MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 6805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010658	TG	3	6	37	42	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010658	CT	3	6	444	449	0 %	50 %	0 %	50 %	187733611
3	NC_010658	GC	3	6	1332	1337	0 %	0 %	50 %	50 %	187733611
4	NC_010658	TG	3	6	1434	1439	0 %	50 %	50 %	0 %	187733611
5	NC_010658	CG	4	8	2525	2532	0 %	0 %	50 %	50 %	187733611
6	NC_010658	TG	3	6	3605	3610	0 %	50 %	50 %	0 %	187733021
7	NC_010658	GC	3	6	3960	3965	0 %	0 %	50 %	50 %	187732437
8	NC_010658	GC	3	6	4441	4446	0 %	0 %	50 %	50 %	187732437
9	NC_010658	AG	3	6	4881	4886	50 %	0 %	50 %	0 %	187732437
10	NC_010658	AT	3	6	5612	5617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010658	CG	3	6	7553	7558	0 %	0 %	50 %	50 %	187730478
12	NC_010658	CG	3	6	7745	7750	0 %	0 %	50 %	50 %	187730478
13	NC_010658	TA	3	6	8024	8029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010658	TC	3	6	8345	8350	0 %	50 %	0 %	50 %	187730143
15	NC_010658	CG	3	6	8432	8437	0 %	0 %	50 %	50 %	187730143
16	NC_010658	TG	3	6	9477	9482	0 %	50 %	50 %	0 %	187733564
17	NC_010658	CT	3	6	11747	11752	0 %	50 %	0 %	50 %	187732886
18	NC_010658	TC	4	8	12022	12029	0 %	50 %	0 %	50 %	187732886
19	NC_010658	TG	3	6	12727	12732	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010658	AG	3	6	13725	13730	50 %	0 %	50 %	0 %	187733929
21	NC_010658	AT	3	6	14254	14259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010658	CG	3	6	15671	15676	0 %	0 %	50 %	50 %	187731544
23	NC_010658	CG	3	6	16614	16619	0 %	0 %	50 %	50 %	187730634
24	NC_010658	CT	3	6	17669	17674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010658	CT	3	6	17832	17837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010658	CT	3	6	18797	18802	0 %	50 %	0 %	50 %	187732952
27	NC_010658	TG	3	6	18847	18852	0 %	50 %	50 %	0 %	187732952
28	NC_010658	GA	3	6	19471	19476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010658	TC	3	6	21649	21654	0 %	50 %	0 %	50 %	187732477
30	NC_010658	GT	3	6	21676	21681	0 %	50 %	50 %	0 %	187732477
31	NC_010658	AT	3	6	21847	21852	50 %	50 %	0 %	0 %	187732477
32	NC_010658	AT	3	6	22090	22095	50 %	50 %	0 %	0 %	187732477
33	NC_010658	GT	3	6	22139	22144	0 %	50 %	50 %	0 %	187732477
34	NC_010658	GT	3	6	24308	24313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010658	TC	3	6	24314	24319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010658	GC	3	6	24627	24632	0 %	0 %	50 %	50 %	187731624
37	NC_010658	GT	3	6	25037	25042	0 %	50 %	50 %	0 %	187730272
38	NC_010658	CG	3	6	25083	25088	0 %	0 %	50 %	50 %	187730272
39	NC_010658	CG	3	6	26469	26474	0 %	0 %	50 %	50 %	187730740
40	NC_010658	GC	3	6	27142	27147	0 %	0 %	50 %	50 %	187730740
41	NC_010658	CG	3	6	27216	27221	0 %	0 %	50 %	50 %	187730740
42	NC_010658	CG	3	6	27944	27949	0 %	0 %	50 %	50 %	187730740
43	NC_010658	GC	3	6	29106	29111	0 %	0 %	50 %	50 %	187733568
44	NC_010658	AT	3	6	29897	29902	50 %	50 %	0 %	0 %	187731568
45	NC_010658	TG	3	6	30247	30252	0 %	50 %	50 %	0 %	187731568
46	NC_010658	CG	3	6	30521	30526	0 %	0 %	50 %	50 %	187731568
