MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN04

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010633	CT	3	6	628	633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010633	AT	3	6	1083	1088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010633	GA	3	6	3181	3186	50 %	0 %	50 %	0 %	186687000
4	NC_010633	GA	3	6	3885	3890	50 %	0 %	50 %	0 %	186687000
5	NC_010633	TA	3	6	4607	4612	50 %	50 %	0 %	0 %	186687000
6	NC_010633	AG	3	6	4782	4787	50 %	0 %	50 %	0 %	186687000
7	NC_010633	AT	3	6	5577	5582	50 %	50 %	0 %	0 %	186687000
8	NC_010633	AT	3	6	5787	5792	50 %	50 %	0 %	0 %	186687000
9	NC_010633	AT	3	6	6027	6032	50 %	50 %	0 %	0 %	186687000
10	NC_010633	GT	3	6	6266	6271	0 %	50 %	50 %	0 %	186687000
11	NC_010633	AT	3	6	6719	6724	50 %	50 %	0 %	0 %	186687000
12	NC_010633	TA	3	6	6825	6830	50 %	50 %	0 %	0 %	186687000
13	NC_010633	AG	3	6	7072	7077	50 %	0 %	50 %	0 %	186687000
14	NC_010633	AG	3	6	7097	7102	50 %	0 %	50 %	0 %	186687000
15	NC_010633	GT	3	6	8198	8203	0 %	50 %	50 %	0 %	186687000
16	NC_010633	GA	3	6	8305	8310	50 %	0 %	50 %	0 %	186687000
17	NC_010633	CT	3	6	9009	9014	0 %	50 %	0 %	50 %	186687001
18	NC_010633	GA	3	6	9206	9211	50 %	0 %	50 %	0 %	186687001
19	NC_010633	GT	3	6	11411	11416	0 %	50 %	50 %	0 %	186687001
20	NC_010633	AC	3	6	12014	12019	50 %	0 %	0 %	50 %	186687001
21	NC_010633	GT	3	6	13525	13530	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010633	TA	3	6	13826	13831	50 %	50 %	0 %	0 %	186687003
23	NC_010633	TA	4	8	14339	14346	50 %	50 %	0 %	0 %	186687004
24	NC_010633	AT	3	6	14452	14457	50 %	50 %	0 %	0 %	186687004
25	NC_010633	TA	3	6	15083	15088	50 %	50 %	0 %	0 %	186687005
26	NC_010633	AG	3	6	15785	15790	50 %	0 %	50 %	0 %	186687006
27	NC_010633	GA	3	6	16391	16396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010633	AG	3	6	16483	16488	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010633	CT	3	6	18176	18181	0 %	50 %	0 %	50 %	186687009
30	NC_010633	AG	3	6	18724	18729	50 %	0 %	50 %	0 %	186687010
31	NC_010633	TG	3	6	19635	19640	0 %	50 %	50 %	0 %	186687011
32	NC_010633	TC	3	6	19883	19888	0 %	50 %	0 %	50 %	186687012
33	NC_010633	TG	3	6	20704	20709	0 %	50 %	50 %	0 %	186687013
34	NC_010633	AT	3	6	21641	21646	50 %	50 %	0 %	0 %	186687013
35	NC_010633	CT	3	6	22823	22828	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010633	CA	3	6	23204	23209	50 %	0 %	0 %	50 %	186687016
37	NC_010633	AG	3	6	23758	23763	50 %	0 %	50 %	0 %	186687017
38	NC_010633	AT	3	6	24244	24249	50 %	50 %	0 %	0 %	186687017
39	NC_010633	CT	3	6	26323	26328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_010633	GT	3	6	27340	27345	0 %	50 %	50 %	0 %	186687020
41	NC_010633	CT	4	8	27610	27617	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_010633	GA	3	6	27653	27658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010633	GA	3	6	28840	28845	50 %	0 %	50 %	0 %	186687022
44	NC_010633	AT	3	6	29572	29577	50 %	50 %	0 %	0 %	186687022
45	NC_010633	AG	3	6	29796	29801	50 %	0 %	50 %	0 %	186687023
46	NC_010633	GA	3	6	29908	29913	50 %	0 %	50 %	0 %	186687023
47	NC_010633	AG	3	6	31457	31462	50 %	0 %	50 %	0 %	186687026
