MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN02

Total Repeats: 159

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010632	TAAAA	2	10	128	137	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010632	ATTTT	2	10	1149	1158	20 %	80 %	0 %	0 %	186687049
3	NC_010632	AACTG	2	10	1821	1830	40 %	20 %	20 %	20 %	186687050
4	NC_010632	AGTTG	2	10	2941	2950	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010632	TCAAC	2	10	3246	3255	40 %	20 %	0 %	40 %	186687052
6	NC_010632	GAAAA	2	10	4257	4266	80 %	0 %	20 %	0 %	186687053
7	NC_010632	TACCT	2	10	7545	7554	20 %	40 %	0 %	40 %	186687055
8	NC_010632	AACAA	2	10	9116	9125	80 %	0 %	0 %	20 %	186687055
9	NC_010632	ATTAA	2	10	10320	10329	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010632	ATTTA	2	10	11822	11831	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010632	ATTCT	2	10	12362	12371	20 %	60 %	0 %	20 %	186687056
12	NC_010632	TAAAT	2	10	12904	12913	60 %	40 %	0 %	0 %	186687057
13	NC_010632	ACCGA	2	10	16535	16544	40 %	0 %	20 %	40 %	186687062
14	NC_010632	AATTA	2	10	16826	16835	60 %	40 %	0 %	0 %	186687062
15	NC_010632	TTTTG	2	10	16912	16921	0 %	80 %	20 %	0 %	186687062
16	NC_010632	TCGGC	2	10	23304	23313	0 %	20 %	40 %	40 %	186687075
17	NC_010632	TTTTG	2	10	24456	24465	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010632	AATAG	2	10	29412	29421	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010632	AGAGA	2	10	30084	30093	60 %	0 %	40 %	0 %	186687080
20	NC_010632	TAGTA	2	10	33204	33213	40 %	40 %	20 %	0 %	186687081
21	NC_010632	GTCGC	2	10	34675	34684	0 %	20 %	40 %	40 %	186687083
22	NC_010632	AGAGC	2	10	35256	35265	40 %	0 %	40 %	20 %	186687084
23	NC_010632	GATTG	2	10	37792	37801	20 %	40 %	40 %	0 %	186687086
24	NC_010632	TCTCT	2	10	38786	38795	0 %	60 %	0 %	40 %	186687087
25	NC_010632	GCAAC	2	10	38987	38996	40 %	0 %	20 %	40 %	186687087
26	NC_010632	TTAGT	2	10	40885	40894	20 %	60 %	20 %	0 %	186687089
27	NC_010632	CAAAC	2	10	43072	43081	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_010632	TGCTT	2	10	44355	44364	0 %	60 %	20 %	20 %	186687093
29	NC_010632	TGTAA	2	10	45034	45043	40 %	40 %	20 %	0 %	186687094
30	NC_010632	AACAG	2	10	45857	45866	60 %	0 %	20 %	20 %	186687096
31	NC_010632	TAATT	2	10	49798	49807	40 %	60 %	0 %	0 %	186687098
32	NC_010632	TACCA	2	10	51052	51061	40 %	20 %	0 %	40 %	186687099
33	NC_010632	TTATT	2	10	52307	52316	20 %	80 %	0 %	0 %	186687099
34	NC_010632	CACTG	2	10	54158	54167	20 %	20 %	20 %	40 %	186687100
35	NC_010632	AAGTC	2	10	55525	55534	40 %	20 %	20 %	20 %	186687102
36	NC_010632	GGACA	2	10	56259	56268	40 %	0 %	40 %	20 %	186687102
37	NC_010632	GGAGA	2	10	56304	56313	40 %	0 %	60 %	0 %	186687102
38	NC_010632	GCTGT	2	10	57221	57230	0 %	40 %	40 %	20 %	186687104
39	NC_010632	TGAAC	2	10	57725	57734	40 %	20 %	20 %	20 %	186687105
40	NC_010632	TCTAC	2	10	61547	61556	20 %	40 %	0 %	40 %	186687110
41	NC_010632	TATTT	2	10	61638	61647	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010632	TGCGA	2	10	62652	62661	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_010632	TCGCT	2	10	62692	62701	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_010632	GCTGT	2	10	63945	63954	0 %	40 %	40 %	20 %	186687113
45	NC_010632	TTTAA	2	10	65350	65359	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010632	CAAAC	2	10	65655	65664	60 %	0 %	0 %	40 %	186687118
47	NC_010632	GCATG	2	10	66040	66049	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_010632	GTTCG	2	10	67248	67257	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_010632	ACTCA	2	10	67556	67565	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_010632	TCACT	2	10	70651	70660	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_010632	CGTAA	2	10	72000	72009	40 %	20 %	20 %	20 %	186687121
