MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bordetella avium 197N chromosome

Total Repeats: 10458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010645	GCTG	2	8	66	73	0 %	25 %	50 %	25 %	187476515
2	NC_010645	GTCG	2	8	369	376	0 %	25 %	50 %	25 %	187476515
3	NC_010645	CCCG	2	8	531	538	0 %	0 %	25 %	75 %	187476515
4	NC_010645	GCAG	2	8	2141	2148	25 %	0 %	50 %	25 %	187476516
5	NC_010645	TGGC	2	8	2281	2288	0 %	25 %	50 %	25 %	187476516
6	NC_010645	GGCC	2	8	2405	2412	0 %	0 %	50 %	50 %	187476516
7	NC_010645	GCCG	2	8	2483	2490	0 %	0 %	50 %	50 %	187476516
8	NC_010645	CCAA	2	8	2628	2635	50 %	0 %	0 %	50 %	187476517
9	NC_010645	GATC	2	8	2890	2897	25 %	25 %	25 %	25 %	187476517
10	NC_010645	GTCT	2	8	3075	3082	0 %	50 %	25 %	25 %	187476517
11	NC_010645	AGGG	2	8	3379	3386	25 %	0 %	75 %	0 %	187476517
12	NC_010645	TCCG	2	8	3649	3656	0 %	25 %	25 %	50 %	187476518
13	NC_010645	GGAC	2	8	4629	4636	25 %	0 %	50 %	25 %	187476519
14	NC_010645	ATGA	2	8	4814	4821	50 %	25 %	25 %	0 %	187476519
15	NC_010645	CATT	2	8	4825	4832	25 %	50 %	0 %	25 %	187476519
16	NC_010645	GGGT	2	8	4904	4911	0 %	25 %	75 %	0 %	187476519
17	NC_010645	TGAT	2	8	5055	5062	25 %	50 %	25 %	0 %	187476519
18	NC_010645	CACG	2	8	5184	5191	25 %	0 %	25 %	50 %	187476519
19	NC_010645	TCAG	2	8	5813	5820	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_010645	GCTG	2	8	6427	6434	0 %	25 %	50 %	25 %	187476520
21	NC_010645	GTTC	2	8	6480	6487	0 %	50 %	25 %	25 %	187476520
22	NC_010645	CGAT	2	8	6876	6883	25 %	25 %	25 %	25 %	187476520
23	NC_010645	AAGG	2	8	8115	8122	50 %	0 %	50 %	0 %	187476522
24	NC_010645	GGCG	2	8	8278	8285	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25	NC_010645	CCCG	2	8	8527	8534	0 %	0 %	25 %	75 %	187476523
26	NC_010645	CTGC	2	8	8935	8942	0 %	25 %	25 %	50 %	187476524
27	NC_010645	GAAG	2	8	10548	10555	50 %	0 %	50 %	0 %	187476526
28	NC_010645	CCTA	2	8	10932	10939	25 %	25 %	0 %	50 %	187476527
29	NC_010645	GTCA	2	8	11021	11028	25 %	25 %	25 %	25 %	187476527
30	NC_010645	ACCG	2	8	11609	11616	25 %	0 %	25 %	50 %	187476527
31	NC_010645	CCTT	2	8	12855	12862	0 %	50 %	0 %	50 %	187476527
32	NC_010645	GCTG	2	8	13195	13202	0 %	25 %	50 %	25 %	187476527
33	NC_010645	TCGC	2	8	13365	13372	0 %	25 %	25 %	50 %	187476527
34	NC_010645	GGCC	2	8	14086	14093	0 %	0 %	50 %	50 %	187476527
35	NC_010645	CTCG	2	8	14668	14675	0 %	25 %	25 %	50 %	187476527
36	NC_010645	CCGG	2	8	14811	14818	0 %	0 %	50 %	50 %	187476527
37	NC_010645	TCGC	2	8	14905	14912	0 %	25 %	25 %	50 %	187476527
38	NC_010645	AGAA	2	8	16736	16743	75 %	0 %	25 %	0 %	187476528
39	NC_010645	AGGC	2	8	17006	17013	25 %	0 %	50 %	25 %	187476528
40	NC_010645	CGGC	2	8	17519	17526	0 %	0 %	50 %	50 %	187476528
41	NC_010645	GATC	2	8	17556	17563	25 %	25 %	25 %	25 %	187476528
42	NC_010645	CCCG	2	8	18017	18024	0 %	0 %	25 %	75 %	187476528
43	NC_010645	TTCC	2	8	18240	18247	0 %	50 %	0 %	50 %	187476528
44	NC_010645	CCGG	2	8	19012	19019	0 %	0 %	50 %	50 %	187476528
45	NC_010645	GTCA	2	8	20266	20273	25 %	25 %	25 %	25 %	187476529
46	NC_010645	CCGA	2	8	20425	20432	25 %	0 %	25 %	50 %	187476529
47	NC_010645	TTGC	2	8	20709	20716	0 %	50 %	25 %	25 %	187476529