47	NC_010658	TA	3	6	32824	32829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010658	CT	3	6	33466	33471	0 %	50 %	0 %	50 %	187733195
49	NC_010658	CG	3	6	33616	33621	0 %	0 %	50 %	50 %	187733195
50	NC_010658	GC	3	6	34429	34434	0 %	0 %	50 %	50 %	187733854
51	NC_010658	GC	3	6	34633	34638	0 %	0 %	50 %	50 %	187733854
52	NC_010658	CG	3	6	34769	34774	0 %	0 %	50 %	50 %	187733854
53	NC_010658	CA	3	6	34786	34791	50 %	0 %	0 %	50 %	187733854
54	NC_010658	TC	3	6	34931	34936	0 %	50 %	0 %	50 %	187733854
55	NC_010658	GC	5	10	36291	36300	0 %	0 %	50 %	50 %	187733854
56	NC_010658	CG	3	6	37401	37406	0 %	0 %	50 %	50 %	187733854
57	NC_010658	TC	3	6	39692	39697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_010658	AT	3	6	39735	39740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010658	CT	3	6	39885	39890	0 %	50 %	0 %	50 %	187731431
60	NC_010658	CT	3	6	40854	40859	0 %	50 %	0 %	50 %	187732301
61	NC_010658	CG	3	6	42011	42016	0 %	0 %	50 %	50 %	187732301
62	NC_010658	GA	3	6	42245	42250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010658	TA	3	6	43042	43047	50 %	50 %	0 %	0 %	187731973
64	NC_010658	CG	4	8	43352	43359	0 %	0 %	50 %	50 %	187731973
65	NC_010658	CG	4	8	43640	43647	0 %	0 %	50 %	50 %	187731973
66	NC_010658	AC	3	6	44124	44129	50 %	0 %	0 %	50 %	187731366
67	NC_010658	AC	3	6	44344	44349	50 %	0 %	0 %	50 %	187732780
68	NC_010658	GA	3	6	46256	46261	50 %	0 %	50 %	0 %	187733861
69	NC_010658	GC	4	8	46642	46649	0 %	0 %	50 %	50 %	187733861
70	NC_010658	AT	3	6	47660	47665	50 %	50 %	0 %	0 %	187733413
71	NC_010658	GC	4	8	48114	48121	0 %	0 %	50 %	50 %	187733413
72	NC_010658	GT	3	6	49884	49889	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010658	AT	3	6	49901	49906	50 %	50 %	0 %	0 %	187730491
74	NC_010658	CG	3	6	52944	52949	0 %	0 %	50 %	50 %	187731450
75	NC_010658	AG	3	6	53824	53829	50 %	0 %	50 %	0 %	187731450
76	NC_010658	CG	3	6	53898	53903	0 %	0 %	50 %	50 %	187731450
77	NC_010658	CG	4	8	54017	54024	0 %	0 %	50 %	50 %	187731450
78	NC_010658	GC	3	6	58057	58062	0 %	0 %	50 %	50 %	187734070
79	NC_010658	TG	3	6	58671	58676	0 %	50 %	50 %	0 %	187734070
80	NC_010658	CG	3	6	58986	58991	0 %	0 %	50 %	50 %	187734070
81	NC_010658	CG	3	6	59725	59730	0 %	0 %	50 %	50 %	187733621
82	NC_010658	GC	3	6	60880	60885	0 %	0 %	50 %	50 %	187733621
83	NC_010658	AG	3	6	61153	61158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010658	GA	3	6	61680	61685	50 %	0 %	50 %	0 %	187733147
85	NC_010658	CG	3	6	61749	61754	0 %	0 %	50 %	50 %	187733147
86	NC_010658	CG	3	6	63052	63057	0 %	0 %	50 %	50 %	187732393
87	NC_010658	GC	3	6	64216	64221	0 %	0 %	50 %	50 %	187732002
88	NC_010658	AC	3	6	64827	64832	50 %	0 %	0 %	50 %	187732002
89	NC_010658	AG	3	6	65376	65381	50 %	0 %	50 %	0 %	187732002
90	NC_010658	GA	3	6	65389	65394	50 %	0 %	50 %	0 %	187732002
91	NC_010658	TC	3	6	67022	67027	0 %	50 %	0 %	50 %	187733549
92	NC_010658	CG	3	6	67604	67609	0 %	0 %	50 %	50 %	187733549
93	NC_010658	GC	3	6	68818	68823	0 %	0 %	50 %	50 %	187732583
94	NC_010658	TC	3	6	69950	69955	0 %	50 %	0 %	50 %	187731256
