ATCAC	2	10	13307	13316	40 %	20 %	0 %	40 %	187732290
9	NC_010658	CCGAT	2	10	18604	18613	20 %	20 %	20 %	40 %	187732952
10	NC_010658	AGCGA	2	10	18992	19001	40 %	0 %	40 %	20 %	187732952
11	NC_010658	GTGAT	2	10	21247	21256	20 %	40 %	40 %	0 %	187733923
12	NC_010658	AGCGA	2	10	28371	28380	40 %	0 %	40 %	20 %	187730740
13	NC_010658	CAGTA	2	10	30197	30206	40 %	20 %	20 %	20 %	187731568
14	NC_010658	GCGAA	2	10	35992	36001	40 %	0 %	40 %	20 %	187733854
15	NC_010658	CCGTT	2	10	36886	36895	0 %	40 %	20 %	40 %	187733854
16	NC_010658	CACGG	2	10	37263	37272	20 %	0 %	40 %	40 %	187733854
17	NC_010658	ATCAC	2	10	38074	38083	40 %	20 %	0 %	40 %	187730467
18	NC_010658	TGCAC	2	10	40220	40229	20 %	20 %	20 %	40 %	187731431
19	NC_010658	AGGGC	2	10	41305	41314	20 %	0 %	60 %	20 %	187732301
20	NC_010658	GGCGC	2	10	41339	41348	0 %	0 %	60 %	40 %	187732301
21	NC_010658	GAAAC	2	10	42152	42161	60 %	0 %	20 %	20 %	187732301
22	NC_010658	AACGT	2	10	44064	44073	40 %	20 %	20 %	20 %	187731366
23	NC_010658	GCGTC	2	10	47048	47057	0 %	20 %	40 %	40 %	187733861
24	NC_010658	ATGTT	2	10	47862	47871	20 %	60 %	20 %	0 %	187733413
25	NC_010658	CTTCG	2	10	48295	48304	0 %	40 %	20 %	40 %	187733413
26	NC_010658	TGCGT	2	10	48581	48590	0 %	40 %	40 %	20 %	187733413
27	NC_010658	AAAGT	2	10	54315	54324	60 %	20 %	20 %	0 %	187731450
28	NC_010658	GGTGA	2	10	56562	56571	20 %	20 %	60 %	0 %	187730247
29	NC_010658	TCGCG	2	10	59200	59209	0 %	20 %	40 %	40 %	187734070
30	NC_010658	GATGG	2	10	67566	67575	20 %	20 %	60 %	0 %	187733549
31	NC_010658	CTGGA	2	10	69370	69379	20 %	20 %	40 %	20 %	187732583
32	NC_010658	CCTGG	2	10	70944	70953	0 %	20 %	40 %	40 %	187730031
33	NC_010658	CTGGT	2	10	72663	72672	0 %	40 %	40 %	20 %	187730608
34	NC_010658	GACCG	2	10	73211	73220	20 %	0 %	40 %	40 %	187733304
35	NC_010658	ATGTT	2	10	75761	75770	20 %	60 %	20 %	0 %	187734241
36	NC_010658	AAAAC	2	10	76176	76185	80 %	0 %	0 %	20 %	187734241
37	NC_010658	AGTTC	2	10	81966	81975	20 %	40 %	20 %	20 %	187731396
38	NC_010658	CGTGG	2	10	83339	83348	0 %	20 %	60 %	20 %	187732555
39	NC_010658	TATCG	2	10	83846	83855	20 %	40 %	20 %	20 %	187732555
40	NC_010658	GCCTG	2	10	88178	88187	0 %	20 %	40 %	40 %	187732828
41	NC_010658	GTTTG	2	10	88622	88631	0 %	60 %	40 %	0 %	187732828
42	NC_010658	ACCGT	2	10	90091	90100	20 %	20 %	20 %	40 %	187732373
43	NC_010658	ATCAG	2	10	91864	91873	40 %	20 %	20 %	20 %	187730669
44	NC_010658	AGCCG	2	10	93632	93641	20 %	0 %	40 %	40 %	187730657
45	NC_010658	GCGCA	2	10	95960	95969	20 %	0 %	40 %	40 %	187731877
46	NC_010658	TGGCG	2	10	96954	96963	0 %	20 %	60 %	20 %	187733013
47	NC_010658	CCGGC	2	10	99924	99933	0 %	0 %	40 %	60 %	187731238
48	NC_010658	CGCGG	2	10	103140	103149	0 %	0 %	60 %	40 %	187730150
49	NC_010658	TCAGA	2	10	104421	104430	40 %	20 %	20 %	20 %	187734255
50	NC_010658	ATCCC	2	10	105384	105393	20 %	20 %	0 %	60 %	187732598
51	NC_010658	CATCG	2	10	105397	105406	20 %	20 %	20 %	40 %	187732598
52	NC_010658	TAACG	2	10	106091	106100	40 %	20 %	20 %	20 %	187732598
53	NC_010658	ATGCC	2	10	106550	106559	20 %	20 %	20 %	40 %	187732598
54	NC_010658	GTGAT	2	10	108571	108580	20 %	40 %	40 %	0 %	187731400
55	NC_010658	TCTGT	2	10	109545	109554	0 %	60 %	20 %	20 %	187731063