48	NC_010645	TCTG	2	8	21691	21698	0 %	50 %	25 %	25 %	187476530
49	NC_010645	GAAA	2	8	22082	22089	75 %	0 %	25 %	0 %	187476530
50	NC_010645	CGGG	2	8	22269	22276	0 %	0 %	75 %	25 %	187476530
51	NC_010645	CTGG	2	8	23912	23919	0 %	25 %	50 %	25 %	187476531
52	NC_010645	CAGC	2	8	24756	24763	25 %	0 %	25 %	50 %	187476532
53	NC_010645	CAGC	2	8	25592	25599	25 %	0 %	25 %	50 %	187476533
54	NC_010645	AACG	2	8	26044	26051	50 %	0 %	25 %	25 %	187476533
55	NC_010645	CGTG	2	8	26058	26065	0 %	25 %	50 %	25 %	187476533
56	NC_010645	GCTT	2	8	26292	26299	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_010645	CTAA	2	8	26337	26344	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_010645	AAGC	2	8	27033	27040	50 %	0 %	25 %	25 %	187476534
59	NC_010645	CTGG	2	8	27606	27613	0 %	25 %	50 %	25 %	187476535
60	NC_010645	TGGA	2	8	27891	27898	25 %	25 %	50 %	0 %	187476536
61	NC_010645	GTGG	2	8	28083	28090	0 %	25 %	75 %	0 %	187476536
62	NC_010645	TGAT	2	8	28282	28289	25 %	50 %	25 %	0 %	187476536
63	NC_010645	AGCC	2	8	28322	28329	25 %	0 %	25 %	50 %	187476536
64	NC_010645	ATCC	2	8	28518	28525	25 %	25 %	0 %	50 %	187476536
65	NC_010645	CGAT	2	8	28603	28610	25 %	25 %	25 %	25 %	187476536
66	NC_010645	AAGA	2	8	28797	28804	75 %	0 %	25 %	0 %	187476536
67	NC_010645	CTGG	2	8	29418	29425	0 %	25 %	50 %	25 %	187476536
68	NC_010645	CGAA	2	8	29485	29492	50 %	0 %	25 %	25 %	187476536
69	NC_010645	AAGG	2	8	29526	29533	50 %	0 %	50 %	0 %	187476536
70	NC_010645	GCTG	2	8	30495	30502	0 %	25 %	50 %	25 %	187476537
71	NC_010645	GTTC	2	8	30548	30555	0 %	50 %	25 %	25 %	187476537
72	NC_010645	CGAT	2	8	30944	30951	25 %	25 %	25 %	25 %	187476537
73	NC_010645	GCCG	2	8	31446	31453	0 %	0 %	50 %	50 %	187476538
74	NC_010645	TCAC	2	8	31702	31709	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_010645	CGCC	2	8	31981	31988	0 %	0 %	25 %	75 %	187476539
76	NC_010645	GGCT	2	8	32273	32280	0 %	25 %	50 %	25 %	187476539
77	NC_010645	TGGC	2	8	32485	32492	0 %	25 %	50 %	25 %	187476539
78	NC_010645	GTAA	2	8	32648	32655	50 %	25 %	25 %	0 %	187476539
79	NC_010645	CGTT	2	8	33328	33335	0 %	50 %	25 %	25 %	187476541
80	NC_010645	CGGC	2	8	34036	34043	0 %	0 %	50 %	50 %	187476542
81	NC_010645	CGAT	2	8	34246	34253	25 %	25 %	25 %	25 %	187476542
82	NC_010645	GGTC	2	8	34604	34611	0 %	25 %	50 %	25 %	187476543
83	NC_010645	CGTT	2	8	36210	36217	0 %	50 %	25 %	25 %	187476546
84	NC_010645	CCAG	2	8	36368	36375	25 %	0 %	25 %	50 %	187476547
85	NC_010645	GTGG	2	8	36984	36991	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010645	GGCA	2	8	37064	37071	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_010645	TGAT	2	8	37372	37379	25 %	50 %	25 %	0 %	187476549
88	NC_010645	ATCA	2	8	37618	37625	50 %	25 %	0 %	25 %	187476549
89	NC_010645	CGAT	2	8	37817	37824	25 %	25 %	25 %	25 %	187476549
90	NC_010645	GGGC	2	8	38420	38427	0 %	0 %	75 %	25 %	187476550
91	NC_010645	CAAA	2	8	39639	39646	75 %	0 %	0 %	25 %	187476551
92	NC_010645	CAAG	2	8	40709	40716	50 %	0 %	25 %	25 %	187476553
93	NC_010645	TATG	2	8	41138	41145	25 %	50 %	25 %	0 %	187476553
94	NC_010645	TGCG	2	8	41479	41486	0 %	25 %	50 %	25 %	187476553
