MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN04

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010633	TTTA	2	8	1362	1369	25 %	75 %	0 %	0 %	186687000
2	NC_010633	TGAG	2	8	1873	1880	25 %	25 %	50 %	0 %	186687000
3	NC_010633	AAGG	2	8	3163	3170	50 %	0 %	50 %	0 %	186687000
4	NC_010633	ATCA	2	8	3477	3484	50 %	25 %	0 %	25 %	186687000
5	NC_010633	GACG	2	8	3893	3900	25 %	0 %	50 %	25 %	186687000
6	NC_010633	AGTC	3	12	4142	4153	25 %	25 %	25 %	25 %	186687000
7	NC_010633	TTAA	2	8	4408	4415	50 %	50 %	0 %	0 %	186687000
8	NC_010633	CTTC	2	8	4513	4520	0 %	50 %	0 %	50 %	186687000
9	NC_010633	CTAA	2	8	5167	5174	50 %	25 %	0 %	25 %	186687000
10	NC_010633	GTTT	2	8	5239	5246	0 %	75 %	25 %	0 %	186687000
11	NC_010633	TGAG	2	8	5540	5547	25 %	25 %	50 %	0 %	186687000
12	NC_010633	AACT	2	8	5744	5751	50 %	25 %	0 %	25 %	186687000
13	NC_010633	CTTG	2	8	6121	6128	0 %	50 %	25 %	25 %	186687000
14	NC_010633	GATG	2	8	6385	6392	25 %	25 %	50 %	0 %	186687000
15	NC_010633	TAAG	2	8	6590	6597	50 %	25 %	25 %	0 %	186687000
16	NC_010633	AAAT	2	8	7134	7141	75 %	25 %	0 %	0 %	186687000
17	NC_010633	GCAC	2	8	9329	9336	25 %	0 %	25 %	50 %	186687001
18	NC_010633	ACAG	2	8	9506	9513	50 %	0 %	25 %	25 %	186687001
19	NC_010633	ACAA	2	8	9692	9699	75 %	0 %	0 %	25 %	186687001
20	NC_010633	ATGT	2	8	10342	10349	25 %	50 %	25 %	0 %	186687001
21	NC_010633	TAAA	2	8	10450	10457	75 %	25 %	0 %	0 %	186687001
22	NC_010633	TAGT	2	8	10552	10559	25 %	50 %	25 %	0 %	186687001
23	NC_010633	CATT	2	8	10577	10584	25 %	50 %	0 %	25 %	186687001
24	NC_010633	GTCC	2	8	10899	10906	0 %	25 %	25 %	50 %	186687001
25	NC_010633	ACAA	2	8	11454	11461	75 %	0 %	0 %	25 %	186687001
26	NC_010633	CATA	2	8	11498	11505	50 %	25 %	0 %	25 %	186687001
27	NC_010633	CATC	2	8	12559	12566	25 %	25 %	0 %	50 %	186687002
28	NC_010633	TTTA	2	8	12682	12689	25 %	75 %	0 %	0 %	186687002
29	NC_010633	AGGC	2	8	13130	13137	25 %	0 %	50 %	25 %	186687002
30	NC_010633	AAAC	2	8	14068	14075	75 %	0 %	0 %	25 %	186687003
31	NC_010633	GCAA	2	8	14309	14316	50 %	0 %	25 %	25 %	186687004
32	NC_010633	ATTC	2	8	14948	14955	25 %	50 %	0 %	25 %	186687005
33	NC_010633	GCTT	2	8	15580	15587	0 %	50 %	25 %	25 %	186687006
34	NC_010633	CTTC	2	8	15749	15756	0 %	50 %	0 %	50 %	186687006
35	NC_010633	CAAC	2	8	15911	15918	50 %	0 %	0 %	50 %	186687006
36	NC_010633	CAGC	2	8	16082	16089	25 %	0 %	25 %	50 %	186687006
37	NC_010633	AATT	2	8	16937	16944	50 %	50 %	0 %	0 %	186687007
38	NC_010633	GCAG	2	8	17746	17753	25 %	0 %	50 %	25 %	186687008
39	NC_010633	GTGG	2	8	17814	17821	0 %	25 %	75 %	0 %	186687008
40	NC_010633	TAAA	2	8	18366	18373	75 %	25 %	0 %	0 %	186687009
41	NC_010633	AAGG	2	8	18442	18449	50 %	0 %	50 %	0 %	186687010
42	NC_010633	CTAC	2	8	18789	18796	25 %	25 %	0 %	50 %	186687010