56	NC_010658	GCATG	2	10	110638	110647	20 %	20 %	40 %	20 %	187730596
57	NC_010658	AGCAG	2	10	111976	111985	40 %	0 %	40 %	20 %	187731561
58	NC_010658	TCAGC	2	10	112844	112853	20 %	20 %	20 %	40 %	187731561
59	NC_010658	CGAAG	2	10	113891	113900	40 %	0 %	40 %	20 %	187733404
60	NC_010658	ACACG	2	10	114024	114033	40 %	0 %	20 %	40 %	187733404
61	NC_010658	TCGCG	2	10	114285	114294	0 %	20 %	40 %	40 %	187733404
62	NC_010658	GCATC	2	10	114375	114384	20 %	20 %	20 %	40 %	187733404
63	NC_010658	GACTG	2	10	115693	115702	20 %	20 %	40 %	20 %	187733027
64	NC_010658	AGAGC	2	10	116103	116112	40 %	0 %	40 %	20 %	187733027
65	NC_010658	AGGCG	2	10	121375	121384	20 %	0 %	60 %	20 %	187731189
66	NC_010658	GGTTG	2	10	122128	122137	0 %	40 %	60 %	0 %	187731189
67	NC_010658	TCTGG	2	10	124774	124783	0 %	40 %	40 %	20 %	187731650
68	NC_010658	GGGCA	2	10	126185	126194	20 %	0 %	60 %	20 %	187732786
69	NC_010658	CAGCG	2	10	126463	126472	20 %	0 %	40 %	40 %	187732458
70	NC_010658	ACGAC	2	10	127743	127752	40 %	0 %	20 %	40 %	187731639
71	NC_010658	GGCTG	2	10	129174	129183	0 %	20 %	60 %	20 %	187730447
72	NC_010658	CCGTC	2	10	133251	133260	0 %	20 %	20 %	60 %	187733526
73	NC_010658	GTGAA	2	10	133261	133270	40 %	20 %	40 %	0 %	187733526
74	NC_010658	GTTCA	2	10	133648	133657	20 %	40 %	20 %	20 %	187731778
75	NC_010658	ATCCA	2	10	133974	133983	40 %	20 %	0 %	40 %	187731778
76	NC_010658	CTTTA	2	10	135237	135246	20 %	60 %	0 %	20 %	187730483
77	NC_010658	TGGCG	2	10	135464	135473	0 %	20 %	60 %	20 %	187730483
78	NC_010658	TTTCA	2	10	137765	137774	20 %	60 %	0 %	20 %	187732926
79	NC_010658	GGGAG	2	10	139090	139099	20 %	0 %	80 %	0 %	187730637
80	NC_010658	TGAAG	2	10	141200	141209	40 %	20 %	40 %	0 %	187733671
81	NC_010658	ATCAC	2	10	143239	143248	40 %	20 %	0 %	40 %	187734013
82	NC_010658	TTTGC	2	10	143685	143694	0 %	60 %	20 %	20 %	187732599
83	NC_010658	GCGAG	2	10	145493	145502	20 %	0 %	60 %	20 %	187731223
84	NC_010658	GGCGT	2	10	145931	145940	0 %	20 %	60 %	20 %	187731223
85	NC_010658	ATCAG	2	10	146569	146578	40 %	20 %	20 %	20 %	187733286
86	NC_010658	ACCAC	2	10	148834	148843	40 %	0 %	0 %	60 %	187731852
87	NC_010658	GGCGT	2	10	150537	150546	0 %	20 %	60 %	20 %	187730081
88	NC_010658	CGACG	2	10	151576	151585	20 %	0 %	40 %	40 %	187730081
89	NC_010658	TTATC	2	10	154476	154485	20 %	60 %	0 %	20 %	187731111
90	NC_010658	TGAAA	2	10	155549	155558	60 %	20 %	20 %	0 %	187731816
91	NC_010658	GGAAT	2	10	155885	155894	40 %	20 %	40 %	0 %	187731816
92	NC_010658	AACCT	2	10	157835	157844	40 %	20 %	0 %	40 %	187730584
93	NC_010658	TGGTC	2	10	157877	157886	0 %	40 %	40 %	20 %	187730584
94	NC_010658	TGGCG	2	10	159122	159131	0 %	20 %	60 %	20 %	187733484
95	NC_010658	TTCCA	2	10	160363	160372	20 %	40 %	0 %	40 %	187733484
96	NC_010658	ACGGG	2	10	166602	166611	20 %	0 %	60 %	20 %	187733138
97	NC_010658	GTGAT	2	10	168761	168770	20 %	40 %	40 %	0 %	187732326
98	NC_010658	GTGAT	2	10	169052	169061	20 %	40 %	40 %	0 %	187732326
99	NC_010658	CCACG	2	10	171195	171204	20 %	0 %	20 %	60 %	187730533
100	NC_010658	GCCAG	2	10	173481	173490	20 %	0 %	40 %	40 %	187731963
101	NC_010658	GTTCT	2	10	174922	174931	0 %	60 %	20 %	20 %	187731963
102	NC_010658	CTGAA	2	10	176914	176923	40 %	20 %	20 %	20 %	187733810
