MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN04

Total Repeats: 167

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010633	GATA	2	8	314	321	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010633	AAAT	2	8	405	412	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010633	TTTG	2	8	604	611	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010633	ATAA	2	8	665	672	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010633	TTAC	2	8	943	950	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010633	TTTA	2	8	1362	1369	25 %	75 %	0 %	0 %	186687000
7	NC_010633	TGAG	2	8	1873	1880	25 %	25 %	50 %	0 %	186687000
8	NC_010633	AAGG	2	8	3163	3170	50 %	0 %	50 %	0 %	186687000
9	NC_010633	ATCA	2	8	3477	3484	50 %	25 %	0 %	25 %	186687000
10	NC_010633	GACG	2	8	3893	3900	25 %	0 %	50 %	25 %	186687000
11	NC_010633	AGTC	3	12	4142	4153	25 %	25 %	25 %	25 %	186687000
12	NC_010633	TTAA	2	8	4408	4415	50 %	50 %	0 %	0 %	186687000
13	NC_010633	CTTC	2	8	4513	4520	0 %	50 %	0 %	50 %	186687000
14	NC_010633	CTAA	2	8	5167	5174	50 %	25 %	0 %	25 %	186687000
15	NC_010633	GTTT	2	8	5239	5246	0 %	75 %	25 %	0 %	186687000
16	NC_010633	TGAG	2	8	5540	5547	25 %	25 %	50 %	0 %	186687000
17	NC_010633	AACT	2	8	5744	5751	50 %	25 %	0 %	25 %	186687000
18	NC_010633	CTTG	2	8	6121	6128	0 %	50 %	25 %	25 %	186687000
19	NC_010633	GATG	2	8	6385	6392	25 %	25 %	50 %	0 %	186687000
20	NC_010633	TAAG	2	8	6590	6597	50 %	25 %	25 %	0 %	186687000
21	NC_010633	AAAT	2	8	7134	7141	75 %	25 %	0 %	0 %	186687000
22	NC_010633	GCAC	2	8	9329	9336	25 %	0 %	25 %	50 %	186687001
23	NC_010633	ACAG	2	8	9506	9513	50 %	0 %	25 %	25 %	186687001
24	NC_010633	ACAA	2	8	9692	9699	75 %	0 %	0 %	25 %	186687001
25	NC_010633	ATGT	2	8	10342	10349	25 %	50 %	25 %	0 %	186687001
26	NC_010633	TAAA	2	8	10450	10457	75 %	25 %	0 %	0 %	186687001
27	NC_010633	TAGT	2	8	10552	10559	25 %	50 %	25 %	0 %	186687001
28	NC_010633	CATT	2	8	10577	10584	25 %	50 %	0 %	25 %	186687001
29	NC_010633	GTCC	2	8	10899	10906	0 %	25 %	25 %	50 %	186687001
30	NC_010633	ACAA	2	8	11454	11461	75 %	0 %	0 %	25 %	186687001
31	NC_010633	CATA	2	8	11498	11505	50 %	25 %	0 %	25 %	186687001
32	NC_010633	CATC	2	8	12559	12566	25 %	25 %	0 %	50 %	186687002
33	NC_010633	TTTA	2	8	12682	12689	25 %	75 %	0 %	0 %	186687002
34	NC_010633	AGGC	2	8	13130	13137	25 %	0 %	50 %	25 %	186687002
35	NC_010633	CAAA	2	8	13468	13475	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_010633	CTTG	2	8	13723	13730	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_010633	AAAC	2	8	14068	14075	75 %	0 %	0 %	25 %	186687003
38	NC_010633	GCAA	2	8	14309	14316	50 %	0 %	25 %	25 %	186687004
39	NC_010633	ATTC	2	8	14948	14955	25 %	50 %	0 %	25 %	186687005
40	NC_010633	GCTT	2	8	15580	15587	0 %	50 %	25 %	25 %	186687006
41	NC_010633	CTTC	2	8	15749	15756	0 %	50 %	0 %	50 %	186687006
42	NC_010633	CAAC	2	8	15911	15918	50 %	0 %	0 %	50 %	186687006
43	NC_010633	CAGC	2	8	16082	16089	25 %	0 %	25 %	50 %	186687006
44	NC_010633	AATT	2	8	16937	16944	50 %	50 %	0 %	0 %	186687007
45	NC_010633	TATT	2	8	17088	17095	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010633	TTGA	2	8	17176	17183	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010633	TAGT	2	8	17495	17502	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010633	GCAG	2	8	17746	17753	25 %	0 %	50 %	25 %	186687008
49	NC_010633	GTGG	2	8	17814	17821	0 %	25 %	75 %	0 %	186687008
50	NC_010633	ATCA	2	8	17955	17962	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_010633	TAAA	2	8	18366	18373	75 %	25 %	0 %	0 %	186687009
52	NC_010633	AAGG	2	8	18442	18449	50 %	0 %	50 %	0 %	186687010
