MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 5074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010658	CT	3	6	444	449	0 %	50 %	0 %	50 %	187733611
2	NC_010658	GC	3	6	1332	1337	0 %	0 %	50 %	50 %	187733611
3	NC_010658	TG	3	6	1434	1439	0 %	50 %	50 %	0 %	187733611
4	NC_010658	CG	4	8	2525	2532	0 %	0 %	50 %	50 %	187733611
5	NC_010658	TG	3	6	3605	3610	0 %	50 %	50 %	0 %	187733021
6	NC_010658	GC	3	6	3960	3965	0 %	0 %	50 %	50 %	187732437
7	NC_010658	GC	3	6	4441	4446	0 %	0 %	50 %	50 %	187732437
8	NC_010658	AG	3	6	4881	4886	50 %	0 %	50 %	0 %	187732437
9	NC_010658	CG	3	6	7553	7558	0 %	0 %	50 %	50 %	187730478
10	NC_010658	CG	3	6	7745	7750	0 %	0 %	50 %	50 %	187730478
11	NC_010658	TC	3	6	8345	8350	0 %	50 %	0 %	50 %	187730143
12	NC_010658	CG	3	6	8432	8437	0 %	0 %	50 %	50 %	187730143
13	NC_010658	TG	3	6	9477	9482	0 %	50 %	50 %	0 %	187733564
14	NC_010658	CT	3	6	11747	11752	0 %	50 %	0 %	50 %	187732886
15	NC_010658	TC	4	8	12022	12029	0 %	50 %	0 %	50 %	187732886
16	NC_010658	AG	3	6	13725	13730	50 %	0 %	50 %	0 %	187733929
17	NC_010658	CG	3	6	15671	15676	0 %	0 %	50 %	50 %	187731544
18	NC_010658	CG	3	6	16614	16619	0 %	0 %	50 %	50 %	187730634
19	NC_010658	CT	3	6	18797	18802	0 %	50 %	0 %	50 %	187732952
20	NC_010658	TG	3	6	18847	18852	0 %	50 %	50 %	0 %	187732952
21	NC_010658	TC	3	6	21649	21654	0 %	50 %	0 %	50 %	187732477
22	NC_010658	GT	3	6	21676	21681	0 %	50 %	50 %	0 %	187732477
23	NC_010658	AT	3	6	21847	21852	50 %	50 %	0 %	0 %	187732477
24	NC_010658	AT	3	6	22090	22095	50 %	50 %	0 %	0 %	187732477
25	NC_010658	GT	3	6	22139	22144	0 %	50 %	50 %	0 %	187732477
26	NC_010658	GC	3	6	24627	24632	0 %	0 %	50 %	50 %	187731624
27	NC_010658	GT	3	6	25037	25042	0 %	50 %	50 %	0 %	187730272
28	NC_010658	CG	3	6	25083	25088	0 %	0 %	50 %	50 %	187730272
29	NC_010658	CG	3	6	26469	26474	0 %	0 %	50 %	50 %	187730740
30	NC_010658	GC	3	6	27142	27147	0 %	0 %	50 %	50 %	187730740
31	NC_010658	CG	3	6	27216	27221	0 %	0 %	50 %	50 %	187730740
32	NC_010658	CG	3	6	27944	27949	0 %	0 %	50 %	50 %	187730740
33	NC_010658	GC	3	6	29106	29111	0 %	0 %	50 %	50 %	187733568
34	NC_010658	AT	3	6	29897	29902	50 %	50 %	0 %	0 %	187731568
35	NC_010658	TG	3	6	30247	30252	0 %	50 %	50 %	0 %	187731568
36	NC_010658	CG	3	6	30521	30526	0 %	0 %	50 %	50 %	187731568
37	NC_010658	CT	3	6	33466	33471	0 %	50 %	0 %	50 %	187733195
38	NC_010658	CG	3	6	33616	33621	0 %	0 %	50 %	50 %	187733195
39	NC_010658	GC	3	6	34429	34434	0 %	0 %	50 %	50 %	187733854
40	NC_010658	GC	3	6	34633	34638	0 %	0 %	50 %	50 %	187733854
41	NC_010658	CG	3	6	34769	34774	0 %	0 %	50 %	50 %	187733854
42	NC_010658	CA	3	6	34786	34791	50 %	0 %	0 %	50 %	187733854
43	NC_010658	TC	3	6	34931	34936	0 %	50 %	0 %	50 %	187733854