95	NC_010658	GC	3	6	70298	70303	0 %	0 %	50 %	50 %	187731256
96	NC_010658	TG	3	6	70395	70400	0 %	50 %	50 %	0 %	187731256
97	NC_010658	CG	3	6	70762	70767	0 %	0 %	50 %	50 %	187730031
98	NC_010658	CG	3	6	70882	70887	0 %	0 %	50 %	50 %	187730031
99	NC_010658	GC	3	6	71593	71598	0 %	0 %	50 %	50 %	187730031
100	NC_010658	GC	3	6	71696	71701	0 %	0 %	50 %	50 %	187730031
101	NC_010658	AT	3	6	71753	71758	50 %	50 %	0 %	0 %	187730031
102	NC_010658	GC	3	6	72644	72649	0 %	0 %	50 %	50 %	187730608
103	NC_010658	AT	3	6	75038	75043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010658	TC	3	6	76200	76205	0 %	50 %	0 %	50 %	187734241
105	NC_010658	TG	3	6	76358	76363	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010658	CT	3	6	76366	76371	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_010658	GT	3	6	76716	76721	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010658	GC	4	8	76782	76789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_010658	GC	3	6	77669	77674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_010658	TC	3	6	78151	78156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_010658	GA	3	6	78312	78317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010658	GC	3	6	78561	78566	0 %	0 %	50 %	50 %	187733886
113	NC_010658	CG	3	6	78792	78797	0 %	0 %	50 %	50 %	187733886
114	NC_010658	GC	3	6	79553	79558	0 %	0 %	50 %	50 %	187733718
115	NC_010658	CG	3	6	79622	79627	0 %	0 %	50 %	50 %	187733718
116	NC_010658	CA	3	6	80275	80280	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_010658	CG	3	6	80441	80446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_010658	AG	3	6	81986	81991	50 %	0 %	50 %	0 %	187731396
119	NC_010658	AG	3	6	83611	83616	50 %	0 %	50 %	0 %	187732555
120	NC_010658	GA	3	6	84202	84207	50 %	0 %	50 %	0 %	187732212
121	NC_010658	AT	3	6	84284	84289	50 %	50 %	0 %	0 %	187732212
122	NC_010658	CG	3	6	85133	85138	0 %	0 %	50 %	50 %	187732212
123	NC_010658	GT	3	6	85277	85282	0 %	50 %	50 %	0 %	187732212
124	NC_010658	GC	3	6	85916	85921	0 %	0 %	50 %	50 %	187733976
125	NC_010658	CG	3	6	87977	87982	0 %	0 %	50 %	50 %	187733257
126	NC_010658	CG	3	6	88912	88917	0 %	0 %	50 %	50 %	187732828
127	NC_010658	GC	3	6	89124	89129	0 %	0 %	50 %	50 %	187732828
128	NC_010658	TC	3	6	89381	89386	0 %	50 %	0 %	50 %	187732373
129	NC_010658	CG	3	6	90344	90349	0 %	0 %	50 %	50 %	187732373
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131	NC_010658	CG	3	6	92830	92835	0 %	0 %	50 %	50 %	187730669
132	NC_010658	CG	3	6	92893	92898	0 %	0 %	50 %	50 %	187730669
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134	NC_010658	CG	3	6	94705	94710	0 %	0 %	50 %	50 %	187730078
135	NC_010658	GC	3	6	96026	96031	0 %	0 %	50 %	50 %	187731877
136	NC_010658	GA	3	6	96264	96269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010658	CT	3	6	96747	96752	0 %	50 %	0 %	50 %	187733013
138	NC_010658	GC	4	8	97040	97047	0 %	0 %	50 %	50 %	187733013
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145	NC_010658	GC	3	6	103339	103344	0 %	0 %	50 %	50 %	187730150
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