53	NC_010633	CTAC	2	8	18789	18796	25 %	25 %	0 %	50 %	186687010
54	NC_010633	CTGG	2	8	18983	18990	0 %	25 %	50 %	25 %	186687010
55	NC_010633	GATT	2	8	19271	19278	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010633	TTAC	2	8	19538	19545	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_010633	AATA	2	8	19781	19788	75 %	25 %	0 %	0 %	186687011
58	NC_010633	AGTT	2	8	20300	20307	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010633	TAAA	2	8	20380	20387	75 %	25 %	0 %	0 %	186687013
60	NC_010633	AACC	2	8	21130	21137	50 %	0 %	0 %	50 %	186687013
61	NC_010633	TCAA	2	8	21221	21228	50 %	25 %	0 %	25 %	186687013
62	NC_010633	ATTC	2	8	22895	22902	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_010633	AATC	2	8	23439	23446	50 %	25 %	0 %	25 %	186687016
64	NC_010633	AATT	2	8	23823	23830	50 %	50 %	0 %	0 %	186687017
65	NC_010633	GCTT	2	8	24422	24429	0 %	50 %	25 %	25 %	186687017
66	NC_010633	CTTT	2	8	24592	24599	0 %	75 %	0 %	25 %	186687017
67	NC_010633	TCAA	2	8	24679	24686	50 %	25 %	0 %	25 %	186687017
68	NC_010633	GCAA	2	8	25593	25600	50 %	0 %	25 %	25 %	186687018
69	NC_010633	TCAT	2	8	26136	26143	25 %	50 %	0 %	25 %	186687018
70	NC_010633	TCTG	2	8	26329	26336	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_010633	CGGT	2	8	26437	26444	0 %	25 %	50 %	25 %	186687019
72	NC_010633	CTGG	2	8	27073	27080	0 %	25 %	50 %	25 %	186687020
73	NC_010633	ATGG	2	8	27259	27266	25 %	25 %	50 %	0 %	186687020
74	NC_010633	GGGT	2	8	27311	27318	0 %	25 %	75 %	0 %	186687020
75	NC_010633	TTTC	2	8	28019	28026	0 %	75 %	0 %	25 %	186687021
76	NC_010633	TAGG	2	8	28429	28436	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010633	TCAA	2	8	28883	28890	50 %	25 %	0 %	25 %	186687022
78	NC_010633	GGCA	2	8	29437	29444	25 %	0 %	50 %	25 %	186687022
79	NC_010633	TTAA	2	8	30292	30299	50 %	50 %	0 %	0 %	186687024
80	NC_010633	TTCG	2	8	30503	30510	0 %	50 %	25 %	25 %	186687024
81	NC_010633	AGAA	2	8	30562	30569	75 %	0 %	25 %	0 %	186687024
82	NC_010633	TAAT	2	8	30962	30969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010633	AGCA	2	8	31401	31408	50 %	0 %	25 %	25 %	186687026
84	NC_010633	CCAG	2	8	31451	31458	25 %	0 %	25 %	50 %	186687026
85	NC_010633	AAAT	2	8	31465	31472	75 %	25 %	0 %	0 %	186687026
86	NC_010633	ACAA	2	8	31792	31799	75 %	0 %	0 %	25 %	186687026
87	NC_010633	CTGG	2	8	32054	32061	0 %	25 %	50 %	25 %	186687026
88	NC_010633	TAAT	2	8	32682	32689	50 %	50 %	0 %	0 %	186687026
89	NC_010633	ATTG	2	8	32800	32807	25 %	50 %	25 %	0 %	186687026
90	NC_010633	AGCA	2	8	33909	33916	50 %	0 %	25 %	25 %	186687026
91	NC_010633	GAGG	2	8	34369	34376	25 %	0 %	75 %	0 %	186687026
92	NC_010633	CAAT	2	8	34747	34754	50 %	25 %	0 %	25 %	186687027
93	NC_010633	GCTT	2	8	35371	35378	0 %	50 %	25 %	25 %	186687028
94	NC_010633	AGCC	2	8	35464	35471	25 %	0 %	25 %	50 %	186687028
95	NC_010633	ATTT	2	8	36479	36486	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010633	AAAT	2	8	36509	36516	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010633	CCAG	2	8	37108	37115	25 %	0 %	25 %	50 %	186687029
98	NC_010633	TTTC	2	8	37361	37368	0 %	75 %	0 %	25 %	186687029
99	NC_010633	TAAA	2	8	38810	38817	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010633	AAAT	2	8	38963	38970	75 %	25 %	0 %	0 %	186687031
101	NC_010633	CTTT	2	8	39459	39466	0 %	75 %	0 %	25 %	186687031
102	NC_010633	CCCG	2	8	40163	40170	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
103	NC_010633	CCAA	2	8	40376	40383	50 %	0 %	0 %	50 %	186687032
104	NC_010633	CAGT	2	8	40585	40592	25 %	25 %	25 %	25 %	186687032
