MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN02

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010632	TAAAA	2	10	128	137	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010632	AGTTG	2	10	2941	2950	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010632	ATTAA	2	10	10320	10329	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010632	ATTTA	2	10	11822	11831	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010632	TTTTG	2	10	24456	24465	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010632	AATAG	2	10	29412	29421	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010632	CAAAC	2	10	43072	43081	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_010632	TATTT	2	10	61638	61647	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010632	TGCGA	2	10	62652	62661	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_010632	TCGCT	2	10	62692	62701	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_010632	TTTAA	2	10	65350	65359	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010632	GCATG	2	10	66040	66049	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_010632	GTTCG	2	10	67248	67257	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_010632	ACTCA	2	10	67556	67565	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_010632	TCACT	2	10	70651	70660	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_010632	CAAAC	2	10	73619	73628	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_010632	ACACT	2	10	75252	75261	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_010632	CGAAC	2	10	75389	75398	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_010632	AATTT	2	10	76425	76434	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010632	CCTCT	2	10	77522	77531	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
21	NC_010632	TTTTA	2	10	79419	79428	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010632	TTTCT	2	10	79836	79845	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_010632	GAAAA	2	10	80422	80431	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010632	TTCGA	2	10	109756	109765	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_010632	AGAAA	2	10	118534	118543	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010632	CGGCA	2	10	125006	125015	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_010632	GACAT	2	10	125430	125439	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_010632	TTTAT	2	10	127080	127089	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010632	AGGAA	2	10	127907	127916	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010632	ACACA	2	10	135737	135746	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_010632	TTCGC	2	10	144157	144166	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_010632	TGATT	2	10	166820	166829	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010632	TTGAT	2	10	188636	188645	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010632	GTTTC	2	10	194853	194862	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_010632	AACCA	2	10	198755	198764	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_010632	GCTCC	2	10	207094	207103	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
37	NC_010632	TTTTA	2	10	220341	220350	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010632	CTAAA	2	10	229424	229433	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_010632	AGTTA	2	10	230396	230405	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010632	GATAG	2	10	232054	232063	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010632	GATAG	2	10	233704	233713	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010632	ATTCA	2	10	235231	235240	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_010632	CCTAA	2	10	247353	247362	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_010632	AGGCG	2	10	248858	248867	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
45	NC_010632	GCTTT	2	10	249815	249824	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_010632	TCCAT	2	10	250809	250818	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.