52	NC_010632	CAAAC	2	10	73619	73628	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_010632	ACACT	2	10	75252	75261	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_010632	CGAAC	2	10	75389	75398	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_010632	AATTT	2	10	76425	76434	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010632	CCTCT	2	10	77522	77531	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
57	NC_010632	TTTTA	2	10	79419	79428	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010632	TTTCT	2	10	79836	79845	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_010632	GAAAA	2	10	80422	80431	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010632	GCGGG	2	10	83960	83969	0 %	0 %	80 %	20 %	186687127
61	NC_010632	TGCGA	2	10	88197	88206	20 %	20 %	40 %	20 %	186687128
62	NC_010632	ACCAA	2	10	88749	88758	60 %	0 %	0 %	40 %	186687128
63	NC_010632	TGGTT	2	10	89359	89368	0 %	60 %	40 %	0 %	186687128
64	NC_010632	TTATT	2	10	90045	90054	20 %	80 %	0 %	0 %	186687128
65	NC_010632	CAACC	2	10	93371	93380	40 %	0 %	0 %	60 %	186687130
66	NC_010632	ACCAA	2	10	93999	94008	60 %	0 %	0 %	40 %	186687130
67	NC_010632	TTGTT	2	10	94115	94124	0 %	80 %	20 %	0 %	186687130
68	NC_010632	AGCCA	2	10	94502	94511	40 %	0 %	20 %	40 %	186687130
69	NC_010632	CAAAA	2	10	95035	95044	80 %	0 %	0 %	20 %	186687130
70	NC_010632	CGCTA	2	10	95297	95306	20 %	20 %	20 %	40 %	186687130
71	NC_010632	GATGA	2	10	101983	101992	40 %	20 %	40 %	0 %	186687133
72	NC_010632	CCTTG	2	10	102055	102064	0 %	40 %	20 %	40 %	186687133
73	NC_010632	CAACC	2	10	106553	106562	40 %	0 %	0 %	60 %	186687139
74	NC_010632	TTCGA	2	10	109756	109765	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_010632	CCCAT	2	10	110843	110852	20 %	20 %	0 %	60 %	186687146
76	NC_010632	AGAAA	2	10	118534	118543	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010632	TAGAC	2	10	122179	122188	40 %	20 %	20 %	20 %	186687157
78	NC_010632	CGGCA	2	10	125006	125015	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
79	NC_010632	GACAT	2	10	125430	125439	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_010632	CTATA	2	10	125491	125500	40 %	40 %	0 %	20 %	186687161
81	NC_010632	GGCAT	2	10	125778	125787	20 %	20 %	40 %	20 %	186687161
82	NC_010632	TTTAG	2	10	126597	126606	20 %	60 %	20 %	0 %	186687161
83	NC_010632	TTTAT	2	10	127080	127089	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010632	AGGAA	2	10	127907	127916	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010632	CAATA	2	10	129280	129289	60 %	20 %	0 %	20 %	186687163
86	NC_010632	TGGTT	2	10	132094	132103	0 %	60 %	40 %	0 %	186687164
87	NC_010632	CAAAG	2	10	132238	132247	60 %	0 %	20 %	20 %	186687164
88	NC_010632	AACTA	2	10	133350	133359	60 %	20 %	0 %	20 %	186687164
89	NC_010632	ACTAC	2	10	134843	134852	40 %	20 %	0 %	40 %	186687164
90	NC_010632	ACACA	2	10	135737	135746	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_010632	GGGCT	2	10	138762	138771	0 %	20 %	60 %	20 %	186687168
92	NC_010632	AAATA	2	10	139555	139564	80 %	20 %	0 %	0 %	186687169
93	NC_010632	TAATT	2	10	140920	140929	40 %	60 %	0 %	0 %	186687170
94	NC_010632	TTCGC	2	10	144157	144166	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_010632	GCAGA	2	10	146074	146083	40 %	0 %	40 %	20 %	186687173
96	NC_010632	AAGCC	2	10	146310	146319	40 %	0 %	20 %	40 %	186687173
97	NC_010632	GAACT	2	10	149126	149135	40 %	20 %	20 %	20 %	186687175
98	NC_010632	ACTCA	2	10	151460	151469	40 %	20 %	0 %	40 %	186687177
99	NC_010632	CAGTA	2	10	153141	153150	40 %	20 %	20 %	20 %	186687178
100	NC_010632	TTGGT	2	10	153257	153266	0 %	60 %	40 %	0 %	186687178
101	NC_010632	GTGTT	2	10	153611	153620	0 %	60 %	40 %	0 %	186687178
102	NC_010632	TCGGT	2	10	154514	154523	0 %	40 %	40 %	20 %	186687178
103	NC_010632	AAAAG	2	10	166354	166363	80 %	0 %	20 %	0 %	186687186
104	NC_010632	TATTT	2	10	166420	166429	20 %	80 %	0 %	0 %	186687186
105	NC_010632	TGATT	2	10	166820	166829	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010632	CGATG	2	10	171220	171229	20 %	20 %	40 %	20 %	186687192
107	NC_010632	AAGAA	2	10	176119	176128	80 %	0 %	20 %	0 %	186687196