105	NC_010633	TAAT	2	8	41149	41156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010633	GGAA	2	8	41417	41424	50 %	0 %	50 %	0 %	186687033
107	NC_010633	TCAA	2	8	41661	41668	50 %	25 %	0 %	25 %	186687033
108	NC_010633	GATT	2	8	41706	41713	25 %	50 %	25 %	0 %	186687033
109	NC_010633	TCGG	2	8	42264	42271	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_010633	ATGA	2	8	42309	42316	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010633	AGCA	2	8	42916	42923	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_010633	ATTG	2	8	43169	43176	25 %	50 %	25 %	0 %	186687034
113	NC_010633	TGTT	2	8	43468	43475	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010633	GTTT	2	8	44404	44411	0 %	75 %	25 %	0 %	186687035
115	NC_010633	ATCG	2	8	44598	44605	25 %	25 %	25 %	25 %	186687035
116	NC_010633	AGCA	2	8	44788	44795	50 %	0 %	25 %	25 %	186687035
117	NC_010633	GATC	2	8	45008	45015	25 %	25 %	25 %	25 %	186687035
118	NC_010633	AAAG	2	8	45164	45171	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010633	GTAT	2	8	45481	45488	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010633	TTTA	2	8	45517	45524	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010633	ATTA	2	8	45833	45840	50 %	50 %	0 %	0 %	186687036
122	NC_010633	CTGA	2	8	45915	45922	25 %	25 %	25 %	25 %	186687036
123	NC_010633	GAAT	2	8	46074	46081	50 %	25 %	25 %	0 %	186687036
124	NC_010633	TCAC	2	8	46487	46494	25 %	25 %	0 %	50 %	186687036
125	NC_010633	GTAA	2	8	46574	46581	50 %	25 %	25 %	0 %	186687036
126	NC_010633	ATTG	2	8	47319	47326	25 %	50 %	25 %	0 %	186687036
127	NC_010633	CGAG	2	8	47447	47454	25 %	0 %	50 %	25 %	186687036
128	NC_010633	TCAG	2	8	47714	47721	25 %	25 %	25 %	25 %	186687036
129	NC_010633	CTGA	2	8	49345	49352	25 %	25 %	25 %	25 %	186687036
130	NC_010633	TTAA	2	8	49697	49704	50 %	50 %	0 %	0 %	186687036
131	NC_010633	TAAA	2	8	49919	49926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010633	TTGG	2	8	50879	50886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010633	GTCA	2	8	51482	51489	25 %	25 %	25 %	25 %	186687038
134	NC_010633	TAAA	2	8	51635	51642	75 %	25 %	0 %	0 %	186687038
135	NC_010633	TAGC	2	8	52048	52055	25 %	25 %	25 %	25 %	186687038
136	NC_010633	TCAA	2	8	52281	52288	50 %	25 %	0 %	25 %	186687038
137	NC_010633	TATT	2	8	52569	52576	25 %	75 %	0 %	0 %	186687038
138	NC_010633	CATA	2	8	53317	53324	50 %	25 %	0 %	25 %	186687038
139	NC_010633	TTGC	2	8	54069	54076	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_010633	GAAA	2	8	54828	54835	75 %	0 %	25 %	0 %	186687040
141	NC_010633	ATTA	2	8	54979	54986	50 %	50 %	0 %	0 %	186687041
142	NC_010633	TCAA	2	8	56298	56305	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_010633	AATT	2	8	56985	56992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010633	ATTG	2	8	57390	57397	25 %	50 %	25 %	0 %	186687043
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151	NC_010633	TGAG	2	8	58033	58040	25 %	25 %	50 %	0 %	186687043
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153	NC_010633	AGCG	2	8	58295	58302	25 %	0 %	50 %	25 %	186687043
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158	NC_010633	GTAT	2	8	59975	59982	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_010633	CCCG	2	8	60599	60606	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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164	NC_010633	ACAT	2	8	62432	62439	50 %	25 %	0 %	25 %	186687046
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167	NC_010633	TATT	2	8	64989	64996	25 %	75 %	0 %	0 %	186687047

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.