103	NC_010658	AAGCG	2	10	176978	176987	40 %	0 %	40 %	20 %	187733810
104	NC_010658	TGGTG	2	10	178884	178893	0 %	40 %	60 %	0 %	187730452
105	NC_010658	TGCAC	2	10	179010	179019	20 %	20 %	20 %	40 %	187730452
106	NC_010658	TGCGC	2	10	179403	179412	0 %	20 %	40 %	40 %	187730452
107	NC_010658	CATGG	2	10	181246	181255	20 %	20 %	40 %	20 %	187731348
108	NC_010658	CAGAT	2	10	182285	182294	40 %	20 %	20 %	20 %	187731191
109	NC_010658	ACTTT	2	10	182418	182427	20 %	60 %	0 %	20 %	187731191
110	NC_010658	GACGT	2	10	186338	186347	20 %	20 %	40 %	20 %	187733865
111	NC_010658	CGACG	2	10	188165	188174	20 %	0 %	40 %	40 %	187733476
112	NC_010658	ATGCC	2	10	190733	190742	20 %	20 %	20 %	40 %	187731703
113	NC_010658	GGATG	2	10	190995	191004	20 %	20 %	60 %	0 %	187731703
114	NC_010658	TGGCC	2	10	192059	192068	0 %	20 %	40 %	40 %	187733784
115	NC_010658	GTAAC	2	10	192802	192811	40 %	20 %	20 %	20 %	187733784
116	NC_010658	AGCCG	2	10	193430	193439	20 %	0 %	40 %	40 %	187733784
117	NC_010658	GGTGG	2	10	193539	193548	0 %	20 %	80 %	0 %	187733784
118	NC_010658	TTAAC	2	10	201682	201691	40 %	40 %	0 %	20 %	187732986
119	NC_010658	ACGGT	2	10	204594	204603	20 %	20 %	40 %	20 %	187730943
120	NC_010658	TGATT	2	10	207435	207444	20 %	60 %	20 %	0 %	187733230
121	NC_010658	TAATT	2	10	219228	219237	40 %	60 %	0 %	0 %	187733081
122	NC_010658	ACTTA	2	10	221199	221208	40 %	40 %	0 %	20 %	187731163
123	NC_010658	ACTGG	2	10	222167	222176	20 %	20 %	40 %	20 %	187730232
124	NC_010658	CGCGG	2	10	223212	223221	0 %	0 %	60 %	40 %	187734104
125	NC_010658	GTGAT	2	10	224374	224383	20 %	40 %	40 %	0 %	187733298
126	NC_010658	AAACG	2	10	231227	231236	60 %	0 %	20 %	20 %	187731026
127	NC_010658	ATCAC	2	10	231889	231898	40 %	20 %	0 %	40 %	187732216
128	NC_010658	AGGTC	2	10	234639	234648	20 %	20 %	40 %	20 %	187731740
129	NC_010658	AGCGA	2	10	239062	239071	40 %	0 %	40 %	20 %	187730843
130	NC_010658	GATGC	2	10	244026	244035	20 %	20 %	40 %	20 %	187733956
131	NC_010658	TCGCG	2	10	244211	244220	0 %	20 %	40 %	40 %	187733956
132	NC_010658	GTGAT	2	10	247229	247238	20 %	40 %	40 %	0 %	187733347
133	NC_010658	AGCGA	2	10	247791	247800	40 %	0 %	40 %	20 %	187730917
134	NC_010658	TCGCT	2	10	248002	248011	0 %	40 %	20 %	40 %	187730917
135	NC_010658	CAGAC	2	10	249824	249833	40 %	0 %	20 %	40 %	187730339
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151	NC_010658	GCACT	2	10	284391	284400	20 %	20 %	20 %	40 %	187731814
152	NC_010658	AGTGG	2	10	284498	284507	20 %	20 %	60 %	0 %	187731814
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255	NC_010658	GGTCA	2	10	507593	507602	20 %	20 %	40 %	20 %	187733384
256	NC_010658	TCAGT	2	10	509865	509874	20 %	40 %	20 %	20 %	187733501
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258	NC_010658	CCAGA	2	10	514100	514109	40 %	0 %	20 %	40 %	187733524
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260	NC_010658	CAGAC	2	10	518547	518556	40 %	0 %	20 %	40 %	187731162
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388	NC_010658	ATCAC	2	10	770212	770221	40 %	20 %	0 %	40 %	187730853
389	NC_010658	ACTTC	2	10	773071	773080	20 %	40 %	0 %	40 %	187733441
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