MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Yersinia pseudotuberculosis PB1/+ chromosome

Total Repeats: 3081

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010634	ACTGG	2	10	141	150	20 %	20 %	40 %	20 %	186893345
2	NC_010634	ATTTT	2	10	2079	2088	20 %	80 %	0 %	0 %	186893346
3	NC_010634	GGTTC	2	10	7813	7822	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_010634	CTGGA	2	10	7969	7978	20 %	20 %	40 %	20 %	186893350
5	NC_010634	ACTAA	2	10	9610	9619	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_010634	CTTGC	2	10	10020	10029	0 %	40 %	20 %	40 %	186893353
7	NC_010634	AAATA	2	10	12194	12203	80 %	20 %	0 %	0 %	186893356
8	NC_010634	CTCTT	2	10	14331	14340	0 %	60 %	0 %	40 %	186893359
9	NC_010634	CCTGA	2	10	15460	15469	20 %	20 %	20 %	40 %	186893361
10	NC_010634	GATTG	2	10	18581	18590	20 %	40 %	40 %	0 %	186893363
11	NC_010634	GCCCC	2	10	18734	18743	0 %	0 %	20 %	80 %	186893363
12	NC_010634	TTGGC	2	10	19872	19881	0 %	40 %	40 %	20 %	186893363
13	NC_010634	GAGAA	2	10	22655	22664	60 %	0 %	40 %	0 %	186893365
14	NC_010634	CGCAA	2	10	22806	22815	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_010634	GTCAG	2	10	23213	23222	20 %	20 %	40 %	20 %	186893366
16	NC_010634	TTGAT	2	10	23528	23537	20 %	60 %	20 %	0 %	186893366
17	NC_010634	GCTGA	2	10	23593	23602	20 %	20 %	40 %	20 %	186893366
18	NC_010634	TTGGG	2	10	23870	23879	0 %	40 %	60 %	0 %	186893366
19	NC_010634	AACGC	2	10	24497	24506	40 %	0 %	20 %	40 %	186893367
20	NC_010634	CCCGA	2	10	24948	24957	20 %	0 %	20 %	60 %	186893367
21	NC_010634	TGTGA	2	10	29891	29900	20 %	40 %	40 %	0 %	186893370
22	NC_010634	TTCCT	2	10	30699	30708	0 %	60 %	0 %	40 %	186893370
23	NC_010634	GTGTG	2	10	33683	33692	0 %	40 %	60 %	0 %	186893374
24	NC_010634	TGAGT	2	10	34134	34143	20 %	40 %	40 %	0 %	186893374
25	NC_010634	CAGCC	2	10	35315	35324	20 %	0 %	20 %	60 %	186893375
26	NC_010634	AGCAC	2	10	36074	36083	40 %	0 %	20 %	40 %	186893375
27	NC_010634	TAAGT	2	10	36308	36317	40 %	40 %	20 %	0 %	186893376
28	NC_010634	GCTGG	2	10	38074	38083	0 %	20 %	60 %	20 %	186893377
29	NC_010634	TTTGG	2	10	38408	38417	0 %	60 %	40 %	0 %	186893377
30	NC_010634	ATCAC	2	10	38543	38552	40 %	20 %	0 %	40 %	186893377
31	NC_010634	TCAAT	2	10	41010	41019	40 %	40 %	0 %	20 %	186893378
32	NC_010634	TCAGA	2	10	44814	44823	40 %	20 %	20 %	20 %	186893382
33	NC_010634	GGCGG	2	10	46114	46123	0 %	0 %	80 %	20 %	186893383
34	NC_010634	GGGTG	2	10	46354	46363	0 %	20 %	80 %	0 %	186893383
35	NC_010634	AAAGA	2	10	49494	49503	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010634	GGAGA	2	10	50469	50478	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010634	TCATC	2	10	54106	54115	20 %	40 %	0 %	40 %	186893392
38	NC_010634	TGATT	2	10	54740	54749	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010634	GCAGC	2	10	56032	56041	20 %	0 %	40 %	40 %	186893395
40	NC_010634	GCGGT	2	10	57918	57927	0 %	20 %	60 %	20 %	186893398
41	NC_010634	CTGCC	2	10	60316	60325	0 %	20 %	20 %	60 %	186893400
42	NC_010634	CGCCA	2	10	60732	60741	20 %	0 %	20 %	60 %	186893400
43	NC_010634	CATCA	2	10	60955	60964	40 %	20 %	0 %	40 %	186893400
44	NC_010634	GCCAG	2	10	61110	61119	20 %	0 %	40 %	40 %	186893401
45	NC_010634	CACCC	2	10	62063	62072	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
46	NC_010634	ATAAG	2	10	62192	62201	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010634	GTTTT	2	10	64912	64921	0 %	80 %	20 %	0 %	186893404
48	NC_010634	CTGTG	2	10	65600	65609	0 %	40 %	40 %	20 %	186893404
49	NC_010634	AACAA	2	10	69910	69919	80 %	0 %	0 %	20 %	186893409
50	NC_010634	AAATA	2	10	71427	71436	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010634	TTGGG	2	10	74048	74057	0 %	40 %	60 %	0 %	186893413
52	NC_010634	CCAAA	2	10	84242	84251	60 %	0 %	0 %	40 %	186893425
