MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835 chromosome

Total Repeats: 2054

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_010655	AGCAC	2	10	2605480	2605489	40 %	0 %	20 %	40 %	187736615
2002	NC_010655	GGAAC	2	10	2607284	2607293	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2003	NC_010655	GCCAG	2	10	2607295	2607304	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2004	NC_010655	GGCAT	2	10	2608194	2608203	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2005	NC_010655	GTACA	2	10	2610721	2610730	40 %	20 %	20 %	20 %	187736620
2006	NC_010655	CCGGC	2	10	2612420	2612429	0 %	0 %	40 %	60 %	187736621
2007	NC_010655	GCCAT	2	10	2615226	2615235	20 %	20 %	20 %	40 %	187736625
2008	NC_010655	CGCCA	2	10	2615489	2615498	20 %	0 %	20 %	60 %	187736625
2009	NC_010655	CAAAT	2	10	2615840	2615849	60 %	20 %	0 %	20 %	187736625
2010	NC_010655	CCGGT	2	10	2616284	2616293	0 %	20 %	40 %	40 %	187736625
2011	NC_010655	TCCTT	2	10	2617142	2617151	0 %	60 %	0 %	40 %	187736626
2012	NC_010655	CACGG	2	10	2617587	2617596	20 %	0 %	40 %	40 %	187736626
2013	NC_010655	AACGC	2	10	2618458	2618467	40 %	0 %	20 %	40 %	187736627
2014	NC_010655	AGGGG	2	10	2620980	2620989	20 %	0 %	80 %	0 %	187736629
2015	NC_010655	GAACG	2	10	2622653	2622662	40 %	0 %	40 %	20 %	187736629
2016	NC_010655	GCAGC	2	10	2623539	2623548	20 %	0 %	40 %	40 %	187736629
2017	NC_010655	GGAAC	2	10	2625136	2625145	40 %	0 %	40 %	20 %	187736629
2018	NC_010655	TCCGC	2	10	2629008	2629017	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2019	NC_010655	TCCCG	2	10	2629986	2629995	0 %	20 %	20 %	60 %	187736633
2020	NC_010655	GCCCC	2	10	2631866	2631875	0 %	0 %	20 %	80 %	187736637
2021	NC_010655	GACGG	2	10	2632309	2632318	20 %	0 %	60 %	20 %	187736637
2022	NC_010655	TCCGG	2	10	2633331	2633340	0 %	20 %	40 %	40 %	187736639
2023	NC_010655	CCTGG	2	10	2634816	2634825	0 %	20 %	40 %	40 %	187736639
2024	NC_010655	TCCTG	2	10	2636553	2636562	0 %	40 %	20 %	40 %	187736640
2025	NC_010655	GTCCG	2	10	2636619	2636628	0 %	20 %	40 %	40 %	187736640
2026	NC_010655	CGTCA	2	10	2638325	2638334	20 %	20 %	20 %	40 %	187736640
2027	NC_010655	TGGGA	2	10	2638648	2638657	20 %	20 %	60 %	0 %	187736640
2028	NC_010655	CTCCA	2	10	2639289	2639298	20 %	20 %	0 %	60 %	187736640
2029	NC_010655	AACGG	2	10	2639784	2639793	40 %	0 %	40 %	20 %	187736640
2030	NC_010655	ACTTC	2	10	2643170	2643179	20 %	40 %	0 %	40 %	187736643
2031	NC_010655	GCTCC	2	10	2643808	2643817	0 %	20 %	20 %	60 %	187736643
2032	NC_010655	CCGTG	2	10	2644055	2644064	0 %	20 %	40 %	40 %	187736643
2033	NC_010655	CCCAG	2	10	2644481	2644490	20 %	0 %	20 %	60 %	187736643
2034	NC_010655	CTGCC	2	10	2645466	2645475	0 %	20 %	20 %	60 %	187736644
2035	NC_010655	GGCCG	2	10	2645596	2645605	0 %	0 %	60 %	40 %	187736644
2036	NC_010655	CAGGC	2	10	2645826	2645835	20 %	0 %	40 %	40 %	187736644
2037	NC_010655	TGCCC	2	10	2646100	2646109	0 %	20 %	20 %	60 %	187736644
2038	NC_010655	ATGGA	2	10	2646303	2646312	40 %	20 %	40 %	0 %	187736644
2039	NC_010655	TTTTC	2	10	2648751	2648760	0 %	80 %	0 %	20 %	187736646
2040	NC_010655	CGGCG	2	10	2649016	2649025	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2041	NC_010655	CGCCA	2	10	2650543	2650552	20 %	0 %	20 %	60 %	187736648
2042	NC_010655	CAGGG	2	10	2650773	2650782	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2043	NC_010655	GCCCC	2	10	2650786	2650795	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
2044	NC_010655	TTTAT	2	10	2650915	2650924	20 %	80 %	0 %	0 %	187736649
2045	NC_010655	TGCCC	2	10	2654297	2654306	0 %	20 %	20 %	60 %	187736652
2046	NC_010655	AGCCC	2	10	2655098	2655107	20 %	0 %	20 %	60 %	187736652
2047	NC_010655	TGTTC	2	10	2656007	2656016	0 %	60 %	20 %	20 %	187736652
2048	NC_010655	TTGAA	2	10	2657920	2657929	40 %	40 %	20 %	0 %	187736652
2049	NC_010655	TTCCG	2	10	2658708	2658717	0 %	40 %	20 %	40 %	187736652
2050	NC_010655	GGGAA	2	10	2659942	2659951	40 %	0 %	60 %	0 %	187736653
2051	NC_010655	CGGCG	2	10	2661608	2661617	0 %	0 %	60 %	40 %	187736653
2052	NC_010655	TCCGT	2	10	2662848	2662857	0 %	40 %	20 %	40 %	187736654
2053	NC_010655	AAAAG	2	10	2663732	2663741	80 %	0 %	20 %	0 %	187736654
2054	NC_010655	GGAAT	2	10	2663753	2663762	40 %	20 %	40 %	0 %	187736654

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.