43	NC_010633	CTGG	2	8	18983	18990	0 %	25 %	50 %	25 %	186687010
44	NC_010633	AATA	2	8	19781	19788	75 %	25 %	0 %	0 %	186687011
45	NC_010633	TAAA	2	8	20380	20387	75 %	25 %	0 %	0 %	186687013
46	NC_010633	AACC	2	8	21130	21137	50 %	0 %	0 %	50 %	186687013
47	NC_010633	TCAA	2	8	21221	21228	50 %	25 %	0 %	25 %	186687013
48	NC_010633	AATC	2	8	23439	23446	50 %	25 %	0 %	25 %	186687016
49	NC_010633	AATT	2	8	23823	23830	50 %	50 %	0 %	0 %	186687017
50	NC_010633	GCTT	2	8	24422	24429	0 %	50 %	25 %	25 %	186687017
51	NC_010633	CTTT	2	8	24592	24599	0 %	75 %	0 %	25 %	186687017
52	NC_010633	TCAA	2	8	24679	24686	50 %	25 %	0 %	25 %	186687017
53	NC_010633	GCAA	2	8	25593	25600	50 %	0 %	25 %	25 %	186687018
54	NC_010633	TCAT	2	8	26136	26143	25 %	50 %	0 %	25 %	186687018
55	NC_010633	CGGT	2	8	26437	26444	0 %	25 %	50 %	25 %	186687019
56	NC_010633	CTGG	2	8	27073	27080	0 %	25 %	50 %	25 %	186687020
57	NC_010633	ATGG	2	8	27259	27266	25 %	25 %	50 %	0 %	186687020
58	NC_010633	GGGT	2	8	27311	27318	0 %	25 %	75 %	0 %	186687020
59	NC_010633	TTTC	2	8	28019	28026	0 %	75 %	0 %	25 %	186687021
60	NC_010633	TCAA	2	8	28883	28890	50 %	25 %	0 %	25 %	186687022
61	NC_010633	GGCA	2	8	29437	29444	25 %	0 %	50 %	25 %	186687022
62	NC_010633	TTAA	2	8	30292	30299	50 %	50 %	0 %	0 %	186687024
63	NC_010633	TTCG	2	8	30503	30510	0 %	50 %	25 %	25 %	186687024
64	NC_010633	AGAA	2	8	30562	30569	75 %	0 %	25 %	0 %	186687024
65	NC_010633	AGCA	2	8	31401	31408	50 %	0 %	25 %	25 %	186687026
66	NC_010633	CCAG	2	8	31451	31458	25 %	0 %	25 %	50 %	186687026
67	NC_010633	AAAT	2	8	31465	31472	75 %	25 %	0 %	0 %	186687026
68	NC_010633	ACAA	2	8	31792	31799	75 %	0 %	0 %	25 %	186687026
69	NC_010633	CTGG	2	8	32054	32061	0 %	25 %	50 %	25 %	186687026
70	NC_010633	TAAT	2	8	32682	32689	50 %	50 %	0 %	0 %	186687026
71	NC_010633	ATTG	2	8	32800	32807	25 %	50 %	25 %	0 %	186687026
72	NC_010633	AGCA	2	8	33909	33916	50 %	0 %	25 %	25 %	186687026
73	NC_010633	GAGG	2	8	34369	34376	25 %	0 %	75 %	0 %	186687026
74	NC_010633	CAAT	2	8	34747	34754	50 %	25 %	0 %	25 %	186687027
75	NC_010633	GCTT	2	8	35371	35378	0 %	50 %	25 %	25 %	186687028
76	NC_010633	AGCC	2	8	35464	35471	25 %	0 %	25 %	50 %	186687028
77	NC_010633	CCAG	2	8	37108	37115	25 %	0 %	25 %	50 %	186687029
78	NC_010633	TTTC	2	8	37361	37368	0 %	75 %	0 %	25 %	186687029
79	NC_010633	AAAT	2	8	38963	38970	75 %	25 %	0 %	0 %	186687031
80	NC_010633	CTTT	2	8	39459	39466	0 %	75 %	0 %	25 %	186687031
81	NC_010633	CCAA	2	8	40376	40383	50 %	0 %	0 %	50 %	186687032
82	NC_010633	CAGT	2	8	40585	40592	25 %	25 %	25 %	25 %	186687032
83	NC_010633	GGAA	2	8	41417	41424	50 %	0 %	50 %	0 %	186687033
84	NC_010633	TCAA	2	8	41661	41668	50 %	25 %	0 %	25 %	186687033
85	NC_010633	GATT	2	8	41706	41713	25 %	50 %	25 %	0 %	186687033