44	NC_010658	GC	5	10	36291	36300	0 %	0 %	50 %	50 %	187733854
45	NC_010658	CG	3	6	37401	37406	0 %	0 %	50 %	50 %	187733854
46	NC_010658	CT	3	6	39885	39890	0 %	50 %	0 %	50 %	187731431
47	NC_010658	CT	3	6	40854	40859	0 %	50 %	0 %	50 %	187732301
48	NC_010658	CG	3	6	42011	42016	0 %	0 %	50 %	50 %	187732301
49	NC_010658	TA	3	6	43042	43047	50 %	50 %	0 %	0 %	187731973
50	NC_010658	CG	4	8	43352	43359	0 %	0 %	50 %	50 %	187731973
51	NC_010658	CG	4	8	43640	43647	0 %	0 %	50 %	50 %	187731973
52	NC_010658	AC	3	6	44124	44129	50 %	0 %	0 %	50 %	187731366
53	NC_010658	AC	3	6	44344	44349	50 %	0 %	0 %	50 %	187732780
54	NC_010658	GA	3	6	46256	46261	50 %	0 %	50 %	0 %	187733861
55	NC_010658	GC	4	8	46642	46649	0 %	0 %	50 %	50 %	187733861
56	NC_010658	AT	3	6	47660	47665	50 %	50 %	0 %	0 %	187733413
57	NC_010658	GC	4	8	48114	48121	0 %	0 %	50 %	50 %	187733413
58	NC_010658	AT	3	6	49901	49906	50 %	50 %	0 %	0 %	187730491
59	NC_010658	CG	3	6	52944	52949	0 %	0 %	50 %	50 %	187731450
60	NC_010658	AG	3	6	53824	53829	50 %	0 %	50 %	0 %	187731450
61	NC_010658	CG	3	6	53898	53903	0 %	0 %	50 %	50 %	187731450
62	NC_010658	CG	4	8	54017	54024	0 %	0 %	50 %	50 %	187731450
63	NC_010658	GC	3	6	58057	58062	0 %	0 %	50 %	50 %	187734070
64	NC_010658	TG	3	6	58671	58676	0 %	50 %	50 %	0 %	187734070
65	NC_010658	CG	3	6	58986	58991	0 %	0 %	50 %	50 %	187734070
66	NC_010658	CG	3	6	59725	59730	0 %	0 %	50 %	50 %	187733621
67	NC_010658	GC	3	6	60880	60885	0 %	0 %	50 %	50 %	187733621
68	NC_010658	GA	3	6	61680	61685	50 %	0 %	50 %	0 %	187733147
69	NC_010658	CG	3	6	61749	61754	0 %	0 %	50 %	50 %	187733147
70	NC_010658	CG	3	6	63052	63057	0 %	0 %	50 %	50 %	187732393
71	NC_010658	GC	3	6	64216	64221	0 %	0 %	50 %	50 %	187732002
72	NC_010658	AC	3	6	64827	64832	50 %	0 %	0 %	50 %	187732002
73	NC_010658	AG	3	6	65376	65381	50 %	0 %	50 %	0 %	187732002
74	NC_010658	GA	3	6	65389	65394	50 %	0 %	50 %	0 %	187732002
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82	NC_010658	CG	3	6	70882	70887	0 %	0 %	50 %	50 %	187730031
83	NC_010658	GC	3	6	71593	71598	0 %	0 %	50 %	50 %	187730031
84	NC_010658	GC	3	6	71696	71701	0 %	0 %	50 %	50 %	187730031
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86	NC_010658	GC	3	6	72644	72649	0 %	0 %	50 %	50 %	187730608
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90	NC_010658	GC	3	6	79553	79558	0 %	0 %	50 %	50 %	187733718
91	NC_010658	CG	3	6	79622	79627	0 %	0 %	50 %	50 %	187733718
92	NC_010658	AG	3	6	81986	81991	50 %	0 %	50 %	0 %	187731396
93	NC_010658	AG	3	6	83611	83616	50 %	0 %	50 %	0 %	187732555
94	NC_010658	GA	3	6	84202	84207	50 %	0 %	50 %	0 %	187732212
95	NC_010658	AT	3	6	84284	84289	50 %	50 %	0 %	0 %	187732212
96	NC_010658	CG	3	6	85133	85138	0 %	0 %	50 %	50 %	187732212