53	NC_010634	AATGC	2	10	84917	84926	40 %	20 %	20 %	20 %	186893425
54	NC_010634	AACAA	2	10	85064	85073	80 %	0 %	0 %	20 %	186893425
55	NC_010634	ACGCC	2	10	87056	87065	20 %	0 %	20 %	60 %	186893428
56	NC_010634	ACGCG	2	10	88008	88017	20 %	0 %	40 %	40 %	186893428
57	NC_010634	GCTTT	2	10	89214	89223	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_010634	TCAAA	2	10	89694	89703	60 %	20 %	0 %	20 %	186893430
59	NC_010634	TTGGC	2	10	92419	92428	0 %	40 %	40 %	20 %	186893433
60	NC_010634	TTCAC	2	10	93577	93586	20 %	40 %	0 %	40 %	186893434
61	NC_010634	TAAAG	2	10	96496	96505	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010634	GTTTT	2	10	96755	96764	0 %	80 %	20 %	0 %	186893437
63	NC_010634	GCAAT	2	10	97152	97161	40 %	20 %	20 %	20 %	186893437
64	NC_010634	GCAAG	2	10	97477	97486	40 %	0 %	40 %	20 %	186893437
65	NC_010634	TAAAT	2	10	98702	98711	60 %	40 %	0 %	0 %	186893437
66	NC_010634	TTTAT	2	10	100904	100913	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010634	AATGC	2	10	101491	101500	40 %	20 %	20 %	20 %	186893440
68	NC_010634	GATAA	2	10	101953	101962	60 %	20 %	20 %	0 %	186893441
69	NC_010634	TGTAC	2	10	105072	105081	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_010634	AGGTA	2	10	108076	108085	40 %	20 %	40 %	0 %	186893448
71	NC_010634	TGCTA	2	10	112538	112547	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_010634	TTCTG	2	10	116349	116358	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_010634	TGAGT	2	10	117402	117411	20 %	40 %	40 %	0 %	186893454
74	NC_010634	TCCAC	2	10	118819	118828	20 %	20 %	0 %	60 %	186893457
75	NC_010634	AGTTC	2	10	119642	119651	20 %	40 %	20 %	20 %	186893457
76	NC_010634	ATCAA	2	10	121847	121856	60 %	20 %	0 %	20 %	186893458
77	NC_010634	TGAAC	2	10	122720	122729	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_010634	CTTGG	2	10	124179	124188	0 %	40 %	40 %	20 %	186893461
79	NC_010634	ATGGT	2	10	124550	124559	20 %	40 %	40 %	0 %	186893461
80	NC_010634	TGGTA	2	10	125590	125599	20 %	40 %	40 %	0 %	186893462
81	NC_010634	GCAGT	2	10	130587	130596	20 %	20 %	40 %	20 %	186893465
82	NC_010634	GGCTC	2	10	132760	132769	0 %	20 %	40 %	40 %	186893466
83	NC_010634	TATCT	2	10	136924	136933	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_010634	TGTCA	2	10	137037	137046	20 %	40 %	20 %	20 %	186893470
85	NC_010634	ATCAC	2	10	138328	138337	40 %	20 %	0 %	40 %	186893471
86	NC_010634	CGTTT	2	10	139796	139805	0 %	60 %	20 %	20 %	186893473
87	NC_010634	ATATT	2	10	141021	141030	40 %	60 %	0 %	0 %	186893475
88	NC_010634	CATCT	2	10	144011	144020	20 %	40 %	0 %	40 %	186893476
89	NC_010634	GGCTT	2	10	144790	144799	0 %	40 %	40 %	20 %	186893477
90	NC_010634	AGGCT	2	10	148833	148842	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_010634	GATTG	2	10	150358	150367	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010634	ACAGC	2	10	153732	153741	40 %	0 %	20 %	40 %	186893479
93	NC_010634	TTATT	2	10	154437	154446	20 %	80 %	0 %	0 %	186893480
94	NC_010634	CGGTA	2	10	156150	156159	20 %	20 %	40 %	20 %	186893481
95	NC_010634	CACTT	2	10	156659	156668	20 %	40 %	0 %	40 %	186893482
96	NC_010634	TGTTT	2	10	157261	157270	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010634	GGTCT	2	10	157571	157580	0 %	40 %	40 %	20 %	186893483
98	NC_010634	CGGGG	2	10	158721	158730	0 %	0 %	80 %	20 %	186893484
99	NC_010634	CTGCC	2	10	162775	162784	0 %	20 %	20 %	60 %	186893487
100	NC_010634	TTGGT	2	10	164981	164990	0 %	60 %	40 %	0 %	186893488
101	NC_010634	CCATT	2	10	168643	168652	20 %	40 %	0 %	40 %	186893493
102	NC_010634	TACAG	2	10	169196	169205	40 %	20 %	20 %	20 %	186893493
103	NC_010634	CGCAC	2	10	170510	170519	20 %	0 %	20 %	60 %	186893495
104	NC_010634	ATTGC	2	10	171077	171086	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_010634	CACAA	3	15	171214	171228	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_010634	ATGAA	2	10	172557	172566	60 %	20 %	20 %	0 %	186893496