86	NC_010633	ATTG	2	8	43169	43176	25 %	50 %	25 %	0 %	186687034
87	NC_010633	GTTT	2	8	44404	44411	0 %	75 %	25 %	0 %	186687035
88	NC_010633	ATCG	2	8	44598	44605	25 %	25 %	25 %	25 %	186687035
89	NC_010633	AGCA	2	8	44788	44795	50 %	0 %	25 %	25 %	186687035
90	NC_010633	GATC	2	8	45008	45015	25 %	25 %	25 %	25 %	186687035
91	NC_010633	ATTA	2	8	45833	45840	50 %	50 %	0 %	0 %	186687036
92	NC_010633	CTGA	2	8	45915	45922	25 %	25 %	25 %	25 %	186687036
93	NC_010633	GAAT	2	8	46074	46081	50 %	25 %	25 %	0 %	186687036
94	NC_010633	TCAC	2	8	46487	46494	25 %	25 %	0 %	50 %	186687036
95	NC_010633	GTAA	2	8	46574	46581	50 %	25 %	25 %	0 %	186687036
96	NC_010633	ATTG	2	8	47319	47326	25 %	50 %	25 %	0 %	186687036
97	NC_010633	CGAG	2	8	47447	47454	25 %	0 %	50 %	25 %	186687036
98	NC_010633	TCAG	2	8	47714	47721	25 %	25 %	25 %	25 %	186687036
99	NC_010633	CTGA	2	8	49345	49352	25 %	25 %	25 %	25 %	186687036
100	NC_010633	TTAA	2	8	49697	49704	50 %	50 %	0 %	0 %	186687036
101	NC_010633	GTCA	2	8	51482	51489	25 %	25 %	25 %	25 %	186687038
102	NC_010633	TAAA	2	8	51635	51642	75 %	25 %	0 %	0 %	186687038
103	NC_010633	TAGC	2	8	52048	52055	25 %	25 %	25 %	25 %	186687038
104	NC_010633	TCAA	2	8	52281	52288	50 %	25 %	0 %	25 %	186687038
105	NC_010633	TATT	2	8	52569	52576	25 %	75 %	0 %	0 %	186687038
106	NC_010633	CATA	2	8	53317	53324	50 %	25 %	0 %	25 %	186687038
107	NC_010633	GAAA	2	8	54828	54835	75 %	0 %	25 %	0 %	186687040
108	NC_010633	ATTA	2	8	54979	54986	50 %	50 %	0 %	0 %	186687041
109	NC_010633	ATTG	2	8	57390	57397	25 %	50 %	25 %	0 %	186687043
110	NC_010633	GGCT	2	8	57534	57541	0 %	25 %	50 %	25 %	186687043
111	NC_010633	GCAA	2	8	57542	57549	50 %	0 %	25 %	25 %	186687043
112	NC_010633	GCTG	2	8	57650	57657	0 %	25 %	50 %	25 %	186687043
113	NC_010633	AGCC	2	8	57687	57694	25 %	0 %	25 %	50 %	186687043
114	NC_010633	AGCG	2	8	57714	57721	25 %	0 %	50 %	25 %	186687043
115	NC_010633	TATG	2	8	57894	57901	25 %	50 %	25 %	0 %	186687043
116	NC_010633	TGAG	2	8	58033	58040	25 %	25 %	50 %	0 %	186687043
117	NC_010633	GACC	2	8	58243	58250	25 %	0 %	25 %	50 %	186687043
118	NC_010633	AGCG	2	8	58295	58302	25 %	0 %	50 %	25 %	186687043
119	NC_010633	GGTT	2	8	58480	58487	0 %	50 %	50 %	0 %	186687043
120	NC_010633	TGAC	2	8	58543	58550	25 %	25 %	25 %	25 %	186687043
121	NC_010633	CTCG	2	8	61479	61486	0 %	25 %	25 %	50 %	186687045
122	NC_010633	TGCT	2	8	62257	62264	0 %	50 %	25 %	25 %	186687046
123	NC_010633	AGTA	2	8	62336	62343	50 %	25 %	25 %	0 %	186687046
124	NC_010633	ACAT	2	8	62432	62439	50 %	25 %	0 %	25 %	186687046
125	NC_010633	ATTA	2	8	64192	64199	50 %	50 %	0 %	0 %	186687047
126	NC_010633	AGAA	2	8	64778	64785	75 %	0 %	25 %	0 %	186687047
127	NC_010633	TATT	2	8	64989	64996	25 %	75 %	0 %	0 %	186687047

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.