MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN02

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010632	TTTTAT	2	12	5758	5769	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	186687054
2	NC_010632	TGCTTC	2	12	8943	8954	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	186687055
3	NC_010632	CAGACA	2	12	9641	9652	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	186687055
4	NC_010632	AAGCAG	2	12	26008	26019	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	186687078
5	NC_010632	CAATTT	2	12	40689	40700	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	186687089
6	NC_010632	CCATTC	2	12	43203	43214	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	186687091
7	NC_010632	CTCTGA	2	12	43891	43902	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	186687092
8	NC_010632	GCAACA	2	12	47295	47306	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	186687097
9	NC_010632	CAAGCC	2	12	47515	47526	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	186687097
10	NC_010632	TGCTAT	2	12	52389	52400	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	186687099
11	NC_010632	AATGCA	2	12	53242	53253	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	186687099
12	NC_010632	AAGTTG	2	12	56685	56696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186687103
13	NC_010632	TGGCTG	2	12	60185	60196	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	186687109
14	NC_010632	GTCACC	2	12	64988	64999	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	186687116
15	NC_010632	ACACTA	2	12	65774	65785	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	186687118
16	NC_010632	CTGATT	2	12	71970	71981	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	186687121
17	NC_010632	AGCCAA	2	12	74660	74671	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	186687124
18	NC_010632	GGCTTT	2	12	84828	84839	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	186687127
19	NC_010632	TTAGAA	2	12	94448	94459	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	186687130
20	NC_010632	AGCTAC	2	12	95374	95385	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	186687130
21	NC_010632	CAATAT	2	12	97484	97495	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	186687131
22	NC_010632	TCATTA	2	12	97501	97512	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	186687131
23	NC_010632	GGATGT	2	12	97570	97581	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	186687131
24	NC_010632	CATTAG	2	12	101219	101230	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	186687132
25	NC_010632	CTCCTT	2	12	102299	102310	0 %	50 %	0 %	50 %	186687133
26	NC_010632	CCAAGC	2	12	108697	108708	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	186687143
27	NC_010632	ATAGTT	2	12	112391	112402	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	186687149
28	NC_010632	CGATTG	2	12	112920	112931	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	186687150
29	NC_010632	CTTACG	2	12	117285	117296	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	186687155
30	NC_010632	TGGGCA	2	12	118015	118026	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	186687156
31	NC_010632	GTCATG	2	12	122212	122223	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	186687157
32	NC_010632	CAAAAA	2	12	123777	123788	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	186687158
33	NC_010632	GCCATT	2	12	125676	125687	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	186687161
34	NC_010632	GCTGAA	2	12	128606	128617	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	186687162
35	NC_010632	AGTAGA	2	12	129368	129379	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	186687163
36	NC_010632	ACTGCT	2	12	132899	132910	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	186687164
37	NC_010632	AGTTGC	2	12	137819	137830	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	186687167
38	NC_010632	CGGGAT	2	12	138834	138845	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	186687168
39	NC_010632	ATACTA	2	12	141344	141355	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	186687171
40	NC_010632	CACGCT	2	12	146500	146511	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	186687173
41	NC_010632	TAGCTC	2	12	150110	150121	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	186687176
42	NC_010632	GCTCAA	2	12	151181	151192	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	186687177
43	NC_010632	CAGTCC	2	12	159752	159763	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	186687181
44	NC_010632	CTCTTT	2	12	161887	161898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186687182
45	NC_010632	TTACCA	2	12	162736	162747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186687183
46	NC_010632	TCACCG	2	12	162940	162951	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	186687183
47	NC_010632	CTGAAT	2	12	168391	168402	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	186687189
48	NC_010632	TGCCAC	2	12	173090	173101	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	186687194
49	NC_010632	TCGACC	2	12	177956	177967	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	186687197
50	NC_010632	TAGTAC	2	12	180217	180228	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	186687198
51	NC_010632	GTTTAG	2	12	182400	182411	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	186687199
52	NC_010632	AACTCA	2	12	182852	182863	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	186687199
53	NC_010632	CCTTAT	2	12	183880	183891	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	186687200
54	NC_010632	CAATGG	2	12	184065	184076	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	186687200
55	NC_010632	TGTGAA	2	12	191892	191903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186687204
56	NC_010632	GCCAAG	2	12	193671	193682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186687204
57	NC_010632	CGGCGA	2	12	198314	198325	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	186687206
58	NC_010632	GCTTTA	2	12	204080	204091	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	186687210
59	NC_010632	GCATCA	2	12	205111	205122	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	186687211
60	NC_010632	GCACCA	2	12	208158	208169	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	186687214
61	NC_010632	GCTCAA	2	12	208626	208637	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	186687214
62	NC_010632	CAGACA	3	18	208902	208919	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	186687214
63	NC_010632	ACTGCT	2	12	211664	211675	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	186687217
64	NC_010632	CTAATC	2	12	213135	213146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186687217
65	NC_010632	TTTGAT	2	12	216011	216022	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	186687220
66	NC_010632	GGAAGA	2	12	216738	216749	50 %	0 %	50 %	0 %	186687220
67	NC_010632	ATTTGA	2	12	217417	217428	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	186687220
68	NC_010632	CCACAG	2	12	218063	218074	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	186687220
69	NC_010632	AGAATT	2	12	218452	218463	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	186687220
70	NC_010632	GCAACA	2	12	219203	219214	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	186687221
71	NC_010632	CATGAG	2	12	219638	219649	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	186687223
72	NC_010632	TTTTTA	2	12	224096	224107	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	186687228
73	NC_010632	TTTCTC	2	12	229332	229343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186687231
74	NC_010632	TGCAGA	2	12	230554	230565	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	186687232
75	NC_010632	GATGAC	2	12	230909	230920	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	186687232
76	NC_010632	ATCTCC	2	12	234535	234546	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	186687234
77	NC_010632	TGCAAT	2	12	246935	246946	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	186687240
78	NC_010632	ATGAGG	2	12	249697	249708	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	186687242
79	NC_010632	ATCGTC	2	12	253798	253809	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	186687245

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.