107	NC_010634	AGCAG	2	10	173581	173590	40 %	0 %	40 %	20 %	186893498
108	NC_010634	CTGGA	2	10	174473	174482	20 %	20 %	40 %	20 %	186893498
109	NC_010634	TGCCT	2	10	179925	179934	0 %	40 %	20 %	40 %	186893509
110	NC_010634	ATTAT	2	10	180457	180466	40 %	60 %	0 %	0 %	186893509
111	NC_010634	ATACC	2	10	180614	180623	40 %	20 %	0 %	40 %	186893510
112	NC_010634	AACAG	2	10	185735	185744	60 %	0 %	20 %	20 %	186893513
113	NC_010634	CTAAA	2	10	186372	186381	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_010634	TATTT	2	10	186703	186712	20 %	80 %	0 %	0 %	186893514
115	NC_010634	ATTTT	2	10	187459	187468	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010634	TGCAG	2	10	187929	187938	20 %	20 %	40 %	20 %	186893515
117	NC_010634	AGCGG	2	10	189126	189135	20 %	0 %	60 %	20 %	186893517
118	NC_010634	GCCCA	2	10	189633	189642	20 %	0 %	20 %	60 %	186893517
119	NC_010634	TCTGA	2	10	194091	194100	20 %	40 %	20 %	20 %	186893521
120	NC_010634	ACGCC	2	10	195468	195477	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
121	NC_010634	GGCTG	2	10	198745	198754	0 %	20 %	60 %	20 %	186893524
122	NC_010634	TGATT	2	10	201635	201644	20 %	60 %	20 %	0 %	186893526
123	NC_010634	CTGGG	2	10	203029	203038	0 %	20 %	60 %	20 %	186893528
124	NC_010634	GATGA	2	10	203735	203744	40 %	20 %	40 %	0 %	186893528
125	NC_010634	ATATT	2	10	205358	205367	40 %	60 %	0 %	0 %	186893530
126	NC_010634	GTTTT	2	10	207342	207351	0 %	80 %	20 %	0 %	186893532
127	NC_010634	CAAGG	2	10	208338	208347	40 %	0 %	40 %	20 %	186893532
128	NC_010634	TCACT	7	35	209416	209450	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_010634	TAGCG	2	10	215681	215690	20 %	20 %	40 %	20 %	186893537
130	NC_010634	GACGA	2	10	216489	216498	40 %	0 %	40 %	20 %	186893538
131	NC_010634	ATTTT	2	10	221736	221745	20 %	80 %	0 %	0 %	186893542
132	NC_010634	TATTT	2	10	222227	222236	20 %	80 %	0 %	0 %	186893542
133	NC_010634	GGCCA	2	10	224567	224576	20 %	0 %	40 %	40 %	186893545
134	NC_010634	GCCGC	2	10	227180	227189	0 %	0 %	40 %	60 %	186893549
135	NC_010634	GGCGC	2	10	227892	227901	0 %	0 %	60 %	40 %	186893549
136	NC_010634	CCGTA	2	10	228242	228251	20 %	20 %	20 %	40 %	186893549
137	NC_010634	GCCAA	2	10	229827	229836	40 %	0 %	20 %	40 %	186893550
138	NC_010634	CCACG	2	10	231136	231145	20 %	0 %	20 %	60 %	186893551
139	NC_010634	TGACC	2	10	231205	231214	20 %	20 %	20 %	40 %	186893551
140	NC_010634	TGTGC	2	10	232418	232427	0 %	40 %	40 %	20 %	186893552
141	NC_010634	CGTTT	2	10	233564	233573	0 %	60 %	20 %	20 %	186893555
142	NC_010634	AAATA	2	10	235114	235123	80 %	20 %	0 %	0 %	186893556
143	NC_010634	TTCTC	2	10	235738	235747	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_010634	TTTAT	2	10	235812	235821	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010634	TGGCT	2	10	239043	239052	0 %	40 %	40 %	20 %	186893560
146	NC_010634	TTTAA	2	10	242420	242429	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010634	GAAGA	2	10	243695	243704	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010634	TTACT	2	10	249660	249669	20 %	60 %	0 %	20 %	186893568
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151	NC_010634	GCCGC	2	10	252745	252754	0 %	0 %	40 %	60 %	186893572
152	NC_010634	GCCAG	2	10	255037	255046	20 %	0 %	40 %	40 %	186893573
153	NC_010634	CTGGT	2	10	260462	260471	0 %	40 %	40 %	20 %	186893580
154	NC_010634	ATTCA	2	10	263017	263026	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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161	NC_010634	CCGCT	2	10	272635	272644	0 %	20 %	20 %	60 %	186893593
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168	NC_010634	AATGG	2	10	275318	275327	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
