MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Elusimicrobium minutum Pei191 chromosome

Total Repeats: 206

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010644	ACAAA	2	10	45953	45962	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_010644	TTTAT	2	10	70203	70212	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010644	ATATT	2	10	75027	75036	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010644	GTTTT	2	10	84617	84626	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010644	ATTTT	2	10	84708	84717	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010644	TAGCT	2	10	98677	98686	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_010644	TTGTT	2	10	108076	108085	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010644	TAAAA	2	10	122361	122370	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010644	CTGGC	2	10	122777	122786	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_010644	TAAAA	2	10	140950	140959	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010644	AAATT	2	10	143766	143775	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010644	TAAAT	2	10	143898	143907	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010644	ACGCC	2	10	152162	152171	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_010644	TAATA	2	10	159344	159353	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010644	TAAAT	2	10	177709	177718	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010644	GTATC	2	10	181436	181445	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_010644	TTGTT	2	10	195144	195153	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010644	AAAGT	2	10	195171	195180	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010644	TATAA	2	10	212110	212119	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010644	AAAGC	2	10	216954	216963	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_010644	AATTA	2	10	220720	220729	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010644	TAATT	2	10	239185	239194	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010644	ACCCC	2	10	245869	245878	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
24	NC_010644	TTTAA	2	10	257763	257772	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010644	TAATT	2	10	266105	266114	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010644	AATTC	2	10	266873	266882	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_010644	TGAAA	2	10	267324	267333	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010644	ATAAA	2	10	276958	276967	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010644	TTGTT	2	10	289268	289277	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010644	CTTGT	2	10	329067	329076	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_010644	AAAAC	2	10	332096	332105	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_010644	TAATA	2	10	336858	336867	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010644	GAAAA	2	10	337280	337289	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010644	TTAAT	2	10	338959	338968	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010644	AAGCT	2	10	339787	339796	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_010644	TCCTT	2	10	389851	389860	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_010644	AAGTA	2	10	400827	400836	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010644	ATTTT	2	10	401482	401491	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010644	AGTTT	2	10	408994	409003	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010644	TAATA	3	15	426527	426541	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010644	TTTTG	2	10	434070	434079	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010644	ATTAA	2	10	436203	436212	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010644	GTTCT	2	10	452430	452439	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_010644	GACAG	2	10	452496	452505	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_010644	AAACT	2	10	458111	458120	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_010644	GATTA	2	10	461251	461260	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010644	TTATT	2	10	461459	461468	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010644	TATAA	2	10	470539	470548	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010644	TCAAA	2	10	482755	482764	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_010644	AAAAT	2	10	506348	506357	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010644	AAAAC	2	10	506456	506465	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_010644	TTTTA	2	10	511226	511235	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010644	TATAT	2	10	514837	514846	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010644	TTTTA	2	10	514854	514863	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010644	TTATT	2	10	516929	516938	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010644	ATTTT	2	10	518991	519000	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010644	ATTTA	2	10	519023	519032	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010644	ATGTT	2	10	525519	525528	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010644	TAATA	2	10	534091	534100	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010644	AAAAT	2	10	543808	543817	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010644	TTTGC	2	10	563818	563827	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_010644	ATGCT	2	10	564985	564994	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_010644	AAAAC	2	10	565380	565389	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_010644	TAAAA	2	10	577736	577745	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010644	ACTTA	2	10	599128	599137	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_010644	ACAAA	2	10	602155	602164	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_010644	TAATA	2	10	609067	609076	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010644	GTTTT	2	10	620425	620434	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010644	TTTTA	2	10	625282	625291	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010644	TTTAA	2	10	629120	629129	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010644	ATTAA	2	10	642578	642587	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010644	ATTTT	2	10	645893	645902	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010644	TTTAT	2	10	646013	646022	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010644	ACCTT	2	10	660221	660230	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_010644	TTTTA	2	10	662612	662621	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010644	TTTAA	2	10	670334	670343	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010644	TTTTG	2	10	679071	679080	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010644	AAAAC	2	10	698902	698911	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_010644	TATAT	2	10	711485	711494	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010644	AAATT	2	10	714523	714532	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010644	TATAA	2	10	715209	715218	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010644	GTTTT	2	10	722578	722587	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010644	AAACA	2	10	727729	727738	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_010644	TTTAA	2	10	752246	752255	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010644	AATAA	2	10	755925	755934	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010644	ATTTT	2	10	765496	765505	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010644	GGGCG	2	10	770692	770701	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