108	NC_010632	CTTGC	2	10	177993	178002	0 %	40 %	20 %	40 %	186687197
109	NC_010632	CTTTA	2	10	179484	179493	20 %	60 %	0 %	20 %	186687198
110	NC_010632	CCAAG	2	10	181844	181853	40 %	0 %	20 %	40 %	186687199
111	NC_010632	CTAAA	2	10	183634	183643	60 %	20 %	0 %	20 %	186687200
112	NC_010632	CATTA	2	10	184919	184928	40 %	40 %	0 %	20 %	186687200
113	NC_010632	TTTCT	2	10	187057	187066	0 %	80 %	0 %	20 %	186687202
114	NC_010632	TTGAT	2	10	188636	188645	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010632	CTTAG	2	10	189281	189290	20 %	40 %	20 %	20 %	186687203
116	NC_010632	CGGGT	2	10	191290	191299	0 %	20 %	60 %	20 %	186687204
117	NC_010632	ATTAT	2	10	191799	191808	40 %	60 %	0 %	0 %	186687204
118	NC_010632	AATGA	2	10	193410	193419	60 %	20 %	20 %	0 %	186687204
119	NC_010632	GTTTC	2	10	194853	194862	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_010632	AAAAT	2	10	198234	198243	80 %	20 %	0 %	0 %	186687206
121	NC_010632	TTGAA	2	10	198275	198284	40 %	40 %	20 %	0 %	186687206
122	NC_010632	AACCA	2	10	198755	198764	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_010632	TTGCC	2	10	201379	201388	0 %	40 %	20 %	40 %	186687208
124	NC_010632	TCAAA	2	10	202390	202399	60 %	20 %	0 %	20 %	186687210
125	NC_010632	TACTC	2	10	202940	202949	20 %	40 %	0 %	40 %	186687210
126	NC_010632	GTAGT	2	10	203382	203391	20 %	40 %	40 %	0 %	186687210
127	NC_010632	TATCG	2	10	205139	205148	20 %	40 %	20 %	20 %	186687211
128	NC_010632	CTGAC	2	10	205213	205222	20 %	20 %	20 %	40 %	186687211
129	NC_010632	CCCGA	2	10	205272	205281	20 %	0 %	20 %	60 %	186687211
130	NC_010632	ATGGA	2	10	206481	206490	40 %	20 %	40 %	0 %	186687212
131	NC_010632	GCTCC	2	10	207094	207103	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
132	NC_010632	TGGGA	2	10	207436	207445	20 %	20 %	60 %	0 %	186687213
133	NC_010632	CTTTG	2	10	207564	207573	0 %	60 %	20 %	20 %	186687213
134	NC_010632	TAAAT	2	10	214050	214059	60 %	40 %	0 %	0 %	186687219
135	NC_010632	CTACA	2	10	217362	217371	40 %	20 %	0 %	40 %	186687220
136	NC_010632	GGTGA	2	10	218658	218667	20 %	20 %	60 %	0 %	186687221
137	NC_010632	GAAAA	2	10	218829	218838	80 %	0 %	20 %	0 %	186687221
138	NC_010632	TTTTA	2	10	220341	220350	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010632	CAAAA	2	10	222143	222152	80 %	0 %	0 %	20 %	186687226
140	NC_010632	GTGCT	2	10	223796	223805	0 %	40 %	40 %	20 %	186687227
141	NC_010632	AAGCA	2	10	225468	225477	60 %	0 %	20 %	20 %	186687229
142	NC_010632	TGAGT	2	10	227808	227817	20 %	40 %	40 %	0 %	186687231
143	NC_010632	CTGTT	2	10	227943	227952	0 %	60 %	20 %	20 %	186687231
144	NC_010632	AAAGT	2	10	228059	228068	60 %	20 %	20 %	0 %	186687231
145	NC_010632	CTAAA	2	10	229424	229433	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_010632	AGTTA	2	10	230396	230405	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010632	GATAG	2	10	232054	232063	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010632	AAGAA	2	10	233437	233446	80 %	0 %	20 %	0 %	186687233
149	NC_010632	GATAG	2	10	233704	233713	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010632	ATTCA	2	10	235231	235240	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_010632	TGAAT	2	10	235921	235930	40 %	40 %	20 %	0 %	186687236
152	NC_010632	TGGCG	2	10	237549	237558	0 %	20 %	60 %	20 %	186687237
153	NC_010632	CCACT	2	10	245171	245180	20 %	20 %	0 %	60 %	186687239
154	NC_010632	CCTAA	2	10	247353	247362	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
155	NC_010632	CCATA	2	10	247896	247905	40 %	20 %	0 %	40 %	186687241
156	NC_010632	AGGCG	2	10	248858	248867	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
157	NC_010632	GCTTT	2	10	249815	249824	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
158	NC_010632	TCCAT	2	10	250809	250818	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
159	NC_010632	ATTTC	2	10	251881	251890	20 %	60 %	0 %	20 %	186687244

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.