48	NC_010633	CT	3	6	32451	32456	0 %	50 %	0 %	50 %	186687026
49	NC_010633	GA	3	6	32938	32943	50 %	0 %	50 %	0 %	186687026
50	NC_010633	GT	3	6	33001	33006	0 %	50 %	50 %	0 %	186687026
51	NC_010633	TA	4	8	33100	33107	50 %	50 %	0 %	0 %	186687026
52	NC_010633	AG	4	8	33525	33532	50 %	0 %	50 %	0 %	186687026
53	NC_010633	AG	4	8	36466	36473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010633	TA	3	6	36577	36582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010633	TA	3	6	37488	37493	50 %	50 %	0 %	0 %	186687029
56	NC_010633	GA	3	6	38303	38308	50 %	0 %	50 %	0 %	186687030
57	NC_010633	AG	3	6	38337	38342	50 %	0 %	50 %	0 %	186687030
58	NC_010633	AT	3	6	38360	38365	50 %	50 %	0 %	0 %	186687030
59	NC_010633	AT	3	6	41246	41251	50 %	50 %	0 %	0 %	186687033
60	NC_010633	TA	3	6	41521	41526	50 %	50 %	0 %	0 %	186687033
61	NC_010633	CG	3	6	42295	42300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_010633	TG	3	6	43492	43497	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010633	AT	3	6	44474	44479	50 %	50 %	0 %	0 %	186687035
64	NC_010633	TA	4	8	45425	45432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010633	TA	4	8	45727	45734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010633	CT	3	6	46328	46333	0 %	50 %	0 %	50 %	186687036
67	NC_010633	CA	3	6	46586	46591	50 %	0 %	0 %	50 %	186687036
68	NC_010633	TA	3	6	50436	50441	50 %	50 %	0 %	0 %	186687037
69	NC_010633	AG	4	8	50962	50969	50 %	0 %	50 %	0 %	186687038
70	NC_010633	GA	3	6	52069	52074	50 %	0 %	50 %	0 %	186687038
71	NC_010633	GA	3	6	52249	52254	50 %	0 %	50 %	0 %	186687038
72	NC_010633	CT	3	6	52706	52711	0 %	50 %	0 %	50 %	186687038
73	NC_010633	AG	3	6	55756	55761	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010633	TA	3	6	55800	55805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010633	AG	3	6	56065	56070	50 %	0 %	50 %	0 %	186687042
76	NC_010633	AT	3	6	56441	56446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010633	CT	4	8	58594	58601	0 %	50 %	0 %	50 %	186687043
78	NC_010633	AT	3	6	58637	58642	50 %	50 %	0 %	0 %	186687043
79	NC_010633	TG	3	6	59446	59451	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010633	GA	3	6	59610	59615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010633	TC	3	6	59731	59736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_010633	GA	3	6	59933	59938	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010633	CT	3	6	61040	61045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_010633	AT	3	6	61649	61654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010633	GA	3	6	61678	61683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010633	TA	3	6	61953	61958	50 %	50 %	0 %	0 %	186687046
87	NC_010633	AG	3	6	62001	62006	50 %	0 %	50 %	0 %	186687046
88	NC_010633	TA	3	6	62619	62624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010633	CA	3	6	63315	63320	50 %	0 %	0 %	50 %	186687047
90	NC_010633	AC	3	6	63629	63634	50 %	0 %	0 %	50 %	186687047
91	NC_010633	GA	3	6	64224	64229	50 %	0 %	50 %	0 %	186687047
92	NC_010633	TA	4	8	65609	65616	50 %	50 %	0 %	0 %	186687047

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.