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101	NC_010658	GC	3	6	89124	89129	0 %	0 %	50 %	50 %	187732828
102	NC_010658	TC	3	6	89381	89386	0 %	50 %	0 %	50 %	187732373
103	NC_010658	CG	3	6	90344	90349	0 %	0 %	50 %	50 %	187732373
104	NC_010658	TG	3	6	92419	92424	0 %	50 %	50 %	0 %	187730669
105	NC_010658	CG	3	6	92830	92835	0 %	0 %	50 %	50 %	187730669
106	NC_010658	CG	3	6	92893	92898	0 %	0 %	50 %	50 %	187730669
107	NC_010658	TC	3	6	93849	93854	0 %	50 %	0 %	50 %	187730657
108	NC_010658	CG	3	6	94705	94710	0 %	0 %	50 %	50 %	187730078
109	NC_010658	GC	3	6	96026	96031	0 %	0 %	50 %	50 %	187731877
110	NC_010658	CT	3	6	96747	96752	0 %	50 %	0 %	50 %	187733013
111	NC_010658	GC	4	8	97040	97047	0 %	0 %	50 %	50 %	187733013
112	NC_010658	TG	3	6	98271	98276	0 %	50 %	50 %	0 %	187733661
113	NC_010658	CT	3	6	98488	98493	0 %	50 %	0 %	50 %	187734219
114	NC_010658	AC	3	6	98876	98881	50 %	0 %	0 %	50 %	187732984
115	NC_010658	GC	3	6	99041	99046	0 %	0 %	50 %	50 %	187732984
116	NC_010658	GC	3	6	100189	100194	0 %	0 %	50 %	50 %	187731238
117	NC_010658	AC	3	6	100261	100266	50 %	0 %	0 %	50 %	187731238
118	NC_010658	GC	3	6	103339	103344	0 %	0 %	50 %	50 %	187730150
119	NC_010658	TA	3	6	104068	104073	50 %	50 %	0 %	0 %	187730773
120	NC_010658	TG	3	6	104794	104799	0 %	50 %	50 %	0 %	187734255
121	NC_010658	AG	3	6	105050	105055	50 %	0 %	50 %	0 %	187734255
122	NC_010658	CG	3	6	105215	105220	0 %	0 %	50 %	50 %	187734255
123	NC_010658	CT	3	6	105728	105733	0 %	50 %	0 %	50 %	187732598
124	NC_010658	CT	3	6	106505	106510	0 %	50 %	0 %	50 %	187732598
125	NC_010658	GC	4	8	110387	110394	0 %	0 %	50 %	50 %	187730596
126	NC_010658	TC	3	6	110654	110659	0 %	50 %	0 %	50 %	187730596
127	NC_010658	TC	3	6	111021	111026	0 %	50 %	0 %	50 %	187732020
128	NC_010658	TC	3	6	111631	111636	0 %	50 %	0 %	50 %	187732020
129	NC_010658	GC	3	6	114366	114371	0 %	0 %	50 %	50 %	187733404
130	NC_010658	AG	3	6	114431	114436	50 %	0 %	50 %	0 %	187733404
131	NC_010658	TG	3	6	114999	115004	0 %	50 %	50 %	0 %	187733027
132	NC_010658	CT	3	6	115165	115170	0 %	50 %	0 %	50 %	187733027
133	NC_010658	GC	3	6	116090	116095	0 %	0 %	50 %	50 %	187733027
134	NC_010658	CG	3	6	116993	116998	0 %	0 %	50 %	50 %	187733027
135	NC_010658	TC	4	8	119112	119119	0 %	50 %	0 %	50 %	187730023
136	NC_010658	CA	3	6	120499	120504	50 %	0 %	0 %	50 %	187733045
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138	NC_010658	CT	3	6	121155	121160	0 %	50 %	0 %	50 %	187731189
139	NC_010658	CT	3	6	121408	121413	0 %	50 %	0 %	50 %	187731189
140	NC_010658	TC	3	6	121444	121449	0 %	50 %	0 %	50 %	187731189
141	NC_010658	TA	4	8	122800	122807	50 %	50 %	0 %	0 %	187731189
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