MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pseudotuberculosis PB1/+ plasmid pYPTS01

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010635	TAACGT	2	12	625	636	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	186897496
2	NC_010635	GTTACT	2	12	918	929	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	186897497
3	NC_010635	TTATGT	2	12	975	986	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	186897497
4	NC_010635	TTTTGC	2	12	6285	6296	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	186897504
5	NC_010635	AATTGA	2	12	9411	9422	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	186897509
6	NC_010635	TGAATG	2	12	11227	11238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186897510
7	NC_010635	AAGATT	2	12	13782	13793	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	186897512
8	NC_010635	TTTCCA	2	12	21941	21952	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	186897524
9	NC_010635	TGGAAA	2	12	23091	23102	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	186897526
10	NC_010635	CAATTG	2	12	24173	24184	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	186897527
11	NC_010635	ATCTAT	2	12	35502	35513	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	186897542
12	NC_010635	GATGTC	2	12	39208	39219	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	186897547
13	NC_010635	TTTCCA	2	12	41230	41241	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	186897551
14	NC_010635	TTAAAC	2	12	53161	53172	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	186897563
15	NC_010635	CAAGAT	2	12	57516	57527	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	186897568
16	NC_010635	TGAGCG	2	12	62732	62743	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	186897575
17	NC_010635	GAAGAT	2	12	62817	62828	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	186897575
18	NC_010635	CAAGAA	2	12	62859	62870	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	186897575
19	NC_010635	TAGAAC	2	12	63981	63992	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	186897576

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.