88	NC_010644	TTAAA	2	10	780318	780327	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010644	AAAAT	2	10	812521	812530	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010644	TAAAA	2	10	821775	821784	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010644	TAAAT	2	10	822127	822136	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010644	TTACT	2	10	829995	830004	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_010644	ACAAA	2	10	835110	835119	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_010644	AAATC	2	10	836213	836222	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_010644	TAAAA	2	10	841006	841015	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010644	TATAA	2	10	842739	842748	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010644	TTTTA	2	10	843495	843504	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010644	TAAAT	2	10	845676	845685	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010644	TTTTA	2	10	847741	847750	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010644	TAAAA	2	10	851068	851077	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010644	CAAGG	2	10	864251	864260	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_010644	TAAAA	2	10	864382	864391	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010644	CAATT	2	10	866238	866247	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_010644	TCTTA	2	10	869379	869388	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_010644	AAGTT	2	10	871193	871202	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010644	TTAAA	2	10	878252	878261	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010644	ATTAA	2	10	894371	894380	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010644	GCAAA	2	10	899121	899130	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_010644	AAATT	2	10	899901	899910	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010644	TTAAA	2	10	905716	905725	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010644	TAAAA	2	10	907080	907089	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010644	TATAA	2	10	908132	908141	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010644	TTAAA	2	10	915715	915724	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010644	ATTAT	2	10	917253	917262	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010644	TTTAT	2	10	917265	917274	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010644	TATTT	2	10	928213	928222	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010644	TTTTG	2	10	939569	939578	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010644	TTATA	2	10	947120	947129	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010644	CAAAA	2	10	950989	950998	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_010644	TATAT	2	10	955338	955347	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010644	ATATA	2	10	997160	997169	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010644	TTAAA	2	10	1003825	1003834	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010644	TAATA	2	10	1009759	1009768	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010644	TACAA	2	10	1011335	1011344	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_010644	AAAAG	2	10	1011530	1011539	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010644	TAAAT	2	10	1013679	1013688	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010644	TATAA	2	10	1024004	1024013	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010644	TTATT	2	10	1027226	1027235	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010644	TATTT	2	10	1031298	1031307	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010644	TAAGT	2	10	1032703	1032712	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010644	AAAAT	2	10	1032875	1032884	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010644	TAAGT	2	10	1034211	1034220	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010644	ACATT	2	10	1034224	1034233	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_010644	GGGAT	2	10	1048722	1048731	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010644	TCCTA	2	10	1051736	1051745	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_010644	CTTTT	2	10	1059525	1059534	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_010644	TGGCG	2	10	1059706	1059715	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
138	NC_010644	TAATA	2	10	1091552	1091561	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010644	ATTTT	2	10	1112884	1112893	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010644	GCTTT	2	10	1120164	1120173	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_010644	TTAAG	2	10	1129506	1129515	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010644	AACAA	2	10	1131786	1131795	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_010644	ACTTC	2	10	1132611	1132620	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_010644	ATATT	2	10	1141937	1141946	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010644	TAAAA	2	10	1144996	1145005	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010644	TATTT	2	10	1149817	1149826	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010644	ATTTT	2	10	1150548	1150557	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_010644	TAAAA	2	10	1431724	1431733	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_010644	ATTTT	2	10	1546438	1546447	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_010644	GTTTA	2	10	1589112	1589121	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_010644	TATTT	2	10	1626691	1626700	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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204	NC_010644	TAAAC	2	10	1638194	1638203	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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206	NC_010644	AAGTA	2	10	1643550	1643559	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.