MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN04

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010633	TCAAT	2	10	3005	3014	40 %	40 %	0 %	20 %	186687000
2	NC_010633	ATCCC	2	10	3610	3619	20 %	20 %	0 %	60 %	186687000
3	NC_010633	AGGAA	2	10	5005	5014	60 %	0 %	40 %	0 %	186687000
4	NC_010633	CTGTT	2	10	5945	5954	0 %	60 %	20 %	20 %	186687000
5	NC_010633	AATCA	2	10	6741	6750	60 %	20 %	0 %	20 %	186687000
6	NC_010633	TAATT	2	10	7047	7056	40 %	60 %	0 %	0 %	186687000
7	NC_010633	CGCCC	2	10	12265	12274	0 %	0 %	20 %	80 %	186687001
8	NC_010633	GGCTT	2	10	12628	12637	0 %	40 %	40 %	20 %	186687002
9	NC_010633	CCAGC	2	10	12710	12719	20 %	0 %	20 %	60 %	186687002
10	NC_010633	CAGTG	2	10	13605	13614	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_010633	TTACT	2	10	14596	14605	20 %	60 %	0 %	20 %	186687004
12	NC_010633	AAATA	2	10	14957	14966	80 %	20 %	0 %	0 %	186687005
13	NC_010633	AAAAG	2	10	15173	15182	80 %	0 %	20 %	0 %	186687005
14	NC_010633	AAATT	2	10	17207	17216	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010633	AAAAC	2	10	17593	17602	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_010633	CAAAT	2	10	18425	18434	60 %	20 %	0 %	20 %	186687010
17	NC_010633	TATTT	2	10	19892	19901	20 %	80 %	0 %	0 %	186687012
18	NC_010633	TTGAC	2	10	20564	20573	20 %	40 %	20 %	20 %	186687013
19	NC_010633	TTAGT	2	10	21658	21667	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010633	TTAAA	2	10	23975	23984	60 %	40 %	0 %	0 %	186687017
21	NC_010633	CTTGA	2	10	24033	24042	20 %	40 %	20 %	20 %	186687017
22	NC_010633	CGGCG	2	10	24717	24726	0 %	0 %	60 %	40 %	186687017
23	NC_010633	AACTA	2	10	25440	25449	60 %	20 %	0 %	20 %	186687017
24	NC_010633	AGAGG	2	10	26216	26225	40 %	0 %	60 %	0 %	186687018
25	NC_010633	AAATC	2	10	27171	27180	60 %	20 %	0 %	20 %	186687020
26	NC_010633	CAATT	2	10	28414	28423	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_010633	CCCCA	2	10	28593	28602	20 %	0 %	0 %	80 %	186687022
28	NC_010633	AATTG	2	10	33979	33988	40 %	40 %	20 %	0 %	186687026
29	NC_010633	CGTAG	2	10	36226	36235	20 %	20 %	40 %	20 %	186687028
30	NC_010633	TTTGA	2	10	37330	37339	20 %	60 %	20 %	0 %	186687029
31	NC_010633	AAGTG	2	10	38087	38096	40 %	20 %	40 %	0 %	186687030
32	NC_010633	GGTGA	2	10	38382	38391	20 %	20 %	60 %	0 %	186687030
33	NC_010633	CATTT	2	10	39126	39135	20 %	60 %	0 %	20 %	186687031
34	NC_010633	AGCAG	2	10	39633	39642	40 %	0 %	40 %	20 %	186687031
35	NC_010633	GAAAA	2	10	39784	39793	80 %	0 %	20 %	0 %	186687031
36	NC_010633	AAAGA	2	10	43821	43830	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010633	CAAGG	2	10	44637	44646	40 %	0 %	40 %	20 %	186687035
38	NC_010633	CACGG	2	10	44751	44760	20 %	0 %	40 %	40 %	186687035
39	NC_010633	TTTCA	2	10	45358	45367	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_010633	ATTGA	2	10	52326	52335	40 %	40 %	20 %	0 %	186687038
41	NC_010633	GAGCA	2	10	55982	55991	40 %	0 %	40 %	20 %	186687042
42	NC_010633	AAAAG	2	10	56996	57005	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010633	ACACA	2	10	61888	61897	60 %	0 %	0 %	40 %	186687046
44	NC_010633	TTACG	2	10	62517	62526	20 %	40 %	20 %	20 %	186687046
45	NC_010633	AGTGA	2	10	63865	63874	40 %	20 %	40 %	0 %	186687047

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.