95	NC_010645	ATTT	2	8	41520	41527	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010645	CGAT	2	8	41836	41843	25 %	25 %	25 %	25 %	187476554
97	NC_010645	GTGC	2	8	42183	42190	0 %	25 %	50 %	25 %	187476554
98	NC_010645	ACGA	2	8	42878	42885	50 %	0 %	25 %	25 %	187476555
99	NC_010645	GCAA	2	8	42924	42931	50 %	0 %	25 %	25 %	187476555
100	NC_010645	GCTT	2	8	43053	43060	0 %	50 %	25 %	25 %	187476555
101	NC_010645	GGCC	2	8	43441	43448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_010645	CAGC	2	8	45221	45228	25 %	0 %	25 %	50 %	187476557
103	NC_010645	TTGT	2	8	45815	45822	0 %	75 %	25 %	0 %	187476557
104	NC_010645	GCTG	2	8	47693	47700	0 %	25 %	50 %	25 %	187476561
105	NC_010645	GACC	2	8	48300	48307	25 %	0 %	25 %	50 %	187476562
106	NC_010645	GCTG	2	8	49105	49112	0 %	25 %	50 %	25 %	187476564
107	NC_010645	CGCC	2	8	49614	49621	0 %	0 %	25 %	75 %	187476565
108	NC_010645	CGGC	2	8	50415	50422	0 %	0 %	50 %	50 %	187476567
109	NC_010645	GCTC	2	8	50451	50458	0 %	25 %	25 %	50 %	187476567
110	NC_010645	CATC	2	8	50735	50742	25 %	25 %	0 %	50 %	187476568
111	NC_010645	AAGA	2	8	50788	50795	75 %	0 %	25 %	0 %	187476568
112	NC_010645	GGCC	2	8	50802	50809	0 %	0 %	50 %	50 %	187476568
113	NC_010645	CGTT	2	8	51515	51522	0 %	50 %	25 %	25 %	187476568
114	NC_010645	GCAT	2	8	51935	51942	25 %	25 %	25 %	25 %	187476569
115	NC_010645	GTCG	2	8	52296	52303	0 %	25 %	50 %	25 %	187476571
116	NC_010645	CGTG	2	8	53452	53459	0 %	25 %	50 %	25 %	187476573
117	NC_010645	TGCC	2	8	53658	53665	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_010645	GCCC	2	8	53699	53706	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
119	NC_010645	CCGA	2	8	53973	53980	25 %	0 %	25 %	50 %	187476574
120	NC_010645	GATC	2	8	54554	54561	25 %	25 %	25 %	25 %	187476574
121	NC_010645	TCAC	2	8	55048	55055	25 %	25 %	0 %	50 %	187476575
122	NC_010645	ACCC	2	8	55133	55140	25 %	0 %	0 %	75 %	187476575
123	NC_010645	GGCC	2	8	55870	55877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_010645	GCCT	2	8	56050	56057	0 %	25 %	25 %	50 %	187476577
125	NC_010645	TGTC	2	8	56058	56065	0 %	50 %	25 %	25 %	187476577
126	NC_010645	GGCA	2	8	56129	56136	25 %	0 %	50 %	25 %	187476577
127	NC_010645	CTGG	2	8	56875	56882	0 %	25 %	50 %	25 %	187476578
128	NC_010645	CGGC	2	8	57095	57102	0 %	0 %	50 %	50 %	187476578
129	NC_010645	CGGG	2	8	57263	57270	0 %	0 %	75 %	25 %	187476578
130	NC_010645	TGGA	2	8	57484	57491	25 %	25 %	50 %	0 %	187476578
131	NC_010645	CCTG	2	8	57555	57562	0 %	25 %	25 %	50 %	187476578
132	NC_010645	CTGC	2	8	57634	57641	0 %	25 %	25 %	50 %	187476578
133	NC_010645	GGCG	2	8	58072	58079	0 %	0 %	75 %	25 %	187476578
134	NC_010645	CTCG	2	8	58134	58141	0 %	25 %	25 %	50 %	187476578
135	NC_010645	CCAG	2	8	58362	58369	25 %	0 %	25 %	50 %	187476579
136	NC_010645	GATC	2	8	58995	59002	25 %	25 %	25 %	25 %	187476579
137	NC_010645	CTGC	2	8	59106	59113	0 %	25 %	25 %	50 %	187476579
138	NC_010645	CGGG	2	8	59221	59228	0 %	0 %	75 %	25 %	187476579
139	NC_010645	CCGG	3	12	59453	59464	0 %	0 %	50 %	50 %	187476580
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