169	NC_010634	TTTCA	2	10	275640	275649	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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182	NC_010634	TTTAT	2	10	294939	294948	20 %	80 %	0 %	0 %	186893610
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195	NC_010634	GATTG	2	10	319777	319786	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_010634	TTTGC	2	10	326522	326531	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
199	NC_010634	ACATG	2	10	327060	327069	40 %	20 %	20 %	20 %	186893634
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209	NC_010634	GTTTT	2	10	338976	338985	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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263	NC_010634	TCACA	2	10	421855	421864	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
264	NC_010634	TTTAC	2	10	426125	426134	20 %	60 %	0 %	20 %	186893721
265	NC_010634	ATTTT	2	10	426291	426300	20 %	80 %	0 %	0 %	186893721
266	NC_010634	ATCAA	2	10	429781	429790	60 %	20 %	0 %	20 %	186893722
267	NC_010634	AATAT	2	10	430519	430528	60 %	40 %	0 %	0 %	186893722
268	NC_010634	TTGAA	2	10	430760	430769	40 %	40 %	20 %	0 %	186893722
269	NC_010634	CCGGG	2	10	431260	431269	0 %	0 %	60 %	40 %	186893722
270	NC_010634	TTTGG	2	10	433365	433374	0 %	60 %	40 %	0 %	186893724
271	NC_010634	GATCT	2	10	437812	437821	20 %	40 %	20 %	20 %	186893727
272	NC_010634	GATCA	2	10	442994	443003	40 %	20 %	20 %	20 %	186893732
273	NC_010634	TCTGA	2	10	445537	445546	20 %	40 %	20 %	20 %	186893734
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275	NC_010634	GATGT	2	10	446792	446801	20 %	40 %	40 %	0 %	186893735
276	NC_010634	CCGTG	2	10	447190	447199	0 %	20 %	40 %	40 %	186893736
277	NC_010634	CAATC	2	10	447288	447297	40 %	20 %	0 %	40 %	186893736
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282	NC_010634	TTCAA	2	10	453607	453616	40 %	40 %	0 %	20 %	186893740
283	NC_010634	CAAAA	2	10	456335	456344	80 %	0 %	0 %	20 %	186893742
284	NC_010634	ATTTA	2	10	460439	460448	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_010634	ATGTT	2	10	462550	462559	20 %	60 %	20 %	0 %	186893753
286	NC_010634	TGTTA	2	10	463542	463551	20 %	60 %	20 %	0 %	186893753
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291	NC_010634	TTGTA	2	10	475942	475951	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
292	NC_010634	TGAAA	2	10	478697	478706	60 %	20 %	20 %	0 %	186893764
293	NC_010634	TCTGC	2	10	479040	479049	0 %	40 %	20 %	40 %	186893764
294	NC_010634	TATTC	2	10	479431	479440	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
295	NC_010634	ACCTC	2	10	479561	479570	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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305	NC_010634	TTGGG	2	10	497354	497363	0 %	40 %	60 %	0 %	186893779
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325	NC_010634	ATCCC	2	10	521397	521406	20 %	20 %	0 %	60 %	186893805
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381	NC_010634	TCACC	2	10	604642	604651	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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385	NC_010634	GGCAG	2	10	610673	610682	20 %	0 %	60 %	20 %	186893887
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393	NC_010634	AAAGA	2	10	621818	621827	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
394	NC_010634	CATCA	2	10	623217	623226	40 %	20 %	0 %	40 %	186893897
395	NC_010634	TTTCA	2	10	628166	628175	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
396	NC_010634	TCGGT	2	10	631141	631150	0 %	40 %	40 %	20 %	186893902
397	NC_010634	ATGCG	2	10	631252	631261	20 %	20 %	40 %	20 %	186893902
398	NC_010634	TTTGG	2	10	631509	631518	0 %	60 %	40 %	0 %	186893903
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