MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 plasmid pBS512_33

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010657	TA	3	6	142	147	50 %	50 %	0 %	0 %	187729984
2	NC_010657	TA	3	6	360	365	50 %	50 %	0 %	0 %	187729984
3	NC_010657	TA	3	6	415	420	50 %	50 %	0 %	0 %	187729984
4	NC_010657	TG	3	6	582	587	0 %	50 %	50 %	0 %	187729984
5	NC_010657	CT	3	6	4952	4957	0 %	50 %	0 %	50 %	187730006
6	NC_010657	TC	3	6	5047	5052	0 %	50 %	0 %	50 %	187730006
7	NC_010657	TG	3	6	5395	5400	0 %	50 %	50 %	0 %	187730006
8	NC_010657	GA	3	6	6440	6445	50 %	0 %	50 %	0 %	187729976
9	NC_010657	GT	3	6	6876	6881	0 %	50 %	50 %	0 %	187729993
10	NC_010657	TA	3	6	7086	7091	50 %	50 %	0 %	0 %	187729989
11	NC_010657	CA	3	6	7842	7847	50 %	0 %	0 %	50 %	187730010
12	NC_010657	CG	3	6	9132	9137	0 %	0 %	50 %	50 %	187729990
13	NC_010657	TA	3	6	9149	9154	50 %	50 %	0 %	0 %	187729990
14	NC_010657	AT	3	6	9446	9451	50 %	50 %	0 %	0 %	187729990
15	NC_010657	GC	3	6	11362	11367	0 %	0 %	50 %	50 %	187730002
16	NC_010657	TG	3	6	15682	15687	0 %	50 %	50 %	0 %	187729992
17	NC_010657	GT	3	6	16688	16693	0 %	50 %	50 %	0 %	187730003
18	NC_010657	AG	3	6	17763	17768	50 %	0 %	50 %	0 %	187730003
19	NC_010657	AG	3	6	17883	17888	50 %	0 %	50 %	0 %	187730003
20	NC_010657	AT	3	6	18834	18839	50 %	50 %	0 %	0 %	187729982
21	NC_010657	TG	3	6	18880	18885	0 %	50 %	50 %	0 %	187730009
22	NC_010657	CA	3	6	19387	19392	50 %	0 %	0 %	50 %	187730009
23	NC_010657	GT	3	6	20056	20061	0 %	50 %	50 %	0 %	187729971
24	NC_010657	AT	3	6	20169	20174	50 %	50 %	0 %	0 %	187729971
25	NC_010657	AT	3	6	21059	21064	50 %	50 %	0 %	0 %	187729971
26	NC_010657	GT	3	6	21561	21566	0 %	50 %	50 %	0 %	187729971
27	NC_010657	AG	3	6	21857	21862	50 %	0 %	50 %	0 %	187729971
28	NC_010657	CA	3	6	23243	23248	50 %	0 %	0 %	50 %	187729999
29	NC_010657	AT	3	6	23314	23319	50 %	50 %	0 %	0 %	187729987
30	NC_010657	TG	3	6	24812	24817	0 %	50 %	50 %	0 %	187730011
31	NC_010657	TA	3	6	25276	25281	50 %	50 %	0 %	0 %	187730008
32	NC_010657	GA	3	6	27931	27936	50 %	0 %	50 %	0 %	187729994
33	NC_010657	TG	3	6	31976	31981	0 %	50 %	50 %	0 %	187729985
34	NC_010657	GT	3	6	32225	32230	0 %	50 %	50 %	0 %	187729985
35	NC_010657	TA	3	6	32528	32533	50 %	50 %	0 %	